RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADAMTS12P58397 1594 aa45.42■■■■■ 4.86
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.18■■■■■ 4.82
CTDNEP1-208ENST00000573600 APLP2Q06481 763 aa45.18■■■■■ 4.82
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
CTDNEP1-208ENST00000573600 SAMD9Q5K651 1589 aa45■■■■■ 4.79
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SYNJ2O15056 1496 aa44.97■■■■■ 4.79
CTDNEP1-208ENST00000573600 IQGAP2Q13576 1575 aa44.97■■■■■ 4.79
CTDNEP1-208ENST00000573600 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.9■■■■■ 4.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.9■■■■■ 4.78
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.84■■■■■ 4.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAP3K1Q13233 1512 aa44.83■■■■■ 4.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.82■■■■■ 4.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 FMN1Q68DA7 1419 aa44.82■■■■■ 4.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
CTDNEP1-208ENST00000573600 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.76■■■■■ 4.76
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa44.73■■■■■ 4.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 TIAM1Q13009 1591 aa44.7■■■■■ 4.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEP170Q5SW79 1584 aa44.68■■■■■ 4.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUP160Q12769 1436 aa44.65■■■■■ 4.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 FBLN2P98095 1184 aa44.63■■■■■ 4.73
CTDNEP1-208ENST00000573600 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.63■■■■■ 4.73
CTDNEP1-208ENST00000573600 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
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CTDNEP1-208ENST00000573600 DISP1Q96F81 1524 aa44.47■■■■■ 4.71
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CHD1O14646 1710 aa44.42■■■■■ 4.7
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.32■■■■■ 4.69
CTDNEP1-208ENST00000573600 JPH4Q96JJ6 628 aa44.3■■■■■ 4.68
CTDNEP1-208ENST00000573600 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.29■■■■■ 4.68
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC18Q5T9S5 1454 aa44.28■■■■■ 4.68
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CTDNEP1-208ENST00000573600 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.12■■■■■ 4.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 MTUS2Q5JR59 1369 aa44.11■■■■■ 4.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.1■■■■■ 4.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa44.09■■■■■ 4.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.04■■■■■ 4.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 SHROOM2Q13796 1616 aa44.03■■■■■ 4.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.99■■■■■ 4.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.91■■■■■ 4.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.89■■■■■ 4.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 NCOA2Q15596 1464 aa43.87■■■■■ 4.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.87■■■■■ 4.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.85■■■■■ 4.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCA8O94911 1581 aa43.84■■■■■ 4.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGEF11O15085 1522 aa43.83■■■■■ 4.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP43.81■■■■■ 4.62e-14■■■■□ 24.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.76■■■■■ 4.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.76■■■■■ 4.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYOM3Q5VTT5 1437 aa43.74■■■■■ 4.59
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.52■■■■■ 4.56
CTDNEP1-208ENST00000573600 MIA2Q96PC5 1412 aa43.52■■■■■ 4.56
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SETD5Q9C0A6 1442 aa43.36■■■■■ 4.53
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ITSN2Q9NZM3 1697 aa43.34■■■■■ 4.53
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.04■■■■■ 4.48
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GCC2Q8IWJ2 1684 aa42.97■■■■■ 4.47
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