RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587761.1

SEH1L-204, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 5

Gene SEH1L, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-204ENST00000587761 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
SEH1L-204ENST00000587761 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.69■■□□□ 1.54
SEH1L-204ENST00000587761 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.66■■□□□ 1.54
SEH1L-204ENST00000587761 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.65■■□□□ 1.54
SEH1L-204ENST00000587761 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.63■■□□□ 1.53
SEH1L-204ENST00000587761 IGF1RP08069 1367 aa24.61■■□□□ 1.53
SEH1L-204ENST00000587761 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.6■■□□□ 1.53
SEH1L-204ENST00000587761 MAPKBP1O60336 1514 aa24.59■■□□□ 1.53
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SEH1L-204ENST00000587761 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.52■■□□□ 1.52
SEH1L-204ENST00000587761 DIP2BQ9P265 1576 aa24.49■■□□□ 1.51
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SEH1L-204ENST00000587761 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.37■■□□□ 1.49
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SEH1L-204ENST00000587761 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.32■■□□□ 1.48
SEH1L-204ENST00000587761 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SEH1L-204ENST00000587761 ABCC2Q92887 1545 aa24.31■■□□□ 1.48
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SEH1L-204ENST00000587761 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.27■■□□□ 1.48
SEH1L-204ENST00000587761 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.26■■□□□ 1.47
SEH1L-204ENST00000587761 IQGAP2Q13576 1575 aa24.25■■□□□ 1.47
SEH1L-204ENST00000587761 ASXL2Q76L83 1435 aa24.25■■□□□ 1.47
SEH1L-204ENST00000587761 UACAQ9BZF9 1416 aa24.23■■□□□ 1.47
SEH1L-204ENST00000587761 GLI2P10070 1586 aa24.22■■□□□ 1.47
SEH1L-204ENST00000587761 DISP1Q96F81 1524 aa24.19■■□□□ 1.46
SEH1L-204ENST00000587761 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.15■■□□□ 1.46
SEH1L-204ENST00000587761 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.14■■□□□ 1.45
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SEH1L-204ENST00000587761 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SEH1L-204ENST00000587761 KIAA0556O60303 1618 aa24.03■■□□□ 1.44
SEH1L-204ENST00000587761 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.03■■□□□ 1.44
SEH1L-204ENST00000587761 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SEH1L-204ENST00000587761 ADGRL1O94910 1474 aa23.99■■□□□ 1.43
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SEH1L-204ENST00000587761 GOLGA3Q08378 1498 aa23.94■■□□□ 1.42
SEH1L-204ENST00000587761 CD109Q6YHK3 1445 aa23.88■■□□□ 1.41
SEH1L-204ENST00000587761 KCNH8Q96L42 1107 aa23.88■■□□□ 1.41
SEH1L-204ENST00000587761 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.87■■□□□ 1.41
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SEH1L-204ENST00000587761 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.87■■□□□ 1.41
SEH1L-204ENST00000587761 ABCA8O94911 1581 aa23.86■■□□□ 1.41
SEH1L-204ENST00000587761 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SEH1L-204ENST00000587761 PRXQ9BXM0 1461 aa23.84■■□□□ 1.41
SEH1L-204ENST00000587761 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
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SEH1L-204ENST00000587761 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.7■■□□□ 1.38
SEH1L-204ENST00000587761 ATP10BO94823 1461 aa23.7■■□□□ 1.38
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SEH1L-204ENST00000587761 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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SEH1L-204ENST00000587761 KIF21BO75037 1637 aa23.58■■□□□ 1.36
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SEH1L-204ENST00000587761 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SEH1L-204ENST00000587761 SAMD9Q5K651 1589 aa23.56■■□□□ 1.36
SEH1L-204ENST00000587761 RAPGEF3O95398 923 aa23.55■■□□□ 1.36
SEH1L-204ENST00000587761 NEO1Q92859 1461 aa23.55■■□□□ 1.36
SEH1L-204ENST00000587761 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.53■■□□□ 1.36
SEH1L-204ENST00000587761 PTPRMP28827 1452 aa23.48■■□□□ 1.35
SEH1L-204ENST00000587761 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.47■■□□□ 1.35
SEH1L-204ENST00000587761 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SEH1L-204ENST00000587761 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.47■■□□□ 1.35
SEH1L-204ENST00000587761 EEA1Q15075 1411 aa23.45■■□□□ 1.34
SEH1L-204ENST00000587761 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SEH1L-204ENST00000587761 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SEH1L-204ENST00000587761 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.4■■□□□ 1.34
SEH1L-204ENST00000587761 FBXO41Q8TF61 875 aa23.39■■□□□ 1.33
SEH1L-204ENST00000587761 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.39■■□□□ 1.33
SEH1L-204ENST00000587761 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SEH1L-204ENST00000587761 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.37■■□□□ 1.33
SEH1L-204ENST00000587761 AKNAQ7Z591 1439 aa23.36■■□□□ 1.33
SEH1L-204ENST00000587761 FANCAO15360 1455 aa23.33■■□□□ 1.33
SEH1L-204ENST00000587761 MADDQ8WXG6 1647 aa23.31■■□□□ 1.32
SEH1L-204ENST00000587761 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.322e-7■■■■□ 26.2
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SEH1L-204ENST00000587761 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.29■■□□□ 1.32
SEH1L-204ENST00000587761 RICTORQ6R327 1708 aa23.29■■□□□ 1.32
SEH1L-204ENST00000587761 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SEH1L-204ENST00000587761 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.28■■□□□ 1.32
SEH1L-204ENST00000587761 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.26■■□□□ 1.31
SEH1L-204ENST00000587761 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.26■■□□□ 1.31
SEH1L-204ENST00000587761 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.24■■□□□ 1.31
SEH1L-204ENST00000587761 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.23■■□□□ 1.31
SEH1L-204ENST00000587761 PLCH2O75038 1416 aa23.21■■□□□ 1.31
SEH1L-204ENST00000587761 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.21■■□□□ 1.31
SEH1L-204ENST00000587761 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SEH1L-204ENST00000587761 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.2■■□□□ 1.3
SEH1L-204ENST00000587761 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.2■■□□□ 1.3
SEH1L-204ENST00000587761 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.18■■□□□ 1.3
SEH1L-204ENST00000587761 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SEH1L-204ENST00000587761 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.16■■□□□ 1.3
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