RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556049.1

PITX2-208, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

TSL 2

Gene PITX2, Length 941 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-208ENST00000556049 TOP2BQ02880 1626 aa17.05■□□□□ 0.32
PITX2-208ENST00000556049 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.01■□□□□ 0.31
PITX2-208ENST00000556049 ADAMTS12P58397 1594 aa17.01■□□□□ 0.31
PITX2-208ENST00000556049 NUP160Q12769 1436 aa16.99■□□□□ 0.31
PITX2-208ENST00000556049 CEP170Q5SW79 1584 aa16.98■□□□□ 0.31
PITX2-208ENST00000556049 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.97■□□□□ 0.31
PITX2-208ENST00000556049 JPH4Q96JJ6 628 aa16.96■□□□□ 0.31
PITX2-208ENST00000556049 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.96■□□□□ 0.31
PITX2-208ENST00000556049 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
PITX2-208ENST00000556049 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.92■□□□□ 0.3
PITX2-208ENST00000556049 SHROOM2Q13796 1616 aa16.86■□□□□ 0.29
PITX2-208ENST00000556049 KIF27Q86VH2 1401 aa16.83■□□□□ 0.28
PITX2-208ENST00000556049 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.81■□□□□ 0.28
PITX2-208ENST00000556049 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PITX2-208ENST00000556049 IGF1RP08069 1367 aa16.79■□□□□ 0.28
PITX2-208ENST00000556049 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.75■□□□□ 0.27
PITX2-208ENST00000556049 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.75■□□□□ 0.27
PITX2-208ENST00000556049 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.73■□□□□ 0.27
PITX2-208ENST00000556049 CUL7Q14999 1698 aa16.71■□□□□ 0.27
PITX2-208ENST00000556049 POTEDQ86YR6 584 aa16.7■□□□□ 0.26
PITX2-208ENST00000556049 PTPRGP23470 1445 aa16.69■□□□□ 0.26
PITX2-208ENST00000556049 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.68■□□□□ 0.26
PITX2-208ENST00000556049 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.68■□□□□ 0.26
PITX2-208ENST00000556049 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.66■□□□□ 0.26
PITX2-208ENST00000556049 MAPKBP1O60336 1514 aa16.64■□□□□ 0.25
PITX2-208ENST00000556049 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.63■□□□□ 0.25
PITX2-208ENST00000556049 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.63■□□□□ 0.25
PITX2-208ENST00000556049 DIP2BQ9P265 1576 aa16.58■□□□□ 0.24
PITX2-208ENST00000556049 IQGAP2Q13576 1575 aa16.56■□□□□ 0.24
PITX2-208ENST00000556049 TSPOAP1O95153 1857 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX2-208ENST00000556049 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX2-208ENST00000556049 ABCC2Q92887 1545 aa16.53■□□□□ 0.24
PITX2-208ENST00000556049 KDM6BO15054 1643 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX2-208ENST00000556049 UACAQ9BZF9 1416 aa16.52■□□□□ 0.23
PITX2-208ENST00000556049 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX2-208ENST00000556049 ASXL2Q76L83 1435 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX2-208ENST00000556049 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
PITX2-208ENST00000556049 DISP1Q96F81 1524 aa16.46■□□□□ 0.23
PITX2-208ENST00000556049 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
PITX2-208ENST00000556049 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.46■□□□□ 0.23
PITX2-208ENST00000556049 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.42■□□□□ 0.22
PITX2-208ENST00000556049 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa16.42■□□□□ 0.22
PITX2-208ENST00000556049 KCNH8Q96L42 1107 aa16.4■□□□□ 0.22
PITX2-208ENST00000556049 GLI2P10070 1586 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX2-208ENST00000556049 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX2-208ENST00000556049 KIAA0556O60303 1618 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX2-208ENST00000556049 GOLGA3Q08378 1498 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX2-208ENST00000556049 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
PITX2-208ENST00000556049 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX2-208ENST00000556049 P3H3Q8IVL6 736 aa16.34■□□□□ 0.21
PITX2-208ENST00000556049 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PITX2-208ENST00000556049 ARID3CA6NKF2 412 aa16.33■□□□□ 0.2
PITX2-208ENST00000556049 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.32■□□□□ 0.2
PITX2-208ENST00000556049 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.3■□□□□ 0.2
PITX2-208ENST00000556049 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
PITX2-208ENST00000556049 CD109Q6YHK3 1445 aa16.28■□□□□ 0.2
PITX2-208ENST00000556049 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
PITX2-208ENST00000556049 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
PITX2-208ENST00000556049 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
PITX2-208ENST00000556049 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.28■□□□□ 0.2
PITX2-208ENST00000556049 PRXQ9BXM0 1461 aa16.28■□□□□ 0.2
PITX2-208ENST00000556049 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa16.27■□□□□ 0.2
PITX2-208ENST00000556049 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
PITX2-208ENST00000556049 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
PITX2-208ENST00000556049 ADGRL1O94910 1474 aa16.25■□□□□ 0.19
PITX2-208ENST00000556049 ABCA8O94911 1581 aa16.22■□□□□ 0.19
PITX2-208ENST00000556049 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PITX2-208ENST00000556049 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PITX2-208ENST00000556049 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.19■□□□□ 0.18
PITX2-208ENST00000556049 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.17■□□□□ 0.18
PITX2-208ENST00000556049 ATP10BO94823 1461 aa16.16■□□□□ 0.18
PITX2-208ENST00000556049 EEA1Q15075 1411 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX2-208ENST00000556049 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.11■□□□□ 0.17
PITX2-208ENST00000556049 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX2-208ENST00000556049 RAPGEF3O95398 923 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX2-208ENST00000556049 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PITX2-208ENST00000556049 KCNA4P22459 653 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX2-208ENST00000556049 ARAP3Q8WWN8 1544 aa16.07■□□□□ 0.16
PITX2-208ENST00000556049 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.07■□□□□ 0.16
PITX2-208ENST00000556049 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX2-208ENST00000556049 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PITX2-208ENST00000556049 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PITX2-208ENST00000556049 SAMD9Q5K651 1589 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX2-208ENST00000556049 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PITX2-208ENST00000556049 ABCA9Q8IUA7 1624 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX2-208ENST00000556049 HECW2Q9P2P5 1572 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX2-208ENST00000556049 NEO1Q92859 1461 aa16.02■□□□□ 0.15
PITX2-208ENST00000556049 KIF21BO75037 1637 aa16.01■□□□□ 0.15
PITX2-208ENST00000556049 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PITX2-208ENST00000556049 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PITX2-208ENST00000556049 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PITX2-208ENST00000556049 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.94■□□□□ 0.14
PITX2-208ENST00000556049 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PITX2-208ENST00000556049 AKNAQ7Z591 1439 aa15.94■□□□□ 0.14
PITX2-208ENST00000556049 FANCAO15360 1455 aa15.93■□□□□ 0.14
PITX2-208ENST00000556049 PTPRMP28827 1452 aa15.91■□□□□ 0.14
PITX2-208ENST00000556049 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PITX2-208ENST00000556049 MLECQ14165 292 aa15.89■□□□□ 0.13
PITX2-208ENST00000556049 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.89■□□□□ 0.13
PITX2-208ENST00000556049 FMN1Q68DA7 1419 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms