RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598481.1

TIMM44-206, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM44, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-206ENST00000598481 IGF1RP08069 1367 aa29.19■■■□□ 2.26
TIMM44-206ENST00000598481 CUL7Q14999 1698 aa29.15■■■□□ 2.26
TIMM44-206ENST00000598481 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.15■■■□□ 2.26
TIMM44-206ENST00000598481 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.03■■■□□ 2.24
TIMM44-206ENST00000598481 EEA1Q15075 1411 aa28.96■■■□□ 2.23
TIMM44-206ENST00000598481 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
TIMM44-206ENST00000598481 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.91■■■□□ 2.22
TIMM44-206ENST00000598481 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.9■■■□□ 2.22
TIMM44-206ENST00000598481 DIP2BQ9P265 1576 aa28.88■■■□□ 2.21
TIMM44-206ENST00000598481 MAPKBP1O60336 1514 aa28.88■■■□□ 2.21
TIMM44-206ENST00000598481 PRXQ9BXM0 1461 aa28.85■■■□□ 2.21
TIMM44-206ENST00000598481 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.85■■■□□ 2.21
TIMM44-206ENST00000598481 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.85■■■□□ 2.21
TIMM44-206ENST00000598481 JPH4Q96JJ6 628 aa28.84■■■□□ 2.21
TIMM44-206ENST00000598481 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
TIMM44-206ENST00000598481 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.79■■■□□ 2.2
TIMM44-206ENST00000598481 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.76■■■□□ 2.19
TIMM44-206ENST00000598481 TSPOAP1O95153 1857 aa28.72■■■□□ 2.19
TIMM44-206ENST00000598481 KDM6BO15054 1643 aa28.72■■■□□ 2.19
TIMM44-206ENST00000598481 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.7■■■□□ 2.18
TIMM44-206ENST00000598481 IQGAP2Q13576 1575 aa28.68■■■□□ 2.18
TIMM44-206ENST00000598481 KIF21BO75037 1637 aa28.65■■■□□ 2.18
TIMM44-206ENST00000598481 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.64■■■□□ 2.17
TIMM44-206ENST00000598481 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.59■■■□□ 2.17
TIMM44-206ENST00000598481 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
TIMM44-206ENST00000598481 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.53■■■□□ 2.16
TIMM44-206ENST00000598481 GOLGA3Q08378 1498 aa28.5■■■□□ 2.15
TIMM44-206ENST00000598481 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.48■■■□□ 2.15
TIMM44-206ENST00000598481 DISP1Q96F81 1524 aa28.43■■■□□ 2.14
TIMM44-206ENST00000598481 GLI2P10070 1586 aa28.42■■■□□ 2.14
TIMM44-206ENST00000598481 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.42■■■□□ 2.14
TIMM44-206ENST00000598481 KIAA0556O60303 1618 aa28.4■■■□□ 2.14
TIMM44-206ENST00000598481 ABCC2Q92887 1545 aa28.38■■■□□ 2.13
TIMM44-206ENST00000598481 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
TIMM44-206ENST00000598481 PTPRGP23470 1445 aa28.37■■■□□ 2.13
TIMM44-206ENST00000598481 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.37■■■□□ 2.13
TIMM44-206ENST00000598481 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
TIMM44-206ENST00000598481 ASXL2Q76L83 1435 aa28.33■■■□□ 2.13
TIMM44-206ENST00000598481 ADGRL1O94910 1474 aa28.31■■■□□ 2.12
TIMM44-206ENST00000598481 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
TIMM44-206ENST00000598481 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.3■■■□□ 2.12
TIMM44-206ENST00000598481 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.29■■■□□ 2.12
TIMM44-206ENST00000598481 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.29■■■□□ 2.12
TIMM44-206ENST00000598481 SAMD9Q5K651 1589 aa28.28■■■□□ 2.12
TIMM44-206ENST00000598481 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
TIMM44-206ENST00000598481 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TIMM44-206ENST00000598481 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.21■■■□□ 2.11
TIMM44-206ENST00000598481 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
TIMM44-206ENST00000598481 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.19■■■□□ 2.1
