RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587760.5

NFIX-209, Transcript of nuclear factor I X, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFIX, Length 1,487 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIX-209ENST00000587760 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
NFIX-209ENST00000587760 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.31■■□□□ 1.8
NFIX-209ENST00000587760 APLP2Q06481 763 aa26.31■■□□□ 1.8
NFIX-209ENST00000587760 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
NFIX-209ENST00000587760 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.19■■□□□ 1.78
NFIX-209ENST00000587760 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
NFIX-209ENST00000587760 IQGAP2Q13576 1575 aa26.11■■□□□ 1.77
NFIX-209ENST00000587760 SAMD9Q5K651 1589 aa26.11■■□□□ 1.77
NFIX-209ENST00000587760 SYNJ2O15056 1496 aa26.11■■□□□ 1.77
NFIX-209ENST00000587760 GRIN2AQ12879 1464 aa26.11■■□□□ 1.77
NFIX-209ENST00000587760 MAP3K1Q13233 1512 aa26.09■■□□□ 1.77
NFIX-209ENST00000587760 FMN1Q68DA7 1419 aa26.07■■□□□ 1.76
NFIX-209ENST00000587760 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.05■■□□□ 1.76
NFIX-209ENST00000587760 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.02■■□□□ 1.76
NFIX-209ENST00000587760 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
NFIX-209ENST00000587760 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.01■■□□□ 1.75
NFIX-209ENST00000587760 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26■■□□□ 1.75
NFIX-209ENST00000587760 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.98■■□□□ 1.75
NFIX-209ENST00000587760 P3H3Q8IVL6 736 aa25.95■■□□□ 1.74
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NFIX-209ENST00000587760 TIAM1Q13009 1591 aa25.95■■□□□ 1.74
NFIX-209ENST00000587760 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
NFIX-209ENST00000587760 NUP160Q12769 1436 aa25.92■■□□□ 1.74
NFIX-209ENST00000587760 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.9■■□□□ 1.74
NFIX-209ENST00000587760 CEP170Q5SW79 1584 aa25.87■■□□□ 1.73
NFIX-209ENST00000587760 HRCP23327 699 aa25.85■■□□□ 1.73
NFIX-209ENST00000587760 FBLN2P98095 1184 aa25.84■■□□□ 1.73
NFIX-209ENST00000587760 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.82■■□□□ 1.72
NFIX-209ENST00000587760 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
NFIX-209ENST00000587760 KIAA0556O60303 1618 aa25.81■■□□□ 1.72
NFIX-209ENST00000587760 DISP1Q96F81 1524 aa25.77■■□□□ 1.72
NFIX-209ENST00000587760 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.77■■□□□ 1.72
NFIX-209ENST00000587760 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.76■■□□□ 1.71
NFIX-209ENST00000587760 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
NFIX-209ENST00000587760 HECW1Q76N89 1606 aa25.76■■□□□ 1.71
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NFIX-209ENST00000587760 CHD1O14646 1710 aa25.7■■□□□ 1.7
NFIX-209ENST00000587760 JPH4Q96JJ6 628 aa25.69■■□□□ 1.7
NFIX-209ENST00000587760 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
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NFIX-209ENST00000587760 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.62■■□□□ 1.69
NFIX-209ENST00000587760 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.62■■□□□ 1.69
NFIX-209ENST00000587760 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.6■■□□□ 1.69
NFIX-209ENST00000587760 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
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NFIX-209ENST00000587760 SHROOM2Q13796 1616 aa25.54■■□□□ 1.68
NFIX-209ENST00000587760 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
NFIX-209ENST00000587760 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
NFIX-209ENST00000587760 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.51■■□□□ 1.67
NFIX-209ENST00000587760 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
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NFIX-209ENST00000587760 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
NFIX-209ENST00000587760 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.45■■□□□ 1.67
NFIX-209ENST00000587760 NCOA2Q15596 1464 aa25.45■■□□□ 1.66
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NFIX-209ENST00000587760 ARHGEF11O15085 1522 aa25.42■■□□□ 1.66
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NFIX-209ENST00000587760 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.41■■□□□ 1.66
NFIX-209ENST00000587760 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.41■■□□□ 1.66
NFIX-209ENST00000587760 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.41■■□□□ 1.66
NFIX-209ENST00000587760 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.4■■□□□ 1.66
NFIX-209ENST00000587760 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
NFIX-209ENST00000587760 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
NFIX-209ENST00000587760 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
NFIX-209ENST00000587760 MIA2Q96PC5 1412 aa25.31■■□□□ 1.64
NFIX-209ENST00000587760 UACAQ9BZF9 1416 aa25.28■■□□□ 1.64
NFIX-209ENST00000587760 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.26■■□□□ 1.63
NFIX-209ENST00000587760 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NFIX-209ENST00000587760 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.25■■□□□ 1.63
NFIX-209ENST00000587760 ARID3CA6NKF2 412 aa25.24■■□□□ 1.63
NFIX-209ENST00000587760 ATP10BO94823 1461 aa25.24■■□□□ 1.63
NFIX-209ENST00000587760 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.23■■□□□ 1.63
NFIX-209ENST00000587760 ITGAEP38570 1179 aa25.21■■□□□ 1.63
NFIX-209ENST00000587760 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.21■■□□□ 1.63
NFIX-209ENST00000587760 ABCC2Q92887 1545 aa25.21■■□□□ 1.63
NFIX-209ENST00000587760 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.19■■□□□ 1.62
NFIX-209ENST00000587760 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.18■■□□□ 1.62
NFIX-209ENST00000587760 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.18■■□□□ 1.62
NFIX-209ENST00000587760 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.17■■□□□ 1.62
NFIX-209ENST00000587760 OSCARQ8IYS5 282 aa25.16■■□□□ 1.62
NFIX-209ENST00000587760 KIF14Q15058 1648 aa25.16■■□□□ 1.62
NFIX-209ENST00000587760 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.11■■□□□ 1.61
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NFIX-209ENST00000587760 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
NFIX-209ENST00000587760 HFM1A2PYH4 1435 aa25.07■■□□□ 1.6
NFIX-209ENST00000587760 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
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NFIX-209ENST00000587760 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.03■■□□□ 1.6
NFIX-209ENST00000587760 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
NFIX-209ENST00000587760 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
NFIX-209ENST00000587760 PTPRKQ15262 1439 aa25■■□□□ 1.59
NFIX-209ENST00000587760 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
NFIX-209ENST00000587760 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.97■■□□□ 1.59
NFIX-209ENST00000587760 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.97■■□□□ 1.59
NFIX-209ENST00000587760 DAPK1P53355 1430 aa24.97■■□□□ 1.59
NFIX-209ENST00000587760 ROCK1Q13464 1354 aa24.96■■□□□ 1.59
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