RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.69■■■□□ 2.82
INO80E-212ENST00000568043 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.61■■■□□ 2.81
INO80E-212ENST00000568043 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.58■■■□□ 2.81
INO80E-212ENST00000568043 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.57■■■□□ 2.8
INO80E-212ENST00000568043 MAPKBP1O60336 1514 aa32.55■■■□□ 2.8
INO80E-212ENST00000568043 DIP2BQ9P265 1576 aa32.53■■■□□ 2.8
INO80E-212ENST00000568043 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.47■■■□□ 2.79
INO80E-212ENST00000568043 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.45■■■□□ 2.78
INO80E-212ENST00000568043 IGF1RP08069 1367 aa32.44■■■□□ 2.78
INO80E-212ENST00000568043 TSPOAP1O95153 1857 aa32.39■■■□□ 2.78
INO80E-212ENST00000568043 CUL7Q14999 1698 aa32.34■■■□□ 2.77
INO80E-212ENST00000568043 KDM6BO15054 1643 aa32.33■■■□□ 2.77
INO80E-212ENST00000568043 KIF27Q86VH2 1401 aa32.31■■■□□ 2.76
INO80E-212ENST00000568043 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.3■■■□□ 2.76
INO80E-212ENST00000568043 PTPRGP23470 1445 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80E-212ENST00000568043 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.18■■■□□ 2.74
INO80E-212ENST00000568043 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
INO80E-212ENST00000568043 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
INO80E-212ENST00000568043 ABCC2Q92887 1545 aa32.13■■■□□ 2.73
INO80E-212ENST00000568043 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.12■■■□□ 2.73
INO80E-212ENST00000568043 ASXL2Q76L83 1435 aa32.09■■■□□ 2.73
INO80E-212ENST00000568043 IQGAP2Q13576 1575 aa32.07■■■□□ 2.72
INO80E-212ENST00000568043 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.07■■■□□ 2.72
INO80E-212ENST00000568043 GLI2P10070 1586 aa32.05■■■□□ 2.72
INO80E-212ENST00000568043 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.02■■■□□ 2.72
INO80E-212ENST00000568043 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.02■■■□□ 2.72
INO80E-212ENST00000568043 DISP1Q96F81 1524 aa32■■■□□ 2.71
INO80E-212ENST00000568043 UACAQ9BZF9 1416 aa31.97■■■□□ 2.71
INO80E-212ENST00000568043 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
INO80E-212ENST00000568043 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.9■■■□□ 2.7
INO80E-212ENST00000568043 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
INO80E-212ENST00000568043 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.89■■■□□ 2.7
INO80E-212ENST00000568043 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.87■■■□□ 2.69
INO80E-212ENST00000568043 ADGRL1O94910 1474 aa31.87■■■□□ 2.69
INO80E-212ENST00000568043 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
INO80E-212ENST00000568043 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.81■■■□□ 2.68
INO80E-212ENST00000568043 KIAA0556O60303 1618 aa31.81■■■□□ 2.68
INO80E-212ENST00000568043 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
INO80E-212ENST00000568043 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.72■■■□□ 2.67
INO80E-212ENST00000568043 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.67■■■□□ 2.66
INO80E-212ENST00000568043 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.63■■■□□ 2.65
INO80E-212ENST00000568043 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.6■■■□□ 2.65
INO80E-212ENST00000568043 ABCA8O94911 1581 aa31.57■■■□□ 2.64
INO80E-212ENST00000568043 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.54■■■□□ 2.64
INO80E-212ENST00000568043 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.54■■■□□ 2.64
INO80E-212ENST00000568043 CD109Q6YHK3 1445 aa31.53■■■□□ 2.64
INO80E-212ENST00000568043 KCNH8Q96L42 1107 aa31.51■■■□□ 2.63
INO80E-212ENST00000568043 GOLGA3Q08378 1498 aa31.47■■■□□ 2.63
INO80E-212ENST00000568043 PRXQ9BXM0 1461 aa31.4■■■□□ 2.62
INO80E-212ENST00000568043 KIF21BO75037 1637 aa31.4■■■□□ 2.62
INO80E-212ENST00000568043 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.32■■■□□ 2.6