TIMM44-206ENST00000598481 UACAQ9BZF9 1416 aa28.18■■■□□ 2.1
TIMM44-206ENST00000598481 P3H3Q8IVL6 736 aa28.18■■■□□ 2.1
TIMM44-206ENST00000598481 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
TIMM44-206ENST00000598481 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.17■■■□□ 2.1
TIMM44-206ENST00000598481 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.11■■■□□ 2.09
TIMM44-206ENST00000598481 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.08■■■□□ 2.09
TIMM44-206ENST00000598481 ABCA8O94911 1581 aa28.07■■■□□ 2.08
TIMM44-206ENST00000598481 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.06■■■□□ 2.08
TIMM44-206ENST00000598481 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.98■■■□□ 2.07
TIMM44-206ENST00000598481 CLIP1P30622 1438 aa27.98■■■□□ 2.07
TIMM44-206ENST00000598481 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.97■■■□□ 2.07
TIMM44-206ENST00000598481 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.95■■■□□ 2.07
TIMM44-206ENST00000598481 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.95■■■□□ 2.07
TIMM44-206ENST00000598481 FMN1Q68DA7 1419 aa27.92■■■□□ 2.06
TIMM44-206ENST00000598481 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.9■■■□□ 2.06
TIMM44-206ENST00000598481 CEP162Q5TB80 1403 aa27.9■■■□□ 2.06
TIMM44-206ENST00000598481 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TIMM44-206ENST00000598481 ATP10BO94823 1461 aa27.83■■■□□ 2.04
TIMM44-206ENST00000598481 ARID3CA6NKF2 412 aa27.82■■■□□ 2.04
TIMM44-206ENST00000598481 CD109Q6YHK3 1445 aa27.81■■■□□ 2.04
TIMM44-206ENST00000598481 HECW1Q76N89 1606 aa27.79■■■□□ 2.04
TIMM44-206ENST00000598481 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
TIMM44-206ENST00000598481 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.73■■■□□ 2.03
TIMM44-206ENST00000598481 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
TIMM44-206ENST00000598481 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
TIMM44-206ENST00000598481 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
TIMM44-206ENST00000598481 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.72■■■□□ 2.03
TIMM44-206ENST00000598481 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.72■■■□□ 2.03
TIMM44-206ENST00000598481 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
TIMM44-206ENST00000598481 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.69■■■□□ 2.02
TIMM44-206ENST00000598481 KCNH8Q96L42 1107 aa27.66■■■□□ 2.02
TIMM44-206ENST00000598481 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.62■■■□□ 2.01
TIMM44-206ENST00000598481 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.62■■■□□ 2.01
TIMM44-206ENST00000598481 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.62■■■□□ 2.01
TIMM44-206ENST00000598481 PTPRMP28827 1452 aa27.59■■■□□ 2.01
TIMM44-206ENST00000598481 FBXO41Q8TF61 875 aa27.59■■■□□ 2.01
TIMM44-206ENST00000598481 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.58■■■□□ 2.01
TIMM44-206ENST00000598481 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.56■■■□□ 2
TIMM44-206ENST00000598481 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.56■■■□□ 2
TIMM44-206ENST00000598481 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.56■■■□□ 2
TIMM44-206ENST00000598481 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
TIMM44-206ENST00000598481 MADDQ8WXG6 1647 aa27.5■■□□□ 1.99
TIMM44-206ENST00000598481 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
TIMM44-206ENST00000598481 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.47■■□□□ 1.99
TIMM44-206ENST00000598481 NEO1Q92859 1461 aa27.44■■□□□ 1.98
TIMM44-206ENST00000598481 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.44■■□□□ 1.98
TIMM44-206ENST00000598481 KIF14Q15058 1648 aa27.42■■□□□ 1.98
TIMM44-206ENST00000598481 RAPGEF3O95398 923 aa27.42■■□□□ 1.98
TIMM44-206ENST00000598481 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.41■■□□□ 1.98
TIMM44-206ENST00000598481 RICTORQ6R327 1708 aa27.4■■□□□ 1.98
TIMM44-206ENST00000598481 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms