RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589266.5

CIRBP-223, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 3

Gene CIRBP, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-223	ENST00000589266	JPH4	Q96JJ6	628 aa		41.92	■■■■■ 4.3
CIRBP-223	ENST00000589266	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	41.78	■■■■■ 4.28
CIRBP-223	ENST00000589266	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		41.78	■■■■■ 4.28
CIRBP-223	ENST00000589266	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		41.72	■■■■■ 4.27
CIRBP-223	ENST00000589266	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.71	■■■■■ 4.27
CIRBP-223	ENST00000589266	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.66	■■■■■ 4.26
CIRBP-223	ENST00000589266	MAPKBP1	O60336	1514 aa		41.64	■■■■■ 4.26
CIRBP-223	ENST00000589266	EEA1	Q15075	1411 aa		41.64	■■■■■ 4.26
CIRBP-223	ENST00000589266	DIP2B	Q9P265	1576 aa		41.55	■■■■■ 4.24
CIRBP-223	ENST00000589266	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		41.53	■■■■■ 4.24
CIRBP-223	ENST00000589266	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		41.44	■■■■■ 4.22
CIRBP-223	ENST00000589266	KDM6B	O15054	1643 aa		41.42	■■■■■ 4.22
CIRBP-223	ENST00000589266	IGF1R	P08069	1367 aa		41.39	■■■■■ 4.22
CIRBP-223	ENST00000589266	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		41.38	■■■■■ 4.21
CIRBP-223	ENST00000589266	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.34	■■■■■ 4.21
CIRBP-223	ENST00000589266	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.34	■■■■■ 4.21
CIRBP-223	ENST00000589266	CUL7	Q14999	1698 aa		41.26	■■■■■ 4.2
CIRBP-223	ENST00000589266	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	41.26	■■■■■ 4.2
CIRBP-223	ENST00000589266	PTPRG	P23470	1445 aa		41.23	■■■■■ 4.19
CIRBP-223	ENST00000589266	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		41.17	■■■■■ 4.18
CIRBP-223	ENST00000589266	PRX	Q9BXM0	1461 aa		41.15	■■■■■ 4.18
CIRBP-223	ENST00000589266	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	41.14	■■■■■ 4.18
CIRBP-223	ENST00000589266	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		41.09	■■■■■ 4.17
CIRBP-223	ENST00000589266	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		41.08	■■■■■ 4.17
CIRBP-223	ENST00000589266	ABCC2	Q92887	1545 aa		41.08	■■■■■ 4.17
CIRBP-223	ENST00000589266	KIF21B	O75037	1637 aa		41.07	■■■■■ 4.16
CIRBP-223	ENST00000589266	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		41.05	■■■■■ 4.16
CIRBP-223	ENST00000589266	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		41.02	■■■■■ 4.16
CIRBP-223	ENST00000589266	ASXL2	Q76L83	1435 aa		41.01	■■■■■ 4.16
CIRBP-223	ENST00000589266	GLI2	P10070	1586 aa		40.98	■■■■■ 4.15
CIRBP-223	ENST00000589266	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	40.92	■■■■■ 4.14
CIRBP-223	ENST00000589266	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		40.91	■■■■■ 4.14
CIRBP-223	ENST00000589266	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	40.9	■■■■■ 4.14
CIRBP-223	ENST00000589266	IQGAP2	Q13576	1575 aa		40.9	■■■■■ 4.14
CIRBP-223	ENST00000589266	GOLGA3	Q08378	1498 aa		40.89	■■■■■ 4.14
CIRBP-223	ENST00000589266	UACA	Q9BZF9	1416 aa		40.87	■■■■■ 4.13
CIRBP-223	ENST00000589266	ADGRL1	O94910	1474 aa		40.83	■■■■■ 4.13
CIRBP-223	ENST00000589266	DISP1	Q96F81	1524 aa		40.77	■■■■■ 4.12
CIRBP-223	ENST00000589266	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	40.75	■■■■■ 4.11
CIRBP-223	ENST00000589266	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	40.75	■■■■■ 4.11
CIRBP-223	ENST00000589266	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		40.73	■■■■■ 4.11
CIRBP-223	ENST00000589266	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		40.7	■■■■■ 4.11
CIRBP-223	ENST00000589266	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		40.7	■■■■■ 4.11
CIRBP-223	ENST00000589266	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
CIRBP-223	ENST00000589266	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		40.62	■■■■■ 4.09
CIRBP-223	ENST00000589266	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	40.61	■■■■■ 4.09
CIRBP-223	ENST00000589266	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		40.59	■■■■■ 4.09
CIRBP-223	ENST00000589266	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		40.58	■■■■■ 4.09
CIRBP-223	ENST00000589266	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		40.54	■■■■■ 4.08
