RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603949.1

SMC2-AS1-202, Transcript of SMC2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

Gene SMC2-AS1, Length 672 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ERCC6Q03468 1493 aa16.58■□□□□ 0.24
SMC2-AS1-202ENST00000603949 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.57■□□□□ 0.24
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MAP3K1Q13233 1512 aa16.56■□□□□ 0.24
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SMC2-AS1-202ENST00000603949 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SMC2-AS1-202ENST00000603949 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SMC2-AS1-202ENST00000603949 GRIN2BQ13224 1484 aa16.53■□□□□ 0.24
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ADAMTS12P58397 1594 aa16.51■□□□□ 0.23
SMC2-AS1-202ENST00000603949 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.23
SMC2-AS1-202ENST00000603949 SAMD9Q5K651 1589 aa16.47■□□□□ 0.23
SMC2-AS1-202ENST00000603949 FMN1Q68DA7 1419 aa16.45■□□□□ 0.22
SMC2-AS1-202ENST00000603949 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.45■□□□□ 0.22
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TIAM1Q13009 1591 aa16.45■□□□□ 0.22
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.44■□□□□ 0.22
SMC2-AS1-202ENST00000603949 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.41■□□□□ 0.22
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SMC2-AS1-202ENST00000603949 IQGAP2Q13576 1575 aa16.39■□□□□ 0.21
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SMC2-AS1-202ENST00000603949 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.36■□□□□ 0.21
SMC2-AS1-202ENST00000603949 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SMC2-AS1-202ENST00000603949 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.35■□□□□ 0.21
SMC2-AS1-202ENST00000603949 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.34■□□□□ 0.21
SMC2-AS1-202ENST00000603949 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.32■□□□□ 0.2
SMC2-AS1-202ENST00000603949 GRIN2AQ12879 1464 aa16.31■□□□□ 0.2
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SMC2-AS1-202ENST00000603949 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.3■□□□□ 0.2
SMC2-AS1-202ENST00000603949 SYNJ2O15056 1496 aa16.3■□□□□ 0.2
SMC2-AS1-202ENST00000603949 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.29■□□□□ 0.2
SMC2-AS1-202ENST00000603949 HECW1Q76N89 1606 aa16.27■□□□□ 0.19
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.26■□□□□ 0.19
SMC2-AS1-202ENST00000603949 P3H3Q8IVL6 736 aa16.26■□□□□ 0.19
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.26■□□□□ 0.19
SMC2-AS1-202ENST00000603949 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ADRA2BP18089 450 aa16.22■□□□□ 0.19
SMC2-AS1-202ENST00000603949 KIAA0556O60303 1618 aa16.22■□□□□ 0.19
SMC2-AS1-202ENST00000603949 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.21■□□□□ 0.19
SMC2-AS1-202ENST00000603949 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SMC2-AS1-202ENST00000603949 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SMC2-AS1-202ENST00000603949 NUP160Q12769 1436 aa16.18■□□□□ 0.18
SMC2-AS1-202ENST00000603949 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CEP170Q5SW79 1584 aa16.17■□□□□ 0.18
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.16■□□□□ 0.18
SMC2-AS1-202ENST00000603949 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.16■□□□□ 0.18
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.16■□□□□ 0.18
SMC2-AS1-202ENST00000603949 DISP1Q96F81 1524 aa16.14■□□□□ 0.18
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.14■□□□□ 0.17
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.13■□□□□ 0.17
SMC2-AS1-202ENST00000603949 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SMC2-AS1-202ENST00000603949 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC2-AS1-202ENST00000603949 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.08■□□□□ 0.16
SMC2-AS1-202ENST00000603949 NCOA2Q15596 1464 aa16.08■□□□□ 0.16
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ARHGEF11O15085 1522 aa16.07■□□□□ 0.16
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.06■□□□□ 0.16
SMC2-AS1-202ENST00000603949 FBLN2P98095 1184 aa16.04■□□□□ 0.16
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SMC2-AS1-202ENST00000603949 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.02■□□□□ 0.15
SMC2-AS1-202ENST00000603949 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MIA2Q96PC5 1412 aa16.01■□□□□ 0.15
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CHD1O14646 1710 aa16■□□□□ 0.15
SMC2-AS1-202ENST00000603949 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SMC2-AS1-202ENST00000603949 JPH4Q96JJ6 628 aa16■□□□□ 0.15
SMC2-AS1-202ENST00000603949 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.99■□□□□ 0.15
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.99■□□□□ 0.15
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SMC2-AS1-202ENST00000603949 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.96■□□□□ 0.15
SMC2-AS1-202ENST00000603949 SHROOM2Q13796 1616 aa15.95■□□□□ 0.14
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.95■□□□□ 0.14
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ITGAEP38570 1179 aa15.95■□□□□ 0.14
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ABCA8O94911 1581 aa15.95■□□□□ 0.14
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
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SMC2-AS1-202ENST00000603949 HFM1A2PYH4 1435 aa15.9■□□□□ 0.14
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.9■□□□□ 0.14
SMC2-AS1-202ENST00000603949 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.86■□□□□ 0.13
SMC2-AS1-202ENST00000603949 KIF14Q15058 1648 aa15.86■□□□□ 0.13
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PTPRGP23470 1445 aa15.85■□□□□ 0.13
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.84■□□□□ 0.13
SMC2-AS1-202ENST00000603949 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MAPKBP1O60336 1514 aa15.81■□□□□ 0.12
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.81■□□□□ 0.12
SMC2-AS1-202ENST00000603949 NAIPQ13075 1403 aa15.8■□□□□ 0.12
SMC2-AS1-202ENST00000603949 UACAQ9BZF9 1416 aa15.8■□□□□ 0.12
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ROCK1Q13464 1354 aa15.8■□□□□ 0.12
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.8■□□□□ 0.12
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MSH5O43196 834 aa15.8■□□□□ 0.12
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ATP10BO94823 1461 aa15.79■□□□□ 0.12
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PTPRKQ15262 1439 aa15.79■□□□□ 0.12
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