RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570346.1

NOMO3-203, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 3

Gene NOMO3, Length 320 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-203ENST00000570346 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
NOMO3-203ENST00000570346 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.91■■□□□ 1.74
NOMO3-203ENST00000570346 NUP160Q12769 1436 aa25.9■■□□□ 1.74
NOMO3-203ENST00000570346 OSCARQ8IYS5 282 aa25.9■■□□□ 1.74
NOMO3-203ENST00000570346 IQGAP2Q13576 1575 aa25.86■■□□□ 1.73
NOMO3-203ENST00000570346 CEP170Q5SW79 1584 aa25.85■■□□□ 1.73
NOMO3-203ENST00000570346 CEP162Q5TB80 1403 aa25.83■■□□□ 1.73
NOMO3-203ENST00000570346 CLIP1P30622 1438 aa25.81■■□□□ 1.72
NOMO3-203ENST00000570346 JPH4Q96JJ6 628 aa25.78■■□□□ 1.72
NOMO3-203ENST00000570346 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.74■■□□□ 1.71
NOMO3-203ENST00000570346 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.73■■□□□ 1.71
NOMO3-203ENST00000570346 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.7■■□□□ 1.7
NOMO3-203ENST00000570346 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.68■■□□□ 1.7
NOMO3-203ENST00000570346 P3H3Q8IVL6 736 aa25.65■■□□□ 1.7
NOMO3-203ENST00000570346 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
NOMO3-203ENST00000570346 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.61■■□□□ 1.69
NOMO3-203ENST00000570346 SAMD9Q5K651 1589 aa25.59■■□□□ 1.69
NOMO3-203ENST00000570346 SHROOM2Q13796 1616 aa25.58■■□□□ 1.69
NOMO3-203ENST00000570346 KIAA0556O60303 1618 aa25.56■■□□□ 1.68
NOMO3-203ENST00000570346 FMN1Q68DA7 1419 aa25.55■■□□□ 1.68
NOMO3-203ENST00000570346 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.54■■□□□ 1.68
NOMO3-203ENST00000570346 DISP1Q96F81 1524 aa25.53■■□□□ 1.68
NOMO3-203ENST00000570346 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
NOMO3-203ENST00000570346 APLP2Q06481 763 aa25.51■■□□□ 1.67
NOMO3-203ENST00000570346 ARAP1Q96P48 1450 aa25.49■■□□□ 1.67
NOMO3-203ENST00000570346 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.48■■□□□ 1.67
NOMO3-203ENST00000570346 PTPRGP23470 1445 aa25.46■■□□□ 1.67
NOMO3-203ENST00000570346 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
NOMO3-203ENST00000570346 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.34■■□□□ 1.65
NOMO3-203ENST00000570346 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.33■■□□□ 1.65
NOMO3-203ENST00000570346 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.33■■□□□ 1.65
NOMO3-203ENST00000570346 ARHGEF11O15085 1522 aa25.32■■□□□ 1.64
NOMO3-203ENST00000570346 HECW1Q76N89 1606 aa25.29■■□□□ 1.64
NOMO3-203ENST00000570346 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.28■■□□□ 1.64
NOMO3-203ENST00000570346 UACAQ9BZF9 1416 aa25.28■■□□□ 1.64
NOMO3-203ENST00000570346 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
NOMO3-203ENST00000570346 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
NOMO3-203ENST00000570346 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
NOMO3-203ENST00000570346 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
NOMO3-203ENST00000570346 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.23■■□□□ 1.63
NOMO3-203ENST00000570346 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.23■■□□□ 1.63
NOMO3-203ENST00000570346 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.23■■□□□ 1.63
NOMO3-203ENST00000570346 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.23■■□□□ 1.63
NOMO3-203ENST00000570346 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.23■■□□□ 1.63
NOMO3-203ENST00000570346 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
NOMO3-203ENST00000570346 ABCA8O94911 1581 aa25.2■■□□□ 1.62
NOMO3-203ENST00000570346 ABCC2Q92887 1545 aa25.17■■□□□ 1.62
NOMO3-203ENST00000570346 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.17■■□□□ 1.62
NOMO3-203ENST00000570346 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.16■■□□□ 1.62
NOMO3-203ENST00000570346 ARID3CA6NKF2 412 aa25.15■■□□□ 1.62
NOMO3-203ENST00000570346 MAP3K1Q13233 1512 aa25.15■■□□□ 1.62