CIRBP-223	ENST00000589266	KIAA0556	O60303	1618 aa		40.53	■■■■■ 4.08
CIRBP-223	ENST00000589266	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		40.5	■■■■■ 4.07
CIRBP-223	ENST00000589266	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CIRBP-223	ENST00000589266	CD109	Q6YHK3	1445 aa		40.35	■■■■■ 4.05
CIRBP-223	ENST00000589266	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CIRBP-223	ENST00000589266	KCNH8	Q96L42	1107 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CIRBP-223	ENST00000589266	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		40.29	■■■■■ 4.04
CIRBP-223	ENST00000589266	ABCA8	O94911	1581 aa		40.22	■■■■■ 4.03
CIRBP-223	ENST00000589266	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		40.19	■■■■■ 4.02
CIRBP-223	ENST00000589266	CEP162	Q5TB80	1403 aa		40.18	■■■■■ 4.02
CIRBP-223	ENST00000589266	CLIP1	P30622	1438 aa		40.15	■■■■■ 4.02
CIRBP-223	ENST00000589266	SAMD9	Q5K651	1589 aa		40.14	■■■■■ 4.02
CIRBP-223	ENST00000589266	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40.06	■■■■■ 4
CIRBP-223	ENST00000589266	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		40.05	■■■■■ 4
CIRBP-223	ENST00000589266	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	40.04	■■■■■ 4
CIRBP-223	ENST00000589266	ARID3C	A6NKF2	412 aa		39.95	■■■■□ 3.99
CIRBP-223	ENST00000589266	FBXO41	Q8TF61	875 aa		39.93	■■■■□ 3.98
CIRBP-223	ENST00000589266	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		39.93	■■■■□ 3.98
CIRBP-223	ENST00000589266	ATP10B	O94823	1461 aa		39.92	■■■■□ 3.98
CIRBP-223	ENST00000589266	P3H3	Q8IVL6	736 aa		39.87	■■■■□ 3.97
CIRBP-223	ENST00000589266	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		39.87	■■■■□ 3.97
CIRBP-223	ENST00000589266	PTPRM	P28827	1452 aa		39.85	■■■■□ 3.97
CIRBP-223	ENST00000589266	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		39.83	■■■■□ 3.97
CIRBP-223	ENST00000589266	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		39.83	■■■■□ 3.97
CIRBP-223	ENST00000589266	RAPGEF3	O95398	923 aa		39.82	■■■■□ 3.97
CIRBP-223	ENST00000589266	FMN1	Q68DA7	1419 aa		39.8	■■■■□ 3.96
CIRBP-223	ENST00000589266	NEO1	Q92859	1461 aa		39.75	■■■■□ 3.95
CIRBP-223	ENST00000589266	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	39.69	■■■■□ 3.94
CIRBP-223	ENST00000589266	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	39.69	■■■■□ 3.94
CIRBP-223	ENST00000589266	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	39.69	■■■■□ 3.94
CIRBP-223	ENST00000589266	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		39.68	■■■■□ 3.94
CIRBP-223	ENST00000589266	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		39.66	■■■■□ 3.94
CIRBP-223	ENST00000589266	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		39.64	■■■■□ 3.94
CIRBP-223	ENST00000589266	MADD	Q8WXG6	1647 aa		39.6	■■■■□ 3.93
CIRBP-223	ENST00000589266	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	39.59	■■■■□ 3.93
CIRBP-223	ENST00000589266	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		39.59	■■■■□ 3.93
CIRBP-223	ENST00000589266	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		39.57	■■■■□ 3.93
CIRBP-223	ENST00000589266	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		39.53	■■■■□ 3.92
CIRBP-223	ENST00000589266	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		39.53	■■■■□ 3.92
CIRBP-223	ENST00000589266	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	39.49	■■■■□ 3.91
CIRBP-223	ENST00000589266	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	39.48	■■■■□ 3.91
CIRBP-223	ENST00000589266	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		39.46	■■■■□ 3.91
CIRBP-223	ENST00000589266	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		39.46	■■■■□ 3.91
CIRBP-223	ENST00000589266	HECW1	Q76N89	1606 aa		39.46	■■■■□ 3.91
CIRBP-223	ENST00000589266	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	39.44	■■■■□ 3.9
CIRBP-223	ENST00000589266	AKNA	Q7Z591	1439 aa		39.42	■■■■□ 3.9
CIRBP-223	ENST00000589266	RICTOR	Q6R327	1708 aa		39.4	■■■■□ 3.9
CIRBP-223	ENST00000589266	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		39.37	■■■■□ 3.89
CIRBP-223	ENST00000589266	FANCA	O15360	1455 aa		39.36	■■■■□ 3.89
CIRBP-223	ENST00000589266	HSPA2	P54652	639 aa		39.34	■■■■□ 3.89
CIRBP-223	ENST00000589266	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		39.34	■■■■□ 3.89

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