RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589266.5

CIRBP-223, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene CIRBP, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-223ENST00000589266 JPH4Q96JJ6 628 aa41.92■■■■■ 4.3
CIRBP-223ENST00000589266 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.78■■■■■ 4.28
CIRBP-223ENST00000589266 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.78■■■■■ 4.28
CIRBP-223ENST00000589266 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.72■■■■■ 4.27
CIRBP-223ENST00000589266 KIF27Q86VH2 1401 aa41.71■■■■■ 4.27
CIRBP-223ENST00000589266 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.66■■■■■ 4.26
CIRBP-223ENST00000589266 MAPKBP1O60336 1514 aa41.64■■■■■ 4.26
CIRBP-223ENST00000589266 EEA1Q15075 1411 aa41.64■■■■■ 4.26
CIRBP-223ENST00000589266 DIP2BQ9P265 1576 aa41.55■■■■■ 4.24
CIRBP-223ENST00000589266 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.53■■■■■ 4.24
CIRBP-223ENST00000589266 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.44■■■■■ 4.22
CIRBP-223ENST00000589266 KDM6BO15054 1643 aa41.42■■■■■ 4.22
CIRBP-223ENST00000589266 IGF1RP08069 1367 aa41.39■■■■■ 4.22
CIRBP-223ENST00000589266 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.38■■■■■ 4.21
CIRBP-223ENST00000589266 TSPOAP1O95153 1857 aa41.34■■■■■ 4.21
CIRBP-223ENST00000589266 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.34■■■■■ 4.21
CIRBP-223ENST00000589266 CUL7Q14999 1698 aa41.26■■■■■ 4.2
CIRBP-223ENST00000589266 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
CIRBP-223ENST00000589266 PTPRGP23470 1445 aa41.23■■■■■ 4.19
CIRBP-223ENST00000589266 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.17■■■■■ 4.18
CIRBP-223ENST00000589266 PRXQ9BXM0 1461 aa41.15■■■■■ 4.18
CIRBP-223ENST00000589266 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
CIRBP-223ENST00000589266 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.09■■■■■ 4.17
CIRBP-223ENST00000589266 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.08■■■■■ 4.17
CIRBP-223ENST00000589266 ABCC2Q92887 1545 aa41.08■■■■■ 4.17
CIRBP-223ENST00000589266 KIF21BO75037 1637 aa41.07■■■■■ 4.16
CIRBP-223ENST00000589266 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.05■■■■■ 4.16
CIRBP-223ENST00000589266 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.02■■■■■ 4.16
CIRBP-223ENST00000589266 ASXL2Q76L83 1435 aa41.01■■■■■ 4.16
CIRBP-223ENST00000589266 GLI2P10070 1586 aa40.98■■■■■ 4.15
CIRBP-223ENST00000589266 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
CIRBP-223ENST00000589266 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.91■■■■■ 4.14
CIRBP-223ENST00000589266 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
CIRBP-223ENST00000589266 IQGAP2Q13576 1575 aa40.9■■■■■ 4.14
CIRBP-223ENST00000589266 GOLGA3Q08378 1498 aa40.89■■■■■ 4.14
CIRBP-223ENST00000589266 UACAQ9BZF9 1416 aa40.87■■■■■ 4.13
CIRBP-223ENST00000589266 ADGRL1O94910 1474 aa40.83■■■■■ 4.13
CIRBP-223ENST00000589266 DISP1Q96F81 1524 aa40.77■■■■■ 4.12
CIRBP-223ENST00000589266 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
CIRBP-223ENST00000589266 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
CIRBP-223ENST00000589266 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.73■■■■■ 4.11
CIRBP-223ENST00000589266 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.7■■■■■ 4.11
CIRBP-223ENST00000589266 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.7■■■■■ 4.11
CIRBP-223ENST00000589266 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
CIRBP-223ENST00000589266 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.62■■■■■ 4.09
CIRBP-223ENST00000589266 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
CIRBP-223ENST00000589266 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.59■■■■■ 4.09
CIRBP-223ENST00000589266 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.58■■■■■ 4.09
CIRBP-223ENST00000589266 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.54■■■■■ 4.08
