RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559277.1

TMC3-AS1-202, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 479 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TSPOAP1O95153 1857 aa21.72■■□□□ 1.07
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.72■■□□□ 1.07
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.7■■□□□ 1.06
TMC3-AS1-202ENST00000559277 JPH4Q96JJ6 628 aa21.67■■□□□ 1.06
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
TMC3-AS1-202ENST00000559277 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.6■■□□□ 1.05
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ADGRL1O94910 1474 aa21.59■■□□□ 1.05
TMC3-AS1-202ENST00000559277 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.59■■□□□ 1.05
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.59■■□□□ 1.05
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TMC3-AS1-202ENST00000559277 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.53■■□□□ 1.04
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TOP2BQ02880 1626 aa21.51■■□□□ 1.03
TMC3-AS1-202ENST00000559277 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
TMC3-AS1-202ENST00000559277 GLI2P10070 1586 aa21.37■■□□□ 1.01
TMC3-AS1-202ENST00000559277 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.34■■□□□ 1.01
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ASXL2Q76L83 1435 aa21.33■■□□□ 1.01
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FBXO41Q8TF61 875 aa21.32■■□□□ 1
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ABCC2Q92887 1545 aa21.3■■□□□ 1
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PTPRGP23470 1445 aa21.29■■□□□ 1
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CUL7Q14999 1698 aa21.28■■□□□ 1
TMC3-AS1-202ENST00000559277 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.27■■□□□ 1
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.26■□□□□ 0.99
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
TMC3-AS1-202ENST00000559277 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
TMC3-AS1-202ENST00000559277 IGF1RP08069 1367 aa21.18■□□□□ 0.98
TMC3-AS1-202ENST00000559277 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.18■□□□□ 0.98
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.17■□□□□ 0.98
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.13■□□□□ 0.97
TMC3-AS1-202ENST00000559277 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.11■□□□□ 0.97
TMC3-AS1-202ENST00000559277 UACAQ9BZF9 1416 aa21.11■□□□□ 0.97
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.07■□□□□ 0.96
TMC3-AS1-202ENST00000559277 KIF21BO75037 1637 aa21.07■□□□□ 0.96
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DISP1Q96F81 1524 aa21.05■□□□□ 0.96
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
TMC3-AS1-202ENST00000559277 IQGAP2Q13576 1575 aa21.02■□□□□ 0.95
TMC3-AS1-202ENST00000559277 LMTK3Q96Q04 1460 aa21■□□□□ 0.95
TMC3-AS1-202ENST00000559277 KIF27Q86VH2 1401 aa20.98■□□□□ 0.95
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.97■□□□□ 0.95
TMC3-AS1-202ENST00000559277 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.96■□□□□ 0.95
TMC3-AS1-202ENST00000559277 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.96■□□□□ 0.95
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.95■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PTPRMP28827 1452 aa20.94■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.93■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CD109Q6YHK3 1445 aa20.91■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ILDR2Q71H61 639 aa20.91■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-202ENST00000559277 KIAA0556O60303 1618 aa20.88■□□□□ 0.93
TMC3-AS1-202ENST00000559277 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.88■□□□□ 0.93
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
TMC3-AS1-202ENST00000559277 KCNH8Q96L42 1107 aa20.83■□□□□ 0.93
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.83■□□□□ 0.92
TMC3-AS1-202ENST00000559277 MADDQ8WXG6 1647 aa20.8■□□□□ 0.92
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SOCS7O14512 581 aa20.8■□□□□ 0.92
TMC3-AS1-202ENST00000559277 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.8■□□□□ 0.92
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ABCA8O94911 1581 aa20.76■□□□□ 0.91
TMC3-AS1-202ENST00000559277 HSPA2P54652 639 aa20.73■□□□□ 0.91
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CERKQ8TCT0 537 aa20.73■□□□□ 0.91
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.72■□□□□ 0.91
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RAPGEF3O95398 923 aa20.7■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.69■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.67■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.64■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.6■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.59■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.59■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ATP10BO94823 1461 aa20.58■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ARID3CA6NKF2 412 aa20.58■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NEO1Q92859 1461 aa20.56■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.55■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.54■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.54■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-202ENST00000559277 GOLGA3Q08378 1498 aa20.53■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RICTORQ6R327 1708 aa20.5■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-202ENST00000559277 STRCQ7RTU9 1775 aa20.47■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.42■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.42■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-202ENST00000559277 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.41■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FANCAO15360 1455 aa20.4■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.4■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-202ENST00000559277 P3H3Q8IVL6 736 aa20.39■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.38■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.37■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-202ENST00000559277 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.36■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-202ENST00000559277 MLECQ14165 292 aa20.36■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-202ENST00000559277 AKNAQ7Z591 1439 aa20.36■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.35■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.34■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.32■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-202ENST00000559277 HECW1Q76N89 1606 aa20.31■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-202ENST00000559277 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.31■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PRXQ9BXM0 1461 aa20.3■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-202ENST00000559277 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.3■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-202ENST00000559277 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SAMD9Q5K651 1589 aa20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms