RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558139.1

LHX4-202, Transcript of LIM homeobox 4, humanhuman

TSL 3

Gene LHX4, Length 721 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4-202ENST00000558139 KDM6BO15054 1643 aa32.32■■■□□ 2.76
LHX4-202ENST00000558139 MAPKBP1O60336 1514 aa32.3■■■□□ 2.76
LHX4-202ENST00000558139 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.28■■■□□ 2.76
LHX4-202ENST00000558139 DIP2BQ9P265 1576 aa32.26■■■□□ 2.75
LHX4-202ENST00000558139 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.12■■■□□ 2.73
LHX4-202ENST00000558139 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.06■■■□□ 2.72
LHX4-202ENST00000558139 TSPOAP1O95153 1857 aa32.03■■■□□ 2.72
LHX4-202ENST00000558139 ADGRL1O94910 1474 aa32.03■■■□□ 2.72
LHX4-202ENST00000558139 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.93■■■□□ 2.7
LHX4-202ENST00000558139 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.92■■■□□ 2.7
LHX4-202ENST00000558139 TOP2BQ02880 1626 aa31.89■■■□□ 2.7
LHX4-202ENST00000558139 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.83■■■□□ 2.69
LHX4-202ENST00000558139 FBXO41Q8TF61 875 aa31.82■■■□□ 2.68
LHX4-202ENST00000558139 PTPRGP23470 1445 aa31.79■■■□□ 2.68
LHX4-202ENST00000558139 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.79■■■□□ 2.68
LHX4-202ENST00000558139 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.74■■■□□ 2.67
LHX4-202ENST00000558139 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
LHX4-202ENST00000558139 ASXL2Q76L83 1435 aa31.73■■■□□ 2.67
LHX4-202ENST00000558139 GLI2P10070 1586 aa31.71■■■□□ 2.67
LHX4-202ENST00000558139 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
LHX4-202ENST00000558139 ABCC2Q92887 1545 aa31.7■■■□□ 2.66
LHX4-202ENST00000558139 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
LHX4-202ENST00000558139 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.61■■■□□ 2.65
LHX4-202ENST00000558139 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.58■■■□□ 2.65
LHX4-202ENST00000558139 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.58■■■□□ 2.65
LHX4-202ENST00000558139 IGF1RP08069 1367 aa31.53■■■□□ 2.64
LHX4-202ENST00000558139 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.51■■■□□ 2.63
LHX4-202ENST00000558139 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
LHX4-202ENST00000558139 UACAQ9BZF9 1416 aa31.48■■■□□ 2.63
LHX4-202ENST00000558139 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
LHX4-202ENST00000558139 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.43■■■□□ 2.62
LHX4-202ENST00000558139 CUL7Q14999 1698 aa31.4■■■□□ 2.62
LHX4-202ENST00000558139 KIF27Q86VH2 1401 aa31.38■■■□□ 2.61
LHX4-202ENST00000558139 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.36■■■□□ 2.61
LHX4-202ENST00000558139 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.3■■■□□ 2.6
LHX4-202ENST00000558139 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.27■■■□□ 2.6
LHX4-202ENST00000558139 IQGAP2Q13576 1575 aa31.22■■■□□ 2.59
LHX4-202ENST00000558139 CD109Q6YHK3 1445 aa31.21■■■□□ 2.59
LHX4-202ENST00000558139 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.21■■■□□ 2.59
LHX4-202ENST00000558139 DISP1Q96F81 1524 aa31.2■■■□□ 2.59
LHX4-202ENST00000558139 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
LHX4-202ENST00000558139 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.18■■■□□ 2.58
LHX4-202ENST00000558139 KCNH8Q96L42 1107 aa31.15■■■□□ 2.58
LHX4-202ENST00000558139 PTPRMP28827 1452 aa31.12■■■□□ 2.57
LHX4-202ENST00000558139 KIF21BO75037 1637 aa31.09■■■□□ 2.57
LHX4-202ENST00000558139 SOCS7O14512 581 aa31.02■■■□□ 2.56
LHX4-202ENST00000558139 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.01■■■□□ 2.55
LHX4-202ENST00000558139 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31■■■□□ 2.55
LHX4-202ENST00000558139 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
LHX4-202ENST00000558139 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.97■■■□□ 2.55
LHX4-202ENST00000558139 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.94■■■□□ 2.54
LHX4-202ENST00000558139 KIAA0556O60303 1618 aa30.94■■■□□ 2.54
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LHX4-202ENST00000558139 CERKQ8TCT0 537 aa30.93■■■□□ 2.54
LHX4-202ENST00000558139 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.92■■■□□ 2.54
LHX4-202ENST00000558139 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
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LHX4-202ENST00000558139 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.83■■■□□ 2.53
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LHX4-202ENST00000558139 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.74■■■□□ 2.51
LHX4-202ENST00000558139 GOLGA3Q08378 1498 aa30.74■■■□□ 2.51
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LHX4-202ENST00000558139 ARID3CA6NKF2 412 aa30.67■■■□□ 2.5
LHX4-202ENST00000558139 NEO1Q92859 1461 aa30.65■■■□□ 2.5
LHX4-202ENST00000558139 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
LHX4-202ENST00000558139 ATP10BO94823 1461 aa30.57■■■□□ 2.48
LHX4-202ENST00000558139 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.57■■■□□ 2.48
LHX4-202ENST00000558139 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.56■■■□□ 2.48
LHX4-202ENST00000558139 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.5■■■□□ 2.47
LHX4-202ENST00000558139 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.49■■■□□ 2.47
LHX4-202ENST00000558139 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
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LHX4-202ENST00000558139 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.46■■■□□ 2.47
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LHX4-202ENST00000558139 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.44■■■□□ 2.46
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LHX4-202ENST00000558139 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.39■■■□□ 2.46
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LHX4-202ENST00000558139 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.27■■■□□ 2.44
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LHX4-202ENST00000558139 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.25■■■□□ 2.43
LHX4-202ENST00000558139 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.25■■■□□ 2.43
LHX4-202ENST00000558139 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.25■■■□□ 2.43
LHX4-202ENST00000558139 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.25■■■□□ 2.43
LHX4-202ENST00000558139 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
LHX4-202ENST00000558139 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.22■■■□□ 2.43
LHX4-202ENST00000558139 PRXQ9BXM0 1461 aa30.19■■■□□ 2.42
LHX4-202ENST00000558139 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.18■■■□□ 2.42
LHX4-202ENST00000558139 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.17■■■□□ 2.42
LHX4-202ENST00000558139 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.17■■■□□ 2.42
LHX4-202ENST00000558139 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.16■■■□□ 2.42
LHX4-202ENST00000558139 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.16■■■□□ 2.42
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