RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559876.1

ISG20-208, Transcript of interferon stimulated exonuclease gene 20, human

TSL 3

Gene ISG20, Length 614 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ISG20-208	ENST00000559876	JPH4	Q96JJ6	628 aa		30.45	■■■□□ 2.47
ISG20-208	ENST00000559876	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		30.28	■■■□□ 2.44
ISG20-208	ENST00000559876	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		30.25	■■■□□ 2.43
ISG20-208	ENST00000559876	IGF1R	P08069	1367 aa		30.25	■■■□□ 2.43
ISG20-208	ENST00000559876	MAPKBP1	O60336	1514 aa		30.24	■■■□□ 2.43
ISG20-208	ENST00000559876	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		30.22	■■■□□ 2.43
ISG20-208	ENST00000559876	DIP2B	Q9P265	1576 aa		30.2	■■■□□ 2.43
ISG20-208	ENST00000559876	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		30.2	■■■□□ 2.43
ISG20-208	ENST00000559876	CUL7	Q14999	1698 aa		30.17	■■■□□ 2.42
ISG20-208	ENST00000559876	KIF27	Q86VH2	1401 aa		30.16	■■■□□ 2.42
ISG20-208	ENST00000559876	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	30.12	■■■□□ 2.41
ISG20-208	ENST00000559876	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		30.01	■■■□□ 2.39
ISG20-208	ENST00000559876	PTPRG	P23470	1445 aa		29.98	■■■□□ 2.39
ISG20-208	ENST00000559876	KDM6B	O15054	1643 aa		29.97	■■■□□ 2.39
ISG20-208	ENST00000559876	TSPOAP1	O95153	1857 aa		29.96	■■■□□ 2.39
ISG20-208	ENST00000559876	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	29.92	■■■□□ 2.38
ISG20-208	ENST00000559876	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		29.9	■■■□□ 2.38
ISG20-208	ENST00000559876	ABCC2	Q92887	1545 aa		29.9	■■■□□ 2.38
ISG20-208	ENST00000559876	IQGAP2	Q13576	1575 aa		29.9	■■■□□ 2.38
ISG20-208	ENST00000559876	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		29.87	■■■□□ 2.37
ISG20-208	ENST00000559876	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		29.85	■■■□□ 2.37
ISG20-208	ENST00000559876	DISP1	Q96F81	1524 aa		29.84	■■■□□ 2.37
ISG20-208	ENST00000559876	ASXL2	Q76L83	1435 aa		29.83	■■■□□ 2.37
ISG20-208	ENST00000559876	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
ISG20-208	ENST00000559876	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		29.8	■■■□□ 2.36
ISG20-208	ENST00000559876	GLI2	P10070	1586 aa		29.77	■■■□□ 2.36
ISG20-208	ENST00000559876	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		29.76	■■■□□ 2.35
ISG20-208	ENST00000559876	UACA	Q9BZF9	1416 aa		29.76	■■■□□ 2.35
ISG20-208	ENST00000559876	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		29.71	■■■□□ 2.35
ISG20-208	ENST00000559876	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.69	■■■□□ 2.34
ISG20-208	ENST00000559876	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		29.69	■■■□□ 2.34
ISG20-208	ENST00000559876	KIAA0556	O60303	1618 aa		29.67	■■■□□ 2.34
ISG20-208	ENST00000559876	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	29.66	■■■□□ 2.34
ISG20-208	ENST00000559876	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	29.65	■■■□□ 2.34
ISG20-208	ENST00000559876	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	29.63	■■■□□ 2.33
ISG20-208	ENST00000559876	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		29.63	■■■□□ 2.33
ISG20-208	ENST00000559876	ADGRL1	O94910	1474 aa		29.54	■■■□□ 2.32
ISG20-208	ENST00000559876	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		29.49	■■■□□ 2.31
ISG20-208	ENST00000559876	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		29.48	■■■□□ 2.31
ISG20-208	ENST00000559876	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		29.48	■■■□□ 2.31
ISG20-208	ENST00000559876	ABCA8	O94911	1581 aa		29.43	■■■□□ 2.3
ISG20-208	ENST00000559876	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29.37	■■■□□ 2.29
ISG20-208	ENST00000559876	GOLGA3	Q08378	1498 aa		29.36	■■■□□ 2.29
ISG20-208	ENST00000559876	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		29.32	■■■□□ 2.28
ISG20-208	ENST00000559876	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		29.31	■■■□□ 2.28
ISG20-208	ENST00000559876	CD109	Q6YHK3	1445 aa		29.3	■■■□□ 2.28
ISG20-208	ENST00000559876	KCNH8	Q96L42	1107 aa		29.27	■■■□□ 2.28
ISG20-208	ENST00000559876	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		29.23	■■■□□ 2.27
ISG20-208	ENST00000559876	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
ISG20-208	ENST00000559876	ARID3C	A6NKF2	412 aa		29.17	■■■□□ 2.26