NOMO3-203ENST00000570346 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
NOMO3-203ENST00000570346 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
NOMO3-203ENST00000570346 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.1■■□□□ 1.61
NOMO3-203ENST00000570346 TIAM1Q13009 1591 aa25.1■■□□□ 1.61
NOMO3-203ENST00000570346 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.09■■□□□ 1.61
NOMO3-203ENST00000570346 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.09■■□□□ 1.61
NOMO3-203ENST00000570346 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.06■■□□□ 1.6
NOMO3-203ENST00000570346 ATP10BO94823 1461 aa25.04■■□□□ 1.6
NOMO3-203ENST00000570346 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
NOMO3-203ENST00000570346 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.03■■□□□ 1.6
NOMO3-203ENST00000570346 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.02■■□□□ 1.6
NOMO3-203ENST00000570346 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
NOMO3-203ENST00000570346 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25■■□□□ 1.59
NOMO3-203ENST00000570346 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
NOMO3-203ENST00000570346 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.97■■□□□ 1.59
NOMO3-203ENST00000570346 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.97■■□□□ 1.59
NOMO3-203ENST00000570346 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
NOMO3-203ENST00000570346 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
NOMO3-203ENST00000570346 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
NOMO3-203ENST00000570346 KCNH8Q96L42 1107 aa24.88■■□□□ 1.57
NOMO3-203ENST00000570346 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.85■■□□□ 1.57
NOMO3-203ENST00000570346 KIF14Q15058 1648 aa24.85■■□□□ 1.57
NOMO3-203ENST00000570346 ASXL2Q76L83 1435 aa24.85■■□□□ 1.57
NOMO3-203ENST00000570346 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.81■■□□□ 1.56
NOMO3-203ENST00000570346 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.81■■□□□ 1.56
NOMO3-203ENST00000570346 NCOA2Q15596 1464 aa24.8■■□□□ 1.56
NOMO3-203ENST00000570346 MAPKBP1O60336 1514 aa24.79■■□□□ 1.56
NOMO3-203ENST00000570346 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NOMO3-203ENST00000570346 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.7■■□□□ 1.55
NOMO3-203ENST00000570346 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
NOMO3-203ENST00000570346 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.68■■□□□ 1.54
NOMO3-203ENST00000570346 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.68■■□□□ 1.54
NOMO3-203ENST00000570346 MIA2Q96PC5 1412 aa24.65■■□□□ 1.54
NOMO3-203ENST00000570346 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
NOMO3-203ENST00000570346 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
NOMO3-203ENST00000570346 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.64■■□□□ 1.53
NOMO3-203ENST00000570346 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.63■■□□□ 1.53
NOMO3-203ENST00000570346 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.62■■□□□ 1.53
NOMO3-203ENST00000570346 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
NOMO3-203ENST00000570346 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.61■■□□□ 1.53
NOMO3-203ENST00000570346 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.61■■□□□ 1.53
NOMO3-203ENST00000570346 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
NOMO3-203ENST00000570346 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.6■■□□□ 1.53
NOMO3-203ENST00000570346 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.59■■□□□ 1.53
NOMO3-203ENST00000570346 CD109Q6YHK3 1445 aa24.59■■□□□ 1.53
NOMO3-203ENST00000570346 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.59■■□□□ 1.53
NOMO3-203ENST00000570346 PLCH2O75038 1416 aa24.58■■□□□ 1.53
NOMO3-203ENST00000570346 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
NOMO3-203ENST00000570346 GLI2P10070 1586 aa24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms