RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571386.1

SPNS2-204, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-204ENST00000571386 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.78■■■□□ 2.2
SPNS2-204ENST00000571386 MAPKBP1O60336 1514 aa28.78■■■□□ 2.2
SPNS2-204ENST00000571386 DIP2BQ9P265 1576 aa28.77■■■□□ 2.2
SPNS2-204ENST00000571386 JPH4Q96JJ6 628 aa28.76■■■□□ 2.19
SPNS2-204ENST00000571386 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.74■■■□□ 2.19
SPNS2-204ENST00000571386 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.7■■■□□ 2.18
SPNS2-204ENST00000571386 KDM6BO15054 1643 aa28.66■■■□□ 2.18
SPNS2-204ENST00000571386 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.18
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SPNS2-204ENST00000571386 KIF27Q86VH2 1401 aa28.63■■■□□ 2.17
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SPNS2-204ENST00000571386 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.47■■■□□ 2.15
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SPNS2-204ENST00000571386 PTPRGP23470 1445 aa28.35■■■□□ 2.13
SPNS2-204ENST00000571386 ABCC2Q92887 1545 aa28.33■■■□□ 2.13
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SPNS2-204ENST00000571386 ASXL2Q76L83 1435 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS2-204ENST00000571386 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
SPNS2-204ENST00000571386 IQGAP2Q13576 1575 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS2-204ENST00000571386 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.26■■■□□ 2.12
SPNS2-204ENST00000571386 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.26■■■□□ 2.12
SPNS2-204ENST00000571386 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.26■■■□□ 2.11
SPNS2-204ENST00000571386 ADGRL1O94910 1474 aa28.22■■■□□ 2.11
SPNS2-204ENST00000571386 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.2■■■□□ 2.1
SPNS2-204ENST00000571386 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.18■■■□□ 2.1
SPNS2-204ENST00000571386 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
SPNS2-204ENST00000571386 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.15■■■□□ 2.1
SPNS2-204ENST00000571386 UACAQ9BZF9 1416 aa28.14■■■□□ 2.1
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SPNS2-204ENST00000571386 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
SPNS2-204ENST00000571386 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
SPNS2-204ENST00000571386 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.09■■■□□ 2.09
SPNS2-204ENST00000571386 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.07■■■□□ 2.08
SPNS2-204ENST00000571386 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.05■■■□□ 2.08
SPNS2-204ENST00000571386 KIAA0556O60303 1618 aa28.03■■■□□ 2.08
SPNS2-204ENST00000571386 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.03■■■□□ 2.08
SPNS2-204ENST00000571386 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.95■■■□□ 2.07
SPNS2-204ENST00000571386 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.94■■■□□ 2.06
SPNS2-204ENST00000571386 PRXQ9BXM0 1461 aa27.92■■■□□ 2.06
SPNS2-204ENST00000571386 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.88■■■□□ 2.05
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SPNS2-204ENST00000571386 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.84■■■□□ 2.05
SPNS2-204ENST00000571386 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS2-204ENST00000571386 GOLGA3Q08378 1498 aa27.8■■■□□ 2.04
SPNS2-204ENST00000571386 KIF21BO75037 1637 aa27.79■■■□□ 2.04
SPNS2-204ENST00000571386 ABCA8O94911 1581 aa27.78■■■□□ 2.04
SPNS2-204ENST00000571386 CD109Q6YHK3 1445 aa27.77■■■□□ 2.04
SPNS2-204ENST00000571386 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
SPNS2-204ENST00000571386 KCNH8Q96L42 1107 aa27.66■■■□□ 2.02
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SPNS2-204ENST00000571386 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.6■■■□□ 2.01
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SPNS2-204ENST00000571386 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
SPNS2-204ENST00000571386 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.45■■□□□ 1.99
SPNS2-204ENST00000571386 FBXO41Q8TF61 875 aa27.45■■□□□ 1.98
SPNS2-204ENST00000571386 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.43■■□□□ 1.98
SPNS2-204ENST00000571386 MADDQ8WXG6 1647 aa27.43■■□□□ 1.98
SPNS2-204ENST00000571386 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.42■■□□□ 1.98
SPNS2-204ENST00000571386 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.41■■□□□ 1.98
SPNS2-204ENST00000571386 NEO1Q92859 1461 aa27.4■■□□□ 1.98
SPNS2-204ENST00000571386 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
SPNS2-204ENST00000571386 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
SPNS2-204ENST00000571386 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.37■■□□□ 1.97
SPNS2-204ENST00000571386 RAPGEF3O95398 923 aa27.36■■□□□ 1.97
SPNS2-204ENST00000571386 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.36■■□□□ 1.97
SPNS2-204ENST00000571386 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.34■■□□□ 1.97
SPNS2-204ENST00000571386 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.33■■□□□ 1.97
SPNS2-204ENST00000571386 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.32■■□□□ 1.96
SPNS2-204ENST00000571386 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
SPNS2-204ENST00000571386 RICTORQ6R327 1708 aa27.3■■□□□ 1.96
SPNS2-204ENST00000571386 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
SPNS2-204ENST00000571386 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
SPNS2-204ENST00000571386 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SPNS2-204ENST00000571386 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
SPNS2-204ENST00000571386 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.23■■□□□ 1.95
SPNS2-204ENST00000571386 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
SPNS2-204ENST00000571386 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.17■■□□□ 1.94
SPNS2-204ENST00000571386 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.16■■□□□ 1.94
SPNS2-204ENST00000571386 FANCAO15360 1455 aa27.14■■□□□ 1.94
SPNS2-204ENST00000571386 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.14■■□□□ 1.93
SPNS2-204ENST00000571386 FMN1Q68DA7 1419 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS2-204ENST00000571386 AKNAQ7Z591 1439 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS2-204ENST00000571386 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.12■■□□□ 1.93
SPNS2-204ENST00000571386 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS2-204ENST00000571386 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS2-204ENST00000571386 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS2-204ENST00000571386 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS2-204ENST00000571386 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS2-204ENST00000571386 HSPA2P54652 639 aa27.07■■□□□ 1.92
SPNS2-204ENST00000571386 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.06■■□□□ 1.92
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