RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560163.1

RABGGTA-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-214ENST00000560163 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.54■■■■□ 3.28
RABGGTA-214ENST00000560163 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.53■■■■□ 3.28
RABGGTA-214ENST00000560163 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.5■■■■□ 3.27
RABGGTA-214ENST00000560163 MAPKBP1O60336 1514 aa35.47■■■■□ 3.27
RABGGTA-214ENST00000560163 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.43■■■■□ 3.26
RABGGTA-214ENST00000560163 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.41■■■■□ 3.26
RABGGTA-214ENST00000560163 DIP2BQ9P265 1576 aa35.4■■■■□ 3.26
RABGGTA-214ENST00000560163 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.32■■■■□ 3.25
RABGGTA-214ENST00000560163 IGF1RP08069 1367 aa35.28■■■■□ 3.24
RABGGTA-214ENST00000560163 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.22■■■■□ 3.23
RABGGTA-214ENST00000560163 KDM6BO15054 1643 aa35.21■■■■□ 3.23
RABGGTA-214ENST00000560163 CUL7Q14999 1698 aa35.15■■■■□ 3.22
RABGGTA-214ENST00000560163 KIF27Q86VH2 1401 aa35.14■■■■□ 3.22
RABGGTA-214ENST00000560163 TSPOAP1O95153 1857 aa35.13■■■■□ 3.21
RABGGTA-214ENST00000560163 PTPRGP23470 1445 aa35.09■■■■□ 3.21
RABGGTA-214ENST00000560163 ABCC2Q92887 1545 aa34.99■■■■□ 3.19
RABGGTA-214ENST00000560163 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.99■■■■□ 3.19
RABGGTA-214ENST00000560163 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.98■■■■□ 3.19
RABGGTA-214ENST00000560163 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.93■■■■□ 3.18
RABGGTA-214ENST00000560163 GLI2P10070 1586 aa34.92■■■■□ 3.18
RABGGTA-214ENST00000560163 ASXL2Q76L83 1435 aa34.92■■■■□ 3.18
RABGGTA-214ENST00000560163 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
RABGGTA-214ENST00000560163 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
RABGGTA-214ENST00000560163 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.9■■■■□ 3.18
RABGGTA-214ENST00000560163 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.89■■■■□ 3.18
RABGGTA-214ENST00000560163 IQGAP2Q13576 1575 aa34.85■■■■□ 3.17
RABGGTA-214ENST00000560163 UACAQ9BZF9 1416 aa34.81■■■■□ 3.16
RABGGTA-214ENST00000560163 DISP1Q96F81 1524 aa34.8■■■■□ 3.16
RABGGTA-214ENST00000560163 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
RABGGTA-214ENST00000560163 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.74■■■■□ 3.15
RABGGTA-214ENST00000560163 ADGRL1O94910 1474 aa34.72■■■■□ 3.15
RABGGTA-214ENST00000560163 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
RABGGTA-214ENST00000560163 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
RABGGTA-214ENST00000560163 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.7■■■■□ 3.14
RABGGTA-214ENST00000560163 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.66■■■■□ 3.14
RABGGTA-214ENST00000560163 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
RABGGTA-214ENST00000560163 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.59■■■■□ 3.13
RABGGTA-214ENST00000560163 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.58■■■■□ 3.13
RABGGTA-214ENST00000560163 KIAA0556O60303 1618 aa34.55■■■■□ 3.12
RABGGTA-214ENST00000560163 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.47■■■■□ 3.11
RABGGTA-214ENST00000560163 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.44■■■■□ 3.1
RABGGTA-214ENST00000560163 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.36■■■■□ 3.09
RABGGTA-214ENST00000560163 CD109Q6YHK3 1445 aa34.34■■■■□ 3.09
RABGGTA-214ENST00000560163 ABCA8O94911 1581 aa34.32■■■■□ 3.08
RABGGTA-214ENST00000560163 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.31■■■■□ 3.08
RABGGTA-214ENST00000560163 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.3■■■■□ 3.08
RABGGTA-214ENST00000560163 GOLGA3Q08378 1498 aa34.27■■■■□ 3.08
RABGGTA-214ENST00000560163 KCNH8Q96L42 1107 aa34.27■■■■□ 3.08
RABGGTA-214ENST00000560163 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.14■■■■□ 3.06
RABGGTA-214ENST00000560163 PRXQ9BXM0 1461 aa34.13■■■■□ 3.05
