RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ADAMTS12P58397 1594 aa16.79■□□□□ 0.28
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.76■□□□□ 0.27
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NUP160Q12769 1436 aa16.76■□□□□ 0.27
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CEP170Q5SW79 1584 aa16.76■□□□□ 0.27
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.75■□□□□ 0.27
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.73■□□□□ 0.27
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SHROOM2Q13796 1616 aa16.71■□□□□ 0.27
SRP54-AS1-201ENST00000554945 JPH4Q96JJ6 628 aa16.62■□□□□ 0.25
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.55■□□□□ 0.24
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 CUL7Q14999 1698 aa16.5■□□□□ 0.23
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.49■□□□□ 0.23
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAPKBP1O60336 1514 aa16.45■□□□□ 0.22
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.44■□□□□ 0.22
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.44■□□□□ 0.22
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.44■□□□□ 0.22
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.43■□□□□ 0.22
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 DIP2BQ9P265 1576 aa16.39■□□□□ 0.21
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PTPRGP23470 1445 aa16.35■□□□□ 0.21
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.35■□□□□ 0.21
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.32■□□□□ 0.2
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 TSPOAP1O95153 1857 aa16.31■□□□□ 0.2
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KDM6BO15054 1643 aa16.28■□□□□ 0.2
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ABCC2Q92887 1545 aa16.27■□□□□ 0.2
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.23■□□□□ 0.19
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.23■□□□□ 0.19
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DISP1Q96F81 1524 aa16.23■□□□□ 0.19
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ASXL2Q76L83 1435 aa16.22■□□□□ 0.19
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UACAQ9BZF9 1416 aa16.22■□□□□ 0.19
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GLI2P10070 1586 aa16.21■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.2■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.16■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KIAA0556O60303 1618 aa16.16■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa16.15■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.13■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa16.11■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GOLGA3Q08378 1498 aa16.08■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.08■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-201ENST00000554945 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.05■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-201ENST00000554945 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 ABCA8O94911 1581 aa16.01■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.99■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ADGRL1O94910 1474 aa15.99■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CD109Q6YHK3 1445 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KCNH8Q96L42 1107 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.97■□□□□ 0.15
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 P3H3Q8IVL6 736 aa15.9■□□□□ 0.14
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ATP10BO94823 1461 aa15.89■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SAMD9Q5K651 1589 aa15.87■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.85■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.85■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ABCA9Q8IUA7 1624 aa15.84■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.84■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARID3CA6NKF2 412 aa15.84■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.84■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EEA1Q15075 1411 aa15.83■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HECW2Q9P2P5 1572 aa15.8■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KIF21BO75037 1637 aa15.79■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NEO1Q92859 1461 aa15.77■□□□□ 0.11
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.73■□□□□ 0.11
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RAPGEF3O95398 923 aa15.73■□□□□ 0.11
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.73■□□□□ 0.11
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ADAMTSL3P82987 1691 aa15.7■□□□□ 0.1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.69■□□□□ 0.1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RNF39Q9H2S5 420 aa15.68■□□□□ 0.1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa15.67■□□□□ 0.1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.66■□□□□ 0.1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.65■□□□□ 0.1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PTPRMP28827 1452 aa15.65■□□□□ 0.1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RICTORQ6R327 1708 aa15.65■□□□□ 0.1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AKNAQ7Z591 1439 aa15.64■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FANCAO15360 1455 aa15.64■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.61■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MADDQ8WXG6 1647 aa15.61■□□□□ 0.09
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