RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591152.5

PSME3-211, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene PSME3, Length 1,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-211ENST00000591152 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.69■■■■□ 3.62
PSME3-211ENST00000591152 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.67■■■■□ 3.62
PSME3-211ENST00000591152 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.64■■■■□ 3.62
PSME3-211ENST00000591152 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.51■■■■□ 3.6
PSME3-211ENST00000591152 MAPKBP1O60336 1514 aa37.5■■■■□ 3.59
PSME3-211ENST00000591152 DIP2BQ9P265 1576 aa37.5■■■■□ 3.59
PSME3-211ENST00000591152 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.49■■■■□ 3.59
PSME3-211ENST00000591152 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.45■■■■□ 3.59
PSME3-211ENST00000591152 KDM6BO15054 1643 aa37.42■■■■□ 3.58
PSME3-211ENST00000591152 TSPOAP1O95153 1857 aa37.36■■■■□ 3.57
PSME3-211ENST00000591152 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
PSME3-211ENST00000591152 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
PSME3-211ENST00000591152 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.24■■■■□ 3.55
PSME3-211ENST00000591152 PTPRGP23470 1445 aa37.13■■■■□ 3.53
PSME3-211ENST00000591152 IGF1RP08069 1367 aa37.13■■■■□ 3.53
PSME3-211ENST00000591152 KIF27Q86VH2 1401 aa37.02■■■■□ 3.52
PSME3-211ENST00000591152 CUL7Q14999 1698 aa36.99■■■■□ 3.51
PSME3-211ENST00000591152 ASXL2Q76L83 1435 aa36.99■■■■□ 3.51
PSME3-211ENST00000591152 ABCC2Q92887 1545 aa36.97■■■■□ 3.51
PSME3-211ENST00000591152 ADGRL1O94910 1474 aa36.96■■■■□ 3.51
PSME3-211ENST00000591152 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.95■■■■□ 3.51
PSME3-211ENST00000591152 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.93■■■■□ 3.5
PSME3-211ENST00000591152 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.92■■■■□ 3.5
PSME3-211ENST00000591152 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
PSME3-211ENST00000591152 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.88■■■■□ 3.49
PSME3-211ENST00000591152 GLI2P10070 1586 aa36.87■■■■□ 3.49
PSME3-211ENST00000591152 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.49
PSME3-211ENST00000591152 UACAQ9BZF9 1416 aa36.78■■■■□ 3.48
PSME3-211ENST00000591152 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.77■■■■□ 3.48
PSME3-211ENST00000591152 IQGAP2Q13576 1575 aa36.75■■■■□ 3.47
PSME3-211ENST00000591152 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
PSME3-211ENST00000591152 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.7■■■■□ 3.46
PSME3-211ENST00000591152 DISP1Q96F81 1524 aa36.68■■■■□ 3.46
PSME3-211ENST00000591152 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.67■■■■□ 3.46
PSME3-211ENST00000591152 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.64■■■■□ 3.46
PSME3-211ENST00000591152 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.64■■■■□ 3.46
PSME3-211ENST00000591152 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
PSME3-211ENST00000591152 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.47■■■■□ 3.43
PSME3-211ENST00000591152 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.45■■■■□ 3.43
PSME3-211ENST00000591152 KIAA0556O60303 1618 aa36.44■■■■□ 3.42
PSME3-211ENST00000591152 KCNH8Q96L42 1107 aa36.41■■■■□ 3.42
PSME3-211ENST00000591152 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.4■■■■□ 3.42
PSME3-211ENST00000591152 CD109Q6YHK3 1445 aa36.36■■■■□ 3.41
PSME3-211ENST00000591152 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.29■■■■□ 3.4
PSME3-211ENST00000591152 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.24■■■■□ 3.39
PSME3-211ENST00000591152 KIF21BO75037 1637 aa36.22■■■■□ 3.39
PSME3-211ENST00000591152 FBXO41Q8TF61 875 aa36.19■■■■□ 3.38
PSME3-211ENST00000591152 ABCA8O94911 1581 aa36.15■■■■□ 3.38
PSME3-211ENST00000591152 ARID3CA6NKF2 412 aa36.13■■■■□ 3.37
PSME3-211ENST00000591152 GOLGA3Q08378 1498 aa36.11■■■■□ 3.37
