RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.75■■■□□ 2.19
CS-227ENST00000551441 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.64■■■□□ 2.18
CS-227ENST00000551441 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.61■■■□□ 2.17
CS-227ENST00000551441 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.57■■■□□ 2.16
CS-227ENST00000551441 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.51■■■□□ 2.15
CS-227ENST00000551441 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.51■■■□□ 2.15
CS-227ENST00000551441 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
CS-227ENST00000551441 IGF1RP08069 1367 aa28.46■■■□□ 2.15
CS-227ENST00000551441 DIP2BQ9P265 1576 aa28.45■■■□□ 2.15
CS-227ENST00000551441 MAPKBP1O60336 1514 aa28.43■■■□□ 2.14
CS-227ENST00000551441 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.43■■■□□ 2.14
CS-227ENST00000551441 TSPOAP1O95153 1857 aa28.42■■■□□ 2.14
CS-227ENST00000551441 KIF27Q86VH2 1401 aa28.4■■■□□ 2.14
CS-227ENST00000551441 CUL7Q14999 1698 aa28.36■■■□□ 2.13
CS-227ENST00000551441 KDM6BO15054 1643 aa28.32■■■□□ 2.12
CS-227ENST00000551441 PTPRGP23470 1445 aa28.29■■■□□ 2.12
CS-227ENST00000551441 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.28■■■□□ 2.12
CS-227ENST00000551441 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.25■■■□□ 2.11
CS-227ENST00000551441 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.18■■■□□ 2.1
CS-227ENST00000551441 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.17■■■□□ 2.1
CS-227ENST00000551441 ABCC2Q92887 1545 aa28.14■■■□□ 2.1
CS-227ENST00000551441 IQGAP2Q13576 1575 aa28.14■■■□□ 2.1
CS-227ENST00000551441 ASXL2Q76L83 1435 aa28.13■■■□□ 2.09
CS-227ENST00000551441 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CS-227ENST00000551441 DISP1Q96F81 1524 aa28.05■■■□□ 2.08
CS-227ENST00000551441 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.04■■■□□ 2.08
CS-227ENST00000551441 UACAQ9BZF9 1416 aa28.04■■■□□ 2.08
CS-227ENST00000551441 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.01■■■□□ 2.07
CS-227ENST00000551441 GLI2P10070 1586 aa28■■■□□ 2.07
CS-227ENST00000551441 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.95■■■□□ 2.07
CS-227ENST00000551441 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
CS-227ENST00000551441 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CS-227ENST00000551441 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CS-227ENST00000551441 KIAA0556O60303 1618 aa27.91■■■□□ 2.06
CS-227ENST00000551441 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.91■■■□□ 2.06
CS-227ENST00000551441 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.91■■■□□ 2.06
CS-227ENST00000551441 ADGRL1O94910 1474 aa27.9■■■□□ 2.06
CS-227ENST00000551441 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.89■■■□□ 2.06
CS-227ENST00000551441 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.79■■■□□ 2.04
CS-227ENST00000551441 KCNH8Q96L42 1107 aa27.78■■■□□ 2.04
CS-227ENST00000551441 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
CS-227ENST00000551441 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.77■■■□□ 2.04
CS-227ENST00000551441 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.76■■■□□ 2.04
CS-227ENST00000551441 ARID3CA6NKF2 412 aa27.7■■■□□ 2.02
CS-227ENST00000551441 CD109Q6YHK3 1445 aa27.67■■■□□ 2.02
CS-227ENST00000551441 ABCA8O94911 1581 aa27.65■■■□□ 2.02
CS-227ENST00000551441 P3H3Q8IVL6 736 aa27.64■■■□□ 2.02
CS-227ENST00000551441 GOLGA3Q08378 1498 aa27.64■■■□□ 2.01
CS-227ENST00000551441 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.63■■■□□ 2.01
CS-227ENST00000551441 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.61■■■□□ 2.01
CS-227ENST00000551441 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.57■■■□□ 2
CS-227ENST00000551441 PRXQ9BXM0 1461 aa27.56■■■□□ 2
CS-227ENST00000551441 KIF21BO75037 1637 aa27.52■■■□□ 2
CS-227ENST00000551441 ATP10BO94823 1461 aa27.46■■□□□ 1.99
CS-227ENST00000551441 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
CS-227ENST00000551441 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CS-227ENST00000551441 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CS-227ENST00000551441 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CS-227ENST00000551441 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.37■■□□□ 1.97
CS-227ENST00000551441 RAPGEF3O95398 923 aa27.37■■□□□ 1.97
CS-227ENST00000551441 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.34■■□□□ 1.97
CS-227ENST00000551441 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.33■■□□□ 1.97
CS-227ENST00000551441 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.32■■□□□ 1.96
CS-227ENST00000551441 SAMD9Q5K651 1589 aa27.31■■□□□ 1.96
CS-227ENST00000551441 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CS-227ENST00000551441 PTPRMP28827 1452 aa27.24■■□□□ 1.95
CS-227ENST00000551441 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.24■■□□□ 1.95
CS-227ENST00000551441 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.24■■□□□ 1.95
CS-227ENST00000551441 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CS-227ENST00000551441 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.21■■□□□ 1.95
CS-227ENST00000551441 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.21■■□□□ 1.95
CS-227ENST00000551441 NEO1Q92859 1461 aa27.2■■□□□ 1.95
CS-227ENST00000551441 MADDQ8WXG6 1647 aa27.16■■□□□ 1.94
CS-227ENST00000551441 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.16■■□□□ 1.94
CS-227ENST00000551441 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.16■■□□□ 1.94
CS-227ENST00000551441 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.12■■□□□ 1.93
CS-227ENST00000551441 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.11■■□□□ 1.93
CS-227ENST00000551441 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.92
CS-227ENST00000551441 AKNAQ7Z591 1439 aa27.07■■□□□ 1.92
CS-227ENST00000551441 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CS-227ENST00000551441 FBXO41Q8TF61 875 aa27.06■■□□□ 1.92
CS-227ENST00000551441 RICTORQ6R327 1708 aa27.06■■□□□ 1.92
CS-227ENST00000551441 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.05■■□□□ 1.922e-20■□□□□ 10.1
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CS-227ENST00000551441 FANCAO15360 1455 aa27.03■■□□□ 1.92
CS-227ENST00000551441 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.03■■□□□ 1.92
CS-227ENST00000551441 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CS-227ENST00000551441 LMTK3Q96Q04 1460 aa27■■□□□ 1.91
CS-227ENST00000551441 EEA1Q15075 1411 aa27■■□□□ 1.91
CS-227ENST00000551441 HSPA2P54652 639 aa27■■□□□ 1.91
CS-227ENST00000551441 MLECQ14165 292 aa27■■□□□ 1.91
CS-227ENST00000551441 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CS-227ENST00000551441 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.99■■□□□ 1.91
CS-227ENST00000551441 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CS-227ENST00000551441 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.98■■□□□ 1.91
CS-227ENST00000551441 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.96■■□□□ 1.91
CS-227ENST00000551441 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.93■■□□□ 1.9
CS-227ENST00000551441 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.92■■□□□ 1.9
CS-227ENST00000551441 HECW1Q76N89 1606 aa26.9■■□□□ 1.9
CS-227ENST00000551441 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
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