CIRBP-223ENST00000589266 KIAA0556O60303 1618 aa40.53■■■■■ 4.08
CIRBP-223ENST00000589266 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.5■■■■■ 4.07
CIRBP-223ENST00000589266 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.48■■■■■ 4.07
CIRBP-223ENST00000589266 CD109Q6YHK3 1445 aa40.35■■■■■ 4.05
CIRBP-223ENST00000589266 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.33■■■■■ 4.05
CIRBP-223ENST00000589266 KCNH8Q96L42 1107 aa40.33■■■■■ 4.05
CIRBP-223ENST00000589266 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.29■■■■■ 4.04
CIRBP-223ENST00000589266 ABCA8O94911 1581 aa40.22■■■■■ 4.03
CIRBP-223ENST00000589266 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.19■■■■■ 4.02
CIRBP-223ENST00000589266 CEP162Q5TB80 1403 aa40.18■■■■■ 4.02
CIRBP-223ENST00000589266 CLIP1P30622 1438 aa40.15■■■■■ 4.02
CIRBP-223ENST00000589266 SAMD9Q5K651 1589 aa40.14■■■■■ 4.02
CIRBP-223ENST00000589266 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.06■■■■■ 4
CIRBP-223ENST00000589266 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.05■■■■■ 4
CIRBP-223ENST00000589266 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
CIRBP-223ENST00000589266 ARID3CA6NKF2 412 aa39.95■■■■□ 3.99
CIRBP-223ENST00000589266 FBXO41Q8TF61 875 aa39.93■■■■□ 3.98
CIRBP-223ENST00000589266 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.93■■■■□ 3.98
CIRBP-223ENST00000589266 ATP10BO94823 1461 aa39.92■■■■□ 3.98
CIRBP-223ENST00000589266 P3H3Q8IVL6 736 aa39.87■■■■□ 3.97
CIRBP-223ENST00000589266 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.87■■■■□ 3.97
CIRBP-223ENST00000589266 PTPRMP28827 1452 aa39.85■■■■□ 3.97
CIRBP-223ENST00000589266 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.83■■■■□ 3.97
CIRBP-223ENST00000589266 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.83■■■■□ 3.97
CIRBP-223ENST00000589266 RAPGEF3O95398 923 aa39.82■■■■□ 3.97
CIRBP-223ENST00000589266 FMN1Q68DA7 1419 aa39.8■■■■□ 3.96
CIRBP-223ENST00000589266 NEO1Q92859 1461 aa39.75■■■■□ 3.95
CIRBP-223ENST00000589266 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
CIRBP-223ENST00000589266 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
CIRBP-223ENST00000589266 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
CIRBP-223ENST00000589266 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.68■■■■□ 3.94
CIRBP-223ENST00000589266 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.66■■■■□ 3.94
CIRBP-223ENST00000589266 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.64■■■■□ 3.94
CIRBP-223ENST00000589266 MADDQ8WXG6 1647 aa39.6■■■■□ 3.93
CIRBP-223ENST00000589266 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
CIRBP-223ENST00000589266 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.59■■■■□ 3.93
CIRBP-223ENST00000589266 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.57■■■■□ 3.93
CIRBP-223ENST00000589266 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.53■■■■□ 3.92
CIRBP-223ENST00000589266 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.53■■■■□ 3.92
CIRBP-223ENST00000589266 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
CIRBP-223ENST00000589266 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
CIRBP-223ENST00000589266 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.46■■■■□ 3.91
CIRBP-223ENST00000589266 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.46■■■■□ 3.91
CIRBP-223ENST00000589266 HECW1Q76N89 1606 aa39.46■■■■□ 3.91
CIRBP-223ENST00000589266 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
CIRBP-223ENST00000589266 AKNAQ7Z591 1439 aa39.42■■■■□ 3.9
CIRBP-223ENST00000589266 RICTORQ6R327 1708 aa39.4■■■■□ 3.9
CIRBP-223ENST00000589266 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.37■■■■□ 3.89
CIRBP-223ENST00000589266 FANCAO15360 1455 aa39.36■■■■□ 3.89
CIRBP-223ENST00000589266 HSPA2P54652 639 aa39.34■■■■□ 3.89
CIRBP-223ENST00000589266 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.34■■■■□ 3.89
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