RABGGTA-214ENST00000560163 KIF21BO75037 1637 aa34.11■■■■□ 3.05
RABGGTA-214ENST00000560163 ATP10BO94823 1461 aa34.05■■■■□ 3.04
RABGGTA-214ENST00000560163 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.98■■■■□ 3.03
RABGGTA-214ENST00000560163 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.97■■■■□ 3.03
RABGGTA-214ENST00000560163 ARID3CA6NKF2 412 aa33.96■■■■□ 3.03
RABGGTA-214ENST00000560163 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.93■■■■□ 3.02
RABGGTA-214ENST00000560163 P3H3Q8IVL6 736 aa33.92■■■■□ 3.02
RABGGTA-214ENST00000560163 PTPRMP28827 1452 aa33.9■■■■□ 3.02
RABGGTA-214ENST00000560163 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
RABGGTA-214ENST00000560163 RAPGEF3O95398 923 aa33.88■■■■□ 3.01
RABGGTA-214ENST00000560163 FBXO41Q8TF61 875 aa33.87■■■■□ 3.01
RABGGTA-214ENST00000560163 NEO1Q92859 1461 aa33.85■■■■□ 3.01
RABGGTA-214ENST00000560163 SAMD9Q5K651 1589 aa33.83■■■■□ 3.01
RABGGTA-214ENST00000560163 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.79■■■■□ 3
RABGGTA-214ENST00000560163 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.79■■■■□ 3
RABGGTA-214ENST00000560163 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.77■■■■□ 3
RABGGTA-214ENST00000560163 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
RABGGTA-214ENST00000560163 MADDQ8WXG6 1647 aa33.71■■■□□ 2.99
RABGGTA-214ENST00000560163 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.69■■■□□ 2.98
RABGGTA-214ENST00000560163 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
RABGGTA-214ENST00000560163 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
RABGGTA-214ENST00000560163 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
RABGGTA-214ENST00000560163 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.66■■■□□ 2.98
RABGGTA-214ENST00000560163 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
RABGGTA-214ENST00000560163 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.6■■■□□ 2.97
RABGGTA-214ENST00000560163 RICTORQ6R327 1708 aa33.6■■■□□ 2.97
RABGGTA-214ENST00000560163 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
RABGGTA-214ENST00000560163 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.57■■■□□ 2.96
RABGGTA-214ENST00000560163 AKNAQ7Z591 1439 aa33.57■■■□□ 2.96
RABGGTA-214ENST00000560163 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.55■■■□□ 2.96
RABGGTA-214ENST00000560163 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
RABGGTA-214ENST00000560163 FANCAO15360 1455 aa33.51■■■□□ 2.96
RABGGTA-214ENST00000560163 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.51■■■□□ 2.95
RABGGTA-214ENST00000560163 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.48■■■□□ 2.95
RABGGTA-214ENST00000560163 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.47■■■□□ 2.95
RABGGTA-214ENST00000560163 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa33.46■■■□□ 2.95
RABGGTA-214ENST00000560163 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
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RABGGTA-214ENST00000560163 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.43■■■□□ 2.94
RABGGTA-214ENST00000560163 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.43■■■□□ 2.94
RABGGTA-214ENST00000560163 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.42■■■□□ 2.94
RABGGTA-214ENST00000560163 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.39■■■□□ 2.94
RABGGTA-214ENST00000560163 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.39■■■□□ 2.94
RABGGTA-214ENST00000560163 EEA1Q15075 1411 aa33.39■■■□□ 2.94
RABGGTA-214ENST00000560163 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.38■■■□□ 2.93
RABGGTA-214ENST00000560163 HECW1Q76N89 1606 aa33.34■■■□□ 2.93
RABGGTA-214ENST00000560163 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.31■■■□□ 2.92
RABGGTA-214ENST00000560163 PLCH2O75038 1416 aa33.3■■■□□ 2.92
RABGGTA-214ENST00000560163 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.28■■■□□ 2.92
RABGGTA-214ENST00000560163 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
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