RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543656.1

RUSC1-AS1-204, RUSC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RUSC1-AS1, Length 1,357 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.11■■■□□ 2.25
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 JPH4Q96JJ6 628 aa29.08■■■□□ 2.25
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DIP2BQ9P265 1576 aa29.07■■■□□ 2.24
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MAPKBP1O60336 1514 aa29.05■■■□□ 2.24
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.05■■■□□ 2.24
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.01■■■□□ 2.23
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29■■■□□ 2.23
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KDM6BO15054 1643 aa28.99■■■□□ 2.23
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.23
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TSPOAP1O95153 1857 aa28.94■■■□□ 2.22
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.84■■■□□ 2.21
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.75■■■□□ 2.19
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ADGRL1O94910 1474 aa28.62■■■□□ 2.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PTPRGP23470 1445 aa28.62■■■□□ 2.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CUL7Q14999 1698 aa28.61■■■□□ 2.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 IGF1RP08069 1367 aa28.61■■■□□ 2.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ABCC2Q92887 1545 aa28.58■■■□□ 2.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ASXL2Q76L83 1435 aa28.57■■■□□ 2.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GLI2P10070 1586 aa28.55■■■□□ 2.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KIF27Q86VH2 1401 aa28.52■■■□□ 2.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.51■■■□□ 2.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.5■■■□□ 2.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.47■■■□□ 2.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.46■■■□□ 2.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.43■■■□□ 2.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.42■■■□□ 2.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 IQGAP2Q13576 1575 aa28.4■■■□□ 2.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.4■■■□□ 2.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 UACAQ9BZF9 1416 aa28.39■■■□□ 2.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DISP1Q96F81 1524 aa28.34■■■□□ 2.13
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.33■■■□□ 2.13
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.32■■■□□ 2.12
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 EEA1Q15075 1411 aa28.22■■■□□ 2.11
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KIAA0556O60303 1618 aa28.19■■■□□ 2.1
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.19■■■□□ 2.1
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.17■■■□□ 2.1
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.11■■■□□ 2.09
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KIF21BO75037 1637 aa28.08■■■□□ 2.09
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.07■■■□□ 2.08
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.06■■■□□ 2.08
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.06■■■□□ 2.08
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CD109Q6YHK3 1445 aa28.05■■■□□ 2.08
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KCNH8Q96L42 1107 aa27.99■■■□□ 2.07
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FBXO41Q8TF61 875 aa27.98■■■□□ 2.07
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ABCA8O94911 1581 aa27.95■■■□□ 2.07
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.94■■■□□ 2.06
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PRXQ9BXM0 1461 aa27.93■■■□□ 2.06
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.86■■■□□ 2.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PTPRMP28827 1452 aa27.85■■■□□ 2.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GOLGA3Q08378 1498 aa27.85■■■□□ 2.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.85■■■□□ 2.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ARID3CA6NKF2 412 aa27.76■■■□□ 2.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.73■■■□□ 2.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MADDQ8WXG6 1647 aa27.72■■■□□ 2.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.72■■■□□ 2.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RAPGEF3O95398 923 aa27.71■■■□□ 2.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ATP10BO94823 1461 aa27.7■■■□□ 2.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.69■■■□□ 2.02
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.68■■■□□ 2.02
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.66■■■□□ 2.02
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.62■■■□□ 2.01
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NEO1Q92859 1461 aa27.62■■■□□ 2.01
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 P3H3Q8IVL6 736 aa27.61■■■□□ 2.01
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.55■■■□□ 2
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.53■■■□□ 2
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.52■■■□□ 2
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 HSPA2P54652 639 aa27.51■■□□□ 1.99
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SAMD9Q5K651 1589 aa27.49■■□□□ 1.99
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RICTORQ6R327 1708 aa27.48■■□□□ 1.99
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.47■■□□□ 1.99
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.44■■□□□ 1.98
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CERKQ8TCT0 537 aa27.38■■□□□ 1.97
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 AKNAQ7Z591 1439 aa27.38■■□□□ 1.97
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FANCAO15360 1455 aa27.37■■□□□ 1.97
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.37■■□□□ 1.97
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.34■■□□□ 1.97
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.34■■□□□ 1.97
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.34■■□□□ 1.97
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.34■■□□□ 1.97
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.34■■□□□ 1.97
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.32■■□□□ 1.96
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.31■■□□□ 1.96
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.3■■□□□ 1.96
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MLECQ14165 292 aa27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.2 ms