PSME3-211ENST00000591152 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.09■■■■□ 3.37
PSME3-211ENST00000591152 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.03■■■■□ 3.36
PSME3-211ENST00000591152 PTPRMP28827 1452 aa36■■■■□ 3.35
PSME3-211ENST00000591152 RAPGEF3O95398 923 aa35.96■■■■□ 3.35
PSME3-211ENST00000591152 P3H3Q8IVL6 736 aa35.96■■■■□ 3.35
PSME3-211ENST00000591152 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.92■■■■□ 3.34
PSME3-211ENST00000591152 ATP10BO94823 1461 aa35.91■■■■□ 3.34
PSME3-211ENST00000591152 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
PSME3-211ENST00000591152 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
PSME3-211ENST00000591152 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.85■■■■□ 3.33
PSME3-211ENST00000591152 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.82■■■■□ 3.32
PSME3-211ENST00000591152 PRXQ9BXM0 1461 aa35.8■■■■□ 3.32
PSME3-211ENST00000591152 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
PSME3-211ENST00000591152 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
PSME3-211ENST00000591152 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
PSME3-211ENST00000591152 MADDQ8WXG6 1647 aa35.77■■■■□ 3.32
PSME3-211ENST00000591152 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.76■■■■□ 3.31
PSME3-211ENST00000591152 NEO1Q92859 1461 aa35.74■■■■□ 3.31
PSME3-211ENST00000591152 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.73■■■■□ 3.31
PSME3-211ENST00000591152 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.72■■■■□ 3.31
PSME3-211ENST00000591152 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.7■■■■□ 3.31
PSME3-211ENST00000591152 HSPA2P54652 639 aa35.67■■■■□ 3.3
PSME3-211ENST00000591152 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
PSME3-211ENST00000591152 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.61■■■■□ 3.29
PSME3-211ENST00000591152 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
PSME3-211ENST00000591152 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
PSME3-211ENST00000591152 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.54■■■■□ 3.28
PSME3-211ENST00000591152 SAMD9Q5K651 1589 aa35.54■■■■□ 3.28
PSME3-211ENST00000591152 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
PSME3-211ENST00000591152 AKNAQ7Z591 1439 aa35.49■■■■□ 3.27
PSME3-211ENST00000591152 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.47■■■■□ 3.27
PSME3-211ENST00000591152 CERKQ8TCT0 537 aa35.47■■■■□ 3.27
PSME3-211ENST00000591152 RICTORQ6R327 1708 aa35.46■■■■□ 3.27
PSME3-211ENST00000591152 MLECQ14165 292 aa35.46■■■■□ 3.27
PSME3-211ENST00000591152 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.44■■■■□ 3.26
PSME3-211ENST00000591152 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.43■■■■□ 3.26
PSME3-211ENST00000591152 FANCAO15360 1455 aa35.42■■■■□ 3.26
PSME3-211ENST00000591152 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.4■■■■□ 3.26
PSME3-211ENST00000591152 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.4■■■■□ 3.26
PSME3-211ENST00000591152 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.37■■■■□ 3.25
PSME3-211ENST00000591152 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.36■■■■□ 3.25
PSME3-211ENST00000591152 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.34■■■■□ 3.25
PSME3-211ENST00000591152 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.33■■■■□ 3.25
PSME3-211ENST00000591152 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.31■■■■□ 3.24
PSME3-211ENST00000591152 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.3■■■■□ 3.24
PSME3-211ENST00000591152 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.29■■■■□ 3.24
PSME3-211ENST00000591152 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.25■■■■□ 3.23
PSME3-211ENST00000591152 HECW1Q76N89 1606 aa35.24■■■■□ 3.23
PSME3-211ENST00000591152 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.23■■■■□ 3.23
PSME3-211ENST00000591152 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.8 ms