RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550632.5

USP15-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 3

Gene USP15, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-216ENST00000550632 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
USP15-216ENST00000550632 JPH4Q96JJ6 628 aa27.31■■□□□ 1.96
USP15-216ENST00000550632 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
USP15-216ENST00000550632 MAPKBP1O60336 1514 aa27.27■■□□□ 1.96
USP15-216ENST00000550632 TSPOAP1O95153 1857 aa27.25■■□□□ 1.95
USP15-216ENST00000550632 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.21■■□□□ 1.95
USP15-216ENST00000550632 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.17■■□□□ 1.94
USP15-216ENST00000550632 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.11■■□□□ 1.93
USP15-216ENST00000550632 ADGRL1O94910 1474 aa27.08■■□□□ 1.93
USP15-216ENST00000550632 TOP2BQ02880 1626 aa27.07■■□□□ 1.92
USP15-216ENST00000550632 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.06■■□□□ 1.92
USP15-216ENST00000550632 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.01■■□□□ 1.91
USP15-216ENST00000550632 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
USP15-216ENST00000550632 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
USP15-216ENST00000550632 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.86■■□□□ 1.89
USP15-216ENST00000550632 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
USP15-216ENST00000550632 PTPRGP23470 1445 aa26.84■■□□□ 1.89
USP15-216ENST00000550632 ASXL2Q76L83 1435 aa26.83■■□□□ 1.89
USP15-216ENST00000550632 ABCC2Q92887 1545 aa26.8■■□□□ 1.88
USP15-216ENST00000550632 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
USP15-216ENST00000550632 GLI2P10070 1586 aa26.79■■□□□ 1.88
USP15-216ENST00000550632 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.77■■□□□ 1.88
USP15-216ENST00000550632 CUL7Q14999 1698 aa26.71■■□□□ 1.87
USP15-216ENST00000550632 FBXO41Q8TF61 875 aa26.71■■□□□ 1.87
USP15-216ENST00000550632 IGF1RP08069 1367 aa26.69■■□□□ 1.86
USP15-216ENST00000550632 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.69■■□□□ 1.86
USP15-216ENST00000550632 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
USP15-216ENST00000550632 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.64■■□□□ 1.85
USP15-216ENST00000550632 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.63■■□□□ 1.85
USP15-216ENST00000550632 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.61■■□□□ 1.85
USP15-216ENST00000550632 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.6■■□□□ 1.85
USP15-216ENST00000550632 UACAQ9BZF9 1416 aa26.58■■□□□ 1.85
USP15-216ENST00000550632 KIF27Q86VH2 1401 aa26.53■■□□□ 1.84
USP15-216ENST00000550632 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.51■■□□□ 1.83
USP15-216ENST00000550632 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
USP15-216ENST00000550632 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.48■■□□□ 1.83
USP15-216ENST00000550632 IQGAP2Q13576 1575 aa26.48■■□□□ 1.83
USP15-216ENST00000550632 DISP1Q96F81 1524 aa26.46■■□□□ 1.83
USP15-216ENST00000550632 KIF21BO75037 1637 aa26.42■■□□□ 1.82
USP15-216ENST00000550632 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.39■■□□□ 1.82
USP15-216ENST00000550632 CD109Q6YHK3 1445 aa26.35■■□□□ 1.81
USP15-216ENST00000550632 KCNH8Q96L42 1107 aa26.35■■□□□ 1.81
USP15-216ENST00000550632 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.31■■□□□ 1.8
USP15-216ENST00000550632 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.3■■□□□ 1.8
USP15-216ENST00000550632 PTPRMP28827 1452 aa26.29■■□□□ 1.8
USP15-216ENST00000550632 KIAA0556O60303 1618 aa26.27■■□□□ 1.8
USP15-216ENST00000550632 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.26■■□□□ 1.79
USP15-216ENST00000550632 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.26■■□□□ 1.79
USP15-216ENST00000550632 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.21■■□□□ 1.79
USP15-216ENST00000550632 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
USP15-216ENST00000550632 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.14■■□□□ 1.78
USP15-216ENST00000550632 ILDR2Q71H61 639 aa26.12■■□□□ 1.77
USP15-216ENST00000550632 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.11■■□□□ 1.77
USP15-216ENST00000550632 ARID3CA6NKF2 412 aa26.09■■□□□ 1.77
USP15-216ENST00000550632 RAPGEF3O95398 923 aa26.09■■□□□ 1.77
USP15-216ENST00000550632 HSPA2P54652 639 aa26.09■■□□□ 1.77
USP15-216ENST00000550632 MADDQ8WXG6 1647 aa26.09■■□□□ 1.77
USP15-216ENST00000550632 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
USP15-216ENST00000550632 ABCA8O94911 1581 aa26.08■■□□□ 1.77
USP15-216ENST00000550632 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.05■■□□□ 1.76
USP15-216ENST00000550632 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.04■■□□□ 1.76
USP15-216ENST00000550632 CERKQ8TCT0 537 aa26.03■■□□□ 1.76
USP15-216ENST00000550632 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.03■■□□□ 1.76
USP15-216ENST00000550632 SOCS7O14512 581 aa26.02■■□□□ 1.76
USP15-216ENST00000550632 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
USP15-216ENST00000550632 GOLGA3Q08378 1498 aa25.95■■□□□ 1.74
USP15-216ENST00000550632 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.92■■□□□ 1.74
USP15-216ENST00000550632 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.92■■□□□ 1.74
USP15-216ENST00000550632 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.92■■□□□ 1.74
USP15-216ENST00000550632 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.91■■□□□ 1.74
USP15-216ENST00000550632 ATP10BO94823 1461 aa25.9■■□□□ 1.74
USP15-216ENST00000550632 NEO1Q92859 1461 aa25.86■■□□□ 1.73
USP15-216ENST00000550632 P3H3Q8IVL6 736 aa25.85■■□□□ 1.73
USP15-216ENST00000550632 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.81■■□□□ 1.72
USP15-216ENST00000550632 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
USP15-216ENST00000550632 MLECQ14165 292 aa25.75■■□□□ 1.71
USP15-216ENST00000550632 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
USP15-216ENST00000550632 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.73■■□□□ 1.71
USP15-216ENST00000550632 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
USP15-216ENST00000550632 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.72■■□□□ 1.71
USP15-216ENST00000550632 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
USP15-216ENST00000550632 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.71■■□□□ 1.71
USP15-216ENST00000550632 RICTORQ6R327 1708 aa25.7■■□□□ 1.7
USP15-216ENST00000550632 FANCAO15360 1455 aa25.7■■□□□ 1.7
USP15-216ENST00000550632 AKNAQ7Z591 1439 aa25.67■■□□□ 1.7
USP15-216ENST00000550632 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.67■■□□□ 1.7
USP15-216ENST00000550632 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.64■■□□□ 1.7
USP15-216ENST00000550632 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.63■■□□□ 1.69
USP15-216ENST00000550632 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.63■■□□□ 1.69
USP15-216ENST00000550632 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.62■■□□□ 1.69
USP15-216ENST00000550632 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
USP15-216ENST00000550632 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.61■■□□□ 1.69
USP15-216ENST00000550632 PRXQ9BXM0 1461 aa25.6■■□□□ 1.69
USP15-216ENST00000550632 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.58■■□□□ 1.68
USP15-216ENST00000550632 STRCQ7RTU9 1775 aa25.57■■□□□ 1.68
USP15-216ENST00000550632 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.57■■□□□ 1.68
USP15-216ENST00000550632 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.56■■□□□ 1.68
USP15-216ENST00000550632 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
USP15-216ENST00000550632 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.54■■□□□ 1.68
USP15-216ENST00000550632 HECW1Q76N89 1606 aa25.52■■□□□ 1.68
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