ISG20-208	ENST00000559876	ATP10B	O94823	1461 aa		29.17	■■■□□ 2.26
ISG20-208	ENST00000559876	P3H3	Q8IVL6	736 aa		29.15	■■■□□ 2.26
ISG20-208	ENST00000559876	KIF21B	O75037	1637 aa		29.12	■■■□□ 2.25
ISG20-208	ENST00000559876	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		29.1	■■■□□ 2.25
ISG20-208	ENST00000559876	SAMD9	Q5K651	1589 aa		29.09	■■■□□ 2.25
ISG20-208	ENST00000559876	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		29.07	■■■□□ 2.24
ISG20-208	ENST00000559876	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ISG20-208	ENST00000559876	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		28.98	■■■□□ 2.23
ISG20-208	ENST00000559876	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
ISG20-208	ENST00000559876	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ISG20-208	ENST00000559876	RAPGEF3	O95398	923 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ISG20-208	ENST00000559876	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ISG20-208	ENST00000559876	NEO1	Q92859	1461 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ISG20-208	ENST00000559876	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ISG20-208	ENST00000559876	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ISG20-208	ENST00000559876	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
ISG20-208	ENST00000559876	PTPRM	P28827	1452 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ISG20-208	ENST00000559876	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
ISG20-208	ENST00000559876	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
ISG20-208	ENST00000559876	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
ISG20-208	ENST00000559876	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		28.8	■■■□□ 2.2
ISG20-208	ENST00000559876	EEA1	Q15075	1411 aa		28.78	■■■□□ 2.2
ISG20-208	ENST00000559876	MADD	Q8WXG6	1647 aa		28.76	■■■□□ 2.2
ISG20-208	ENST00000559876	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		28.74	■■■□□ 2.19
ISG20-208	ENST00000559876	RICTOR	Q6R327	1708 aa		28.74	■■■□□ 2.19
ISG20-208	ENST00000559876	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	28.73	■■■□□ 2.19
ISG20-208	ENST00000559876	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		28.71	■■■□□ 2.19
ISG20-208	ENST00000559876	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
ISG20-208	ENST00000559876	AKNA	Q7Z591	1439 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ISG20-208	ENST00000559876	FANCA	O15360	1455 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ISG20-208	ENST00000559876	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ISG20-208	ENST00000559876	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ISG20-208	ENST00000559876	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
ISG20-208	ENST00000559876	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		28.66	■■■□□ 2.18
ISG20-208	ENST00000559876	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
ISG20-208	ENST00000559876	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
ISG20-208	ENST00000559876	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		28.65	■■■□□ 2.18
ISG20-208	ENST00000559876	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		28.63	■■■□□ 2.17
ISG20-208	ENST00000559876	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
ISG20-208	ENST00000559876	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		28.63	■■■□□ 2.17
ISG20-208	ENST00000559876	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		28.6	■■■□□ 2.17
ISG20-208	ENST00000559876	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		28.56	■■■□□ 2.16
ISG20-208	ENST00000559876	FBXO41	Q8TF61	875 aa		28.56	■■■□□ 2.16
ISG20-208	ENST00000559876	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.54	■■■□□ 2.16
ISG20-208	ENST00000559876	PLCH2	O75038	1416 aa		28.5	■■■□□ 2.15
ISG20-208	ENST00000559876	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		28.5	■■■□□ 2.15
ISG20-208	ENST00000559876	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		28.48	■■■□□ 2.15
ISG20-208	ENST00000559876	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		28.48	■■■□□ 2.15
ISG20-208	ENST00000559876	HSPA2	P54652	639 aa		28.46	■■■□□ 2.15
ISG20-208	ENST00000559876	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.46	■■■□□ 2.15

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