RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586065.1

PTPRS-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRS, Length 388 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-203ENST00000586065 NUP160Q12769 1436 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRS-203ENST00000586065 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRS-203ENST00000586065 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRS-203ENST00000586065 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRS-203ENST00000586065 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRS-203ENST00000586065 EEA1Q15075 1411 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRS-203ENST00000586065 JPH4Q96JJ6 628 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRS-203ENST00000586065 PRXQ9BXM0 1461 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRS-203ENST00000586065 SHROOM2Q13796 1616 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRS-203ENST00000586065 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRS-203ENST00000586065 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24■■□□□ 1.43
PTPRS-203ENST00000586065 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
PTPRS-203ENST00000586065 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRS-203ENST00000586065 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRS-203ENST00000586065 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRS-203ENST00000586065 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PTPRS-203ENST00000586065 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.89■■□□□ 1.42
PTPRS-203ENST00000586065 KIF21BO75037 1637 aa23.89■■□□□ 1.42
PTPRS-203ENST00000586065 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRS-203ENST00000586065 IQGAP2Q13576 1575 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRS-203ENST00000586065 MAPKBP1O60336 1514 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRS-203ENST00000586065 DIP2BQ9P265 1576 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRS-203ENST00000586065 KDM6BO15054 1643 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRS-203ENST00000586065 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRS-203ENST00000586065 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRS-203ENST00000586065 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PTPRS-203ENST00000586065 GOLGA3Q08378 1498 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRS-203ENST00000586065 DISP1Q96F81 1524 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRS-203ENST00000586065 KIAA0556O60303 1618 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRS-203ENST00000586065 PTPRGP23470 1445 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRS-203ENST00000586065 TSPOAP1O95153 1857 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRS-203ENST00000586065 SAMD9Q5K651 1589 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRS-203ENST00000586065 ADGRL1O94910 1474 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRS-203ENST00000586065 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRS-203ENST00000586065 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRS-203ENST00000586065 ASXL2Q76L83 1435 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRS-203ENST00000586065 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRS-203ENST00000586065 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRS-203ENST00000586065 ABCC2Q92887 1545 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRS-203ENST00000586065 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRS-203ENST00000586065 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRS-203ENST00000586065 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRS-203ENST00000586065 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRS-203ENST00000586065 GLI2P10070 1586 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRS-203ENST00000586065 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRS-203ENST00000586065 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRS-203ENST00000586065 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRS-203ENST00000586065 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRS-203ENST00000586065 ABCA8O94911 1581 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRS-203ENST00000586065 UACAQ9BZF9 1416 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRS-203ENST00000586065 P3H3Q8IVL6 736 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRS-203ENST00000586065 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRS-203ENST00000586065 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PTPRS-203ENST00000586065 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRS-203ENST00000586065 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRS-203ENST00000586065 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRS-203ENST00000586065 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PTPRS-203ENST00000586065 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRS-203ENST00000586065 CLIP1P30622 1438 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRS-203ENST00000586065 CEP162Q5TB80 1403 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRS-203ENST00000586065 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRS-203ENST00000586065 FBXO41Q8TF61 875 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRS-203ENST00000586065 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PTPRS-203ENST00000586065 KCNH8Q96L42 1107 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRS-203ENST00000586065 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PTPRS-203ENST00000586065 FMN1Q68DA7 1419 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRS-203ENST00000586065 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRS-203ENST00000586065 CD109Q6YHK3 1445 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRS-203ENST00000586065 HECW1Q76N89 1606 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRS-203ENST00000586065 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRS-203ENST00000586065 ATP10BO94823 1461 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRS-203ENST00000586065 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
PTPRS-203ENST00000586065 ARID3CA6NKF2 412 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRS-203ENST00000586065 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRS-203ENST00000586065 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRS-203ENST00000586065 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRS-203ENST00000586065 PTPRMP28827 1452 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRS-203ENST00000586065 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRS-203ENST00000586065 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRS-203ENST00000586065 RAPGEF3O95398 923 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRS-203ENST00000586065 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRS-203ENST00000586065 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRS-203ENST00000586065 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRS-203ENST00000586065 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRS-203ENST00000586065 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRS-203ENST00000586065 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRS-203ENST00000586065 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRS-203ENST00000586065 KIF14Q15058 1648 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRS-203ENST00000586065 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRS-203ENST00000586065 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
PTPRS-203ENST00000586065 HSPA2P54652 639 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRS-203ENST00000586065 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRS-203ENST00000586065 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRS-203ENST00000586065 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRS-203ENST00000586065 TIAM1Q13009 1591 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRS-203ENST00000586065 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRS-203ENST00000586065 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRS-203ENST00000586065 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRS-203ENST00000586065 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRS-203ENST00000586065 CERKQ8TCT0 537 aa22.72■■□□□ 1.23
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