RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597965.2

PNKP-210, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 5

Gene PNKP, Length 351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-210ENST00000597965 KIF27Q86VH2 1401 aa29.81■■■□□ 2.36
PNKP-210ENST00000597965 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.77■■■□□ 2.36
PNKP-210ENST00000597965 CUL7Q14999 1698 aa29.76■■■□□ 2.36
PNKP-210ENST00000597965 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.74■■■□□ 2.35
PNKP-210ENST00000597965 IGF1RP08069 1367 aa29.74■■■□□ 2.35
PNKP-210ENST00000597965 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.69■■■□□ 2.34
PNKP-210ENST00000597965 MAPKBP1O60336 1514 aa29.64■■■□□ 2.34
PNKP-210ENST00000597965 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.61■■■□□ 2.33
PNKP-210ENST00000597965 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.59■■■□□ 2.33
PNKP-210ENST00000597965 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.57■■■□□ 2.32
PNKP-210ENST00000597965 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.57■■■□□ 2.32
PNKP-210ENST00000597965 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.51■■■□□ 2.31
PNKP-210ENST00000597965 DIP2BQ9P265 1576 aa29.5■■■□□ 2.31
PNKP-210ENST00000597965 PTPRGP23470 1445 aa29.48■■■□□ 2.31
PNKP-210ENST00000597965 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.43■■■□□ 2.3
PNKP-210ENST00000597965 IQGAP2Q13576 1575 aa29.42■■■□□ 2.3
PNKP-210ENST00000597965 ABCC2Q92887 1545 aa29.35■■■□□ 2.29
PNKP-210ENST00000597965 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
PNKP-210ENST00000597965 KDM6BO15054 1643 aa29.31■■■□□ 2.28
PNKP-210ENST00000597965 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.3■■■□□ 2.28
PNKP-210ENST00000597965 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.29■■■□□ 2.28
PNKP-210ENST00000597965 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.29■■■□□ 2.28
PNKP-210ENST00000597965 TSPOAP1O95153 1857 aa29.28■■■□□ 2.28
PNKP-210ENST00000597965 UACAQ9BZF9 1416 aa29.25■■■□□ 2.27
PNKP-210ENST00000597965 DISP1Q96F81 1524 aa29.23■■■□□ 2.27
PNKP-210ENST00000597965 ASXL2Q76L83 1435 aa29.22■■■□□ 2.27
PNKP-210ENST00000597965 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.22■■■□□ 2.27
PNKP-210ENST00000597965 GLI2P10070 1586 aa29.2■■■□□ 2.26
PNKP-210ENST00000597965 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.14■■■□□ 2.25
PNKP-210ENST00000597965 KIAA0556O60303 1618 aa29.12■■■□□ 2.25
PNKP-210ENST00000597965 GOLGA3Q08378 1498 aa29.06■■■□□ 2.24
PNKP-210ENST00000597965 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.05■■■□□ 2.24
PNKP-210ENST00000597965 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PNKP-210ENST00000597965 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PNKP-210ENST00000597965 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.04■■■□□ 2.24
PNKP-210ENST00000597965 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
PNKP-210ENST00000597965 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29■■■□□ 2.23
PNKP-210ENST00000597965 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29■■■□□ 2.23
PNKP-210ENST00000597965 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
PNKP-210ENST00000597965 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.95■■■□□ 2.22
PNKP-210ENST00000597965 PRXQ9BXM0 1461 aa28.93■■■□□ 2.22
PNKP-210ENST00000597965 ABCA8O94911 1581 aa28.85■■■□□ 2.21
PNKP-210ENST00000597965 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
PNKP-210ENST00000597965 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.81■■■□□ 2.2
PNKP-210ENST00000597965 CD109Q6YHK3 1445 aa28.79■■■□□ 2.2
PNKP-210ENST00000597965 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.79■■■□□ 2.2
PNKP-210ENST00000597965 ADGRL1O94910 1474 aa28.78■■■□□ 2.2
PNKP-210ENST00000597965 KCNH8Q96L42 1107 aa28.77■■■□□ 2.2
PNKP-210ENST00000597965 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.71■■■□□ 2.19
PNKP-210ENST00000597965 EEA1Q15075 1411 aa28.64■■■□□ 2.18
