RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553070.5

NFE2-204, Transcript of nuclear factor, erythroid 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2, Length 1,523 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2-204ENST00000553070 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.93■■■□□ 2.38
NFE2-204ENST00000553070 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
NFE2-204ENST00000553070 GRIN2AQ12879 1464 aa29.85■■■□□ 2.37
NFE2-204ENST00000553070 SYNJ2O15056 1496 aa29.85■■■□□ 2.37
NFE2-204ENST00000553070 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
NFE2-204ENST00000553070 P3H3Q8IVL6 736 aa29.78■■■□□ 2.36
NFE2-204ENST00000553070 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.76■■■□□ 2.35
NFE2-204ENST00000553070 FBLN2P98095 1184 aa29.75■■■□□ 2.35
NFE2-204ENST00000553070 IQGAP2Q13576 1575 aa29.73■■■□□ 2.35
NFE2-204ENST00000553070 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.71■■■□□ 2.35
NFE2-204ENST00000553070 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.71■■■□□ 2.35
NFE2-204ENST00000553070 SAMD9Q5K651 1589 aa29.71■■■□□ 2.35
NFE2-204ENST00000553070 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
NFE2-204ENST00000553070 CEP170Q5SW79 1584 aa29.71■■■□□ 2.35
NFE2-204ENST00000553070 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.7■■■□□ 2.35
NFE2-204ENST00000553070 NUP160Q12769 1436 aa29.65■■■□□ 2.34
NFE2-204ENST00000553070 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
NFE2-204ENST00000553070 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.62■■■□□ 2.33
NFE2-204ENST00000553070 CHD1O14646 1710 aa29.59■■■□□ 2.33
NFE2-204ENST00000553070 APLP2Q06481 763 aa29.57■■■□□ 2.32
NFE2-204ENST00000553070 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
NFE2-204ENST00000553070 DISP1Q96F81 1524 aa29.51■■■□□ 2.31
NFE2-204ENST00000553070 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
NFE2-204ENST00000553070 FMN1Q68DA7 1419 aa29.48■■■□□ 2.31
NFE2-204ENST00000553070 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.47■■■□□ 2.31
NFE2-204ENST00000553070 JPH4Q96JJ6 628 aa29.45■■■□□ 2.31
NFE2-204ENST00000553070 KIAA0556O60303 1618 aa29.45■■■□□ 2.31
NFE2-204ENST00000553070 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.43■■■□□ 2.3
NFE2-204ENST00000553070 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.42■■■□□ 2.3
NFE2-204ENST00000553070 MAP3K1Q13233 1512 aa29.41■■■□□ 2.3
NFE2-204ENST00000553070 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
NFE2-204ENST00000553070 TIAM1Q13009 1591 aa29.39■■■□□ 2.3
NFE2-204ENST00000553070 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.33■■■□□ 2.29
NFE2-204ENST00000553070 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.32■■■□□ 2.28
NFE2-204ENST00000553070 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.28■■■□□ 2.28
NFE2-204ENST00000553070 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.27■■■□□ 2.28
NFE2-204ENST00000553070 SHROOM2Q13796 1616 aa29.25■■■□□ 2.27
NFE2-204ENST00000553070 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
NFE2-204ENST00000553070 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.24■■■□□ 2.27
NFE2-204ENST00000553070 HECW1Q76N89 1606 aa29.2■■■□□ 2.26
NFE2-204ENST00000553070 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.16■■■□□ 2.26
NFE2-204ENST00000553070 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
NFE2-204ENST00000553070 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.14■■■□□ 2.25
NFE2-204ENST00000553070 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.12■■■□□ 2.25
NFE2-204ENST00000553070 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
NFE2-204ENST00000553070 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.12■■■□□ 2.25
NFE2-204ENST00000553070 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
NFE2-204ENST00000553070 ARID3CA6NKF2 412 aa29.1■■■□□ 2.25
NFE2-204ENST00000553070 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.08■■■□□ 2.25
NFE2-204ENST00000553070 ABCA8O94911 1581 aa29.06■■■□□ 2.24
NFE2-204ENST00000553070 PTPRGP23470 1445 aa29.05■■■□□ 2.24
NFE2-204ENST00000553070 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.05■■■□□ 2.24
NFE2-204ENST00000553070 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.05■■■□□ 2.24
NFE2-204ENST00000553070 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NFE2-204ENST00000553070 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.99■■■□□ 2.23
NFE2-204ENST00000553070 OSCARQ8IYS5 282 aa28.98■■■□□ 2.23
NFE2-204ENST00000553070 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.94■■■□□ 2.22
NFE2-204ENST00000553070 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
NFE2-204ENST00000553070 NCOA2Q15596 1464 aa28.92■■■□□ 2.22
NFE2-204ENST00000553070 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
NFE2-204ENST00000553070 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
NFE2-204ENST00000553070 ARHGEF11O15085 1522 aa28.89■■■□□ 2.22
NFE2-204ENST00000553070 ATP10BO94823 1461 aa28.89■■■□□ 2.21
NFE2-204ENST00000553070 UACAQ9BZF9 1416 aa28.88■■■□□ 2.21
NFE2-204ENST00000553070 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
NFE2-204ENST00000553070 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
NFE2-204ENST00000553070 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.79■■■□□ 2.2
NFE2-204ENST00000553070 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.79■■■□□ 2.2
NFE2-204ENST00000553070 HRCP23327 699 aa28.79■■■□□ 2.2
NFE2-204ENST00000553070 ABCC2Q92887 1545 aa28.78■■■□□ 2.2
NFE2-204ENST00000553070 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
NFE2-204ENST00000553070 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.72■■■□□ 2.19
NFE2-204ENST00000553070 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.72■■■□□ 2.19
NFE2-204ENST00000553070 ITGAEP38570 1179 aa28.72■■■□□ 2.19
NFE2-204ENST00000553070 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.71■■■□□ 2.193e-8■□□□□ 8.2
NFE2-204ENST00000553070 KIF14Q15058 1648 aa28.71■■■□□ 2.19
NFE2-204ENST00000553070 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.7■■■□□ 2.18
NFE2-204ENST00000553070 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.65■■■□□ 2.18
NFE2-204ENST00000553070 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
NFE2-204ENST00000553070 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.62■■■□□ 2.17
NFE2-204ENST00000553070 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
NFE2-204ENST00000553070 MIA2Q96PC5 1412 aa28.61■■■□□ 2.17
NFE2-204ENST00000553070 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.6■■■□□ 2.17
NFE2-204ENST00000553070 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.16
NFE2-204ENST00000553070 PTPRKQ15262 1439 aa28.55■■■□□ 2.16
NFE2-204ENST00000553070 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
NFE2-204ENST00000553070 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
NFE2-204ENST00000553070 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.5■■■□□ 2.15
NFE2-204ENST00000553070 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.49■■■□□ 2.15
NFE2-204ENST00000553070 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
NFE2-204ENST00000553070 KCNH8Q96L42 1107 aa28.43■■■□□ 2.14
NFE2-204ENST00000553070 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.43■■■□□ 2.14
NFE2-204ENST00000553070 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.142e-15■□□□□ 8.8
NFE2-204ENST00000553070 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.41■■■□□ 2.14
NFE2-204ENST00000553070 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.41■■■□□ 2.14
NFE2-204ENST00000553070 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.4■■■□□ 2.14
NFE2-204ENST00000553070 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
NFE2-204ENST00000553070 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
NFE2-204ENST00000553070 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.38■■■□□ 2.13
NFE2-204ENST00000553070 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms