RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 TSPOAP1O95153 1857 aa43.39■■■■■ 4.54
PRDM4-202ENST00000547188 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.38■■■■■ 4.53
PRDM4-202ENST00000547188 JPH4Q96JJ6 628 aa43.36■■■■■ 4.53
PRDM4-202ENST00000547188 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.36■■■■■ 4.53
PRDM4-202ENST00000547188 MAPKBP1O60336 1514 aa43.36■■■■■ 4.53
PRDM4-202ENST00000547188 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.26■■■■■ 4.52
PRDM4-202ENST00000547188 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.22■■■■■ 4.51
PRDM4-202ENST00000547188 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.12■■■■■ 4.49
PRDM4-202ENST00000547188 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.11■■■■■ 4.49
PRDM4-202ENST00000547188 TOP2BQ02880 1626 aa43.08■■■■■ 4.49
PRDM4-202ENST00000547188 ADGRL1O94910 1474 aa42.99■■■■■ 4.47
PRDM4-202ENST00000547188 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.89■■■■■ 4.46
PRDM4-202ENST00000547188 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
PRDM4-202ENST00000547188 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
PRDM4-202ENST00000547188 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.7■■■■■ 4.43
PRDM4-202ENST00000547188 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.42
PRDM4-202ENST00000547188 PTPRGP23470 1445 aa42.63■■■■■ 4.41
PRDM4-202ENST00000547188 ASXL2Q76L83 1435 aa42.62■■■■■ 4.41
PRDM4-202ENST00000547188 GLI2P10070 1586 aa42.61■■■■■ 4.41
PRDM4-202ENST00000547188 ABCC2Q92887 1545 aa42.57■■■■■ 4.41
PRDM4-202ENST00000547188 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.53■■■■■ 4.4
PRDM4-202ENST00000547188 CUL7Q14999 1698 aa42.53■■■■■ 4.4
PRDM4-202ENST00000547188 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
PRDM4-202ENST00000547188 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.39■■■■■ 4.38
PRDM4-202ENST00000547188 IGF1RP08069 1367 aa42.39■■■■■ 4.38
PRDM4-202ENST00000547188 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.38■■■■■ 4.38
PRDM4-202ENST00000547188 FBXO41Q8TF61 875 aa42.37■■■■■ 4.37
PRDM4-202ENST00000547188 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
PRDM4-202ENST00000547188 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.31■■■■■ 4.36
PRDM4-202ENST00000547188 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.29■■■■■ 4.36
PRDM4-202ENST00000547188 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.29■■■■■ 4.36
PRDM4-202ENST00000547188 UACAQ9BZF9 1416 aa42.24■■■■■ 4.35
PRDM4-202ENST00000547188 KIF27Q86VH2 1401 aa42.17■■■■■ 4.34
PRDM4-202ENST00000547188 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.15■■■■■ 4.34
PRDM4-202ENST00000547188 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
PRDM4-202ENST00000547188 IQGAP2Q13576 1575 aa42.12■■■■■ 4.33
PRDM4-202ENST00000547188 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.07■■■■■ 4.33
PRDM4-202ENST00000547188 DISP1Q96F81 1524 aa42.05■■■■■ 4.32
PRDM4-202ENST00000547188 KIF21BO75037 1637 aa42■■■■■ 4.31
PRDM4-202ENST00000547188 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.92■■■■■ 4.3
PRDM4-202ENST00000547188 CD109Q6YHK3 1445 aa41.85■■■■■ 4.29
PRDM4-202ENST00000547188 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.83■■■■■ 4.29
PRDM4-202ENST00000547188 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.83■■■■■ 4.29
PRDM4-202ENST00000547188 KCNH8Q96L42 1107 aa41.79■■■■■ 4.28
PRDM4-202ENST00000547188 KIAA0556O60303 1618 aa41.78■■■■■ 4.28
PRDM4-202ENST00000547188 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.76■■■■■ 4.28
PRDM4-202ENST00000547188 PTPRMP28827 1452 aa41.73■■■■■ 4.27
PRDM4-202ENST00000547188 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.72■■■■■ 4.27
PRDM4-202ENST00000547188 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.68■■■■■ 4.26
PRDM4-202ENST00000547188 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
PRDM4-202ENST00000547188 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.55■■■■■ 4.24
PRDM4-202ENST00000547188 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.5■■■■■ 4.23
PRDM4-202ENST00000547188 ABCA8O94911 1581 aa41.47■■■■■ 4.23
PRDM4-202ENST00000547188 MADDQ8WXG6 1647 aa41.46■■■■■ 4.23
PRDM4-202ENST00000547188 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.45■■■■■ 4.23
PRDM4-202ENST00000547188 RAPGEF3O95398 923 aa41.38■■■■■ 4.21
PRDM4-202ENST00000547188 ILDR2Q71H61 639 aa41.37■■■■■ 4.21
PRDM4-202ENST00000547188 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
PRDM4-202ENST00000547188 HSPA2P54652 639 aa41.35■■■■■ 4.21
PRDM4-202ENST00000547188 ARID3CA6NKF2 412 aa41.33■■■■■ 4.21
PRDM4-202ENST00000547188 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.33■■■■■ 4.21
PRDM4-202ENST00000547188 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
PRDM4-202ENST00000547188 CERKQ8TCT0 537 aa41.29■■■■■ 4.2
PRDM4-202ENST00000547188 GOLGA3Q08378 1498 aa41.27■■■■■ 4.2
PRDM4-202ENST00000547188 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.26■■■■■ 4.2
PRDM4-202ENST00000547188 SOCS7O14512 581 aa41.25■■■■■ 4.19
PRDM4-202ENST00000547188 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.23■■■■■ 4.19
PRDM4-202ENST00000547188 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.22■■■■■ 4.19
PRDM4-202ENST00000547188 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.22■■■■■ 4.19
PRDM4-202ENST00000547188 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.2■■■■■ 4.19
PRDM4-202ENST00000547188 ATP10BO94823 1461 aa41.15■■■■■ 4.18
PRDM4-202ENST00000547188 NEO1Q92859 1461 aa41.11■■■■■ 4.17
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.03■■■■■ 4.16
PRDM4-202ENST00000547188 P3H3Q8IVL6 736 aa40.99■■■■■ 4.15
PRDM4-202ENST00000547188 RICTORQ6R327 1708 aa40.92■■■■■ 4.14
PRDM4-202ENST00000547188 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.92■■■■■ 4.14
PRDM4-202ENST00000547188 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
PRDM4-202ENST00000547188 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
PRDM4-202ENST00000547188 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
PRDM4-202ENST00000547188 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
PRDM4-202ENST00000547188 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.84■■■■■ 4.13
PRDM4-202ENST00000547188 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.84■■■■■ 4.13
PRDM4-202ENST00000547188 FANCAO15360 1455 aa40.83■■■■■ 4.13
PRDM4-202ENST00000547188 MLECQ14165 292 aa40.83■■■■■ 4.13
PRDM4-202ENST00000547188 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.81■■■■■ 4.12
PRDM4-202ENST00000547188 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.78■■■■■ 4.12
PRDM4-202ENST00000547188 AKNAQ7Z591 1439 aa40.77■■■■■ 4.12
PRDM4-202ENST00000547188 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.76■■■■■ 4.11
PRDM4-202ENST00000547188 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.75■■■■■ 4.11
PRDM4-202ENST00000547188 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.72■■■■■ 4.11
PRDM4-202ENST00000547188 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.72■■■■■ 4.11
PRDM4-202ENST00000547188 STRCQ7RTU9 1775 aa40.69■■■■■ 4.1
PRDM4-202ENST00000547188 PRXQ9BXM0 1461 aa40.69■■■■■ 4.1
PRDM4-202ENST00000547188 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.69■■■■■ 4.1
PRDM4-202ENST00000547188 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.67■■■■■ 4.1
PRDM4-202ENST00000547188 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.65■■■■■ 4.1
PRDM4-202ENST00000547188 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.62■■■■■ 4.09
PRDM4-202ENST00000547188 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
PRDM4-202ENST00000547188 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
PRDM4-202ENST00000547188 SAMD9Q5K651 1589 aa40.59■■■■■ 4.09
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