PNKP-210ENST00000597965 P3H3Q8IVL6 736 aa28.63■■■□□ 2.17
PNKP-210ENST00000597965 ATP10BO94823 1461 aa28.61■■■□□ 2.17
PNKP-210ENST00000597965 SAMD9Q5K651 1589 aa28.61■■■□□ 2.17
PNKP-210ENST00000597965 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.61■■■□□ 2.17
PNKP-210ENST00000597965 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.57■■■□□ 2.16
PNKP-210ENST00000597965 ARID3CA6NKF2 412 aa28.55■■■□□ 2.16
PNKP-210ENST00000597965 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.54■■■□□ 2.16
PNKP-210ENST00000597965 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.54■■■□□ 2.16
PNKP-210ENST00000597965 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
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PNKP-210ENST00000597965 NEO1Q92859 1461 aa28.45■■■□□ 2.14
PNKP-210ENST00000597965 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.42■■■□□ 2.14
PNKP-210ENST00000597965 KIF21BO75037 1637 aa28.41■■■□□ 2.14
PNKP-210ENST00000597965 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
PNKP-210ENST00000597965 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.38■■■□□ 2.13
PNKP-210ENST00000597965 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
PNKP-210ENST00000597965 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.38■■■□□ 2.13
PNKP-210ENST00000597965 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.37■■■□□ 2.13
PNKP-210ENST00000597965 RAPGEF3O95398 923 aa28.33■■■□□ 2.13
PNKP-210ENST00000597965 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.27■■■□□ 2.12
PNKP-210ENST00000597965 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PNKP-210ENST00000597965 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
PNKP-210ENST00000597965 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.22■■■□□ 2.11
PNKP-210ENST00000597965 FANCAO15360 1455 aa28.21■■■□□ 2.11
PNKP-210ENST00000597965 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PNKP-210ENST00000597965 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.21■■■□□ 2.11
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PNKP-210ENST00000597965 PTPRMP28827 1452 aa28.2■■■□□ 2.1
PNKP-210ENST00000597965 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
PNKP-210ENST00000597965 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.16■■■□□ 2.1
PNKP-210ENST00000597965 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PNKP-210ENST00000597965 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.15■■■□□ 2.1
PNKP-210ENST00000597965 FMN1Q68DA7 1419 aa28.15■■■□□ 2.1
PNKP-210ENST00000597965 RICTORQ6R327 1708 aa28.15■■■□□ 2.1
PNKP-210ENST00000597965 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
PNKP-210ENST00000597965 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.11■■■□□ 2.09
PNKP-210ENST00000597965 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.1■■■□□ 2.09
PNKP-210ENST00000597965 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.09■■■□□ 2.09
PNKP-210ENST00000597965 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PNKP-210ENST00000597965 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.08■■■□□ 2.09
PNKP-210ENST00000597965 HECW1Q76N89 1606 aa28.08■■■□□ 2.09
PNKP-210ENST00000597965 MADDQ8WXG6 1647 aa28.07■■■□□ 2.08
PNKP-210ENST00000597965 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PNKP-210ENST00000597965 PLCH2O75038 1416 aa28.06■■■□□ 2.08
PNKP-210ENST00000597965 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.03■■■□□ 2.08
PNKP-210ENST00000597965 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28■■■□□ 2.07
PNKP-210ENST00000597965 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28■■■□□ 2.07
PNKP-210ENST00000597965 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.99■■■□□ 2.07
PNKP-210ENST00000597965 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
PNKP-210ENST00000597965 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.98■■■□□ 2.07
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