INO80E-212ENST00000568043 ARID3CA6NKF2 412 aa31.31■■■□□ 2.6
INO80E-212ENST00000568043 ATP10BO94823 1461 aa31.31■■■□□ 2.6
INO80E-212ENST00000568043 P3H3Q8IVL6 736 aa31.27■■■□□ 2.6
INO80E-212ENST00000568043 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.23■■■□□ 2.59
INO80E-212ENST00000568043 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.18■■■□□ 2.58
INO80E-212ENST00000568043 SAMD9Q5K651 1589 aa31.15■■■□□ 2.58
INO80E-212ENST00000568043 RAPGEF3O95398 923 aa31.14■■■□□ 2.58
INO80E-212ENST00000568043 PTPRMP28827 1452 aa31.12■■■□□ 2.57
INO80E-212ENST00000568043 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.11■■■□□ 2.57
INO80E-212ENST00000568043 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.11■■■□□ 2.57
INO80E-212ENST00000568043 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.09■■■□□ 2.57
INO80E-212ENST00000568043 NEO1Q92859 1461 aa31.07■■■□□ 2.56
INO80E-212ENST00000568043 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
INO80E-212ENST00000568043 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.04■■■□□ 2.56
INO80E-212ENST00000568043 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
INO80E-212ENST00000568043 MADDQ8WXG6 1647 aa31■■■□□ 2.55
INO80E-212ENST00000568043 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31■■■□□ 2.55
INO80E-212ENST00000568043 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
INO80E-212ENST00000568043 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
INO80E-212ENST00000568043 FBXO41Q8TF61 875 aa30.97■■■□□ 2.55
INO80E-212ENST00000568043 RICTORQ6R327 1708 aa30.93■■■□□ 2.54
INO80E-212ENST00000568043 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.91■■■□□ 2.54
INO80E-212ENST00000568043 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
INO80E-212ENST00000568043 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
INO80E-212ENST00000568043 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.89■■■□□ 2.54
INO80E-212ENST00000568043 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
INO80E-212ENST00000568043 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.88■■■□□ 2.53
INO80E-212ENST00000568043 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
INO80E-212ENST00000568043 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.84■■■□□ 2.53
INO80E-212ENST00000568043 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
INO80E-212ENST00000568043 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.83■■■□□ 2.53
INO80E-212ENST00000568043 AKNAQ7Z591 1439 aa30.83■■■□□ 2.53
INO80E-212ENST00000568043 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.81■■■□□ 2.52
INO80E-212ENST00000568043 FANCAO15360 1455 aa30.8■■■□□ 2.52
INO80E-212ENST00000568043 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.79■■■□□ 2.52
INO80E-212ENST00000568043 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.75■■■□□ 2.51
INO80E-212ENST00000568043 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.75■■■□□ 2.51
INO80E-212ENST00000568043 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.74■■■□□ 2.51
INO80E-212ENST00000568043 HSPA2P54652 639 aa30.72■■■□□ 2.51
INO80E-212ENST00000568043 EEA1Q15075 1411 aa30.71■■■□□ 2.51
INO80E-212ENST00000568043 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
INO80E-212ENST00000568043 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.68■■■□□ 2.5
INO80E-212ENST00000568043 HECW1Q76N89 1606 aa30.67■■■□□ 2.5
INO80E-212ENST00000568043 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.67■■■□□ 2.5
INO80E-212ENST00000568043 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.66■■■□□ 2.5
INO80E-212ENST00000568043 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.64■■■□□ 2.49
INO80E-212ENST00000568043 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.62■■■□□ 2.49
INO80E-212ENST00000568043 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80E-212ENST00000568043 MLECQ14165 292 aa30.6■■■□□ 2.49
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