RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591709.1

POLR2E-208, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 685 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-208ENST00000591709 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.58■■■□□ 2.49
POLR2E-208ENST00000591709 TSPOAP1O95153 1857 aa30.58■■■□□ 2.49
POLR2E-208ENST00000591709 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.57■■■□□ 2.48
POLR2E-208ENST00000591709 MAPKBP1O60336 1514 aa30.57■■■□□ 2.48
POLR2E-208ENST00000591709 JPH4Q96JJ6 628 aa30.53■■■□□ 2.48
POLR2E-208ENST00000591709 KDM6BO15054 1643 aa30.52■■■□□ 2.48
POLR2E-208ENST00000591709 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.52■■■□□ 2.48
POLR2E-208ENST00000591709 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
POLR2E-208ENST00000591709 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.43■■■□□ 2.46
POLR2E-208ENST00000591709 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.32■■■□□ 2.44
POLR2E-208ENST00000591709 CUL7Q14999 1698 aa30.28■■■□□ 2.44
POLR2E-208ENST00000591709 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.27■■■□□ 2.44
POLR2E-208ENST00000591709 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
POLR2E-208ENST00000591709 IGF1RP08069 1367 aa30.09■■■□□ 2.41
POLR2E-208ENST00000591709 PTPRGP23470 1445 aa30.09■■■□□ 2.41
POLR2E-208ENST00000591709 ABCC2Q92887 1545 aa30.08■■■□□ 2.41
POLR2E-208ENST00000591709 KIF27Q86VH2 1401 aa30.08■■■□□ 2.41
POLR2E-208ENST00000591709 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
POLR2E-208ENST00000591709 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
POLR2E-208ENST00000591709 GLI2P10070 1586 aa30.06■■■□□ 2.4
POLR2E-208ENST00000591709 ADGRL1O94910 1474 aa30.05■■■□□ 2.4
POLR2E-208ENST00000591709 ASXL2Q76L83 1435 aa30.04■■■□□ 2.4
POLR2E-208ENST00000591709 IQGAP2Q13576 1575 aa30.01■■■□□ 2.39
POLR2E-208ENST00000591709 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.99■■■□□ 2.39
POLR2E-208ENST00000591709 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.99■■■□□ 2.39
POLR2E-208ENST00000591709 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.98■■■□□ 2.39
POLR2E-208ENST00000591709 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.97■■■□□ 2.39
POLR2E-208ENST00000591709 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.93■■■□□ 2.38
POLR2E-208ENST00000591709 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.91■■■□□ 2.38
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POLR2E-208ENST00000591709 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
POLR2E-208ENST00000591709 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
POLR2E-208ENST00000591709 UACAQ9BZF9 1416 aa29.87■■■□□ 2.37
POLR2E-208ENST00000591709 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
POLR2E-208ENST00000591709 DISP1Q96F81 1524 aa29.85■■■□□ 2.37
POLR2E-208ENST00000591709 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.82■■■□□ 2.36
POLR2E-208ENST00000591709 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.81■■■□□ 2.36
POLR2E-208ENST00000591709 KIAA0556O60303 1618 aa29.77■■■□□ 2.36
POLR2E-208ENST00000591709 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.73■■■□□ 2.35
POLR2E-208ENST00000591709 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.66■■■□□ 2.34
POLR2E-208ENST00000591709 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.66■■■□□ 2.34
POLR2E-208ENST00000591709 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.66■■■□□ 2.34
POLR2E-208ENST00000591709 KIF21BO75037 1637 aa29.61■■■□□ 2.33
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POLR2E-208ENST00000591709 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.52■■■□□ 2.32
POLR2E-208ENST00000591709 CD109Q6YHK3 1445 aa29.49■■■□□ 2.31
POLR2E-208ENST00000591709 ABCA8O94911 1581 aa29.48■■■□□ 2.31
POLR2E-208ENST00000591709 KCNH8Q96L42 1107 aa29.4■■■□□ 2.3
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POLR2E-208ENST00000591709 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.33■■■□□ 2.29
POLR2E-208ENST00000591709 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.31■■■□□ 2.28
POLR2E-208ENST00000591709 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.26■■■□□ 2.27
POLR2E-208ENST00000591709 FBXO41Q8TF61 875 aa29.25■■■□□ 2.27
POLR2E-208ENST00000591709 PTPRMP28827 1452 aa29.24■■■□□ 2.27
POLR2E-208ENST00000591709 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.23■■■□□ 2.27
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POLR2E-208ENST00000591709 MADDQ8WXG6 1647 aa29.2■■■□□ 2.27
POLR2E-208ENST00000591709 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.17■■■□□ 2.26
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POLR2E-208ENST00000591709 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.08■■■□□ 2.25
POLR2E-208ENST00000591709 NEO1Q92859 1461 aa29.08■■■□□ 2.25
POLR2E-208ENST00000591709 RAPGEF3O95398 923 aa29.07■■■□□ 2.24
POLR2E-208ENST00000591709 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.07■■■□□ 2.24
POLR2E-208ENST00000591709 SAMD9Q5K651 1589 aa29.06■■■□□ 2.24
POLR2E-208ENST00000591709 P3H3Q8IVL6 736 aa29.06■■■□□ 2.24
POLR2E-208ENST00000591709 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.04■■■□□ 2.24
POLR2E-208ENST00000591709 RICTORQ6R327 1708 aa29.04■■■□□ 2.24
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POLR2E-208ENST00000591709 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.92■■■□□ 2.22
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POLR2E-208ENST00000591709 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
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POLR2E-208ENST00000591709 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.84■■■□□ 2.21
POLR2E-208ENST00000591709 HSPA2P54652 639 aa28.83■■■□□ 2.21
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POLR2E-208ENST00000591709 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.82■■■□□ 2.2
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POLR2E-208ENST00000591709 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.75■■■□□ 2.19
POLR2E-208ENST00000591709 HECW1Q76N89 1606 aa28.73■■■□□ 2.19
POLR2E-208ENST00000591709 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.71■■■□□ 2.19
POLR2E-208ENST00000591709 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
POLR2E-208ENST00000591709 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.68■■■□□ 2.18
POLR2E-208ENST00000591709 CERKQ8TCT0 537 aa28.66■■■□□ 2.18
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POLR2E-208ENST00000591709 MLECQ14165 292 aa28.65■■■□□ 2.18
POLR2E-208ENST00000591709 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.65■■■□□ 2.18
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