RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537529.6

MKS1-204, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MKS1, Length 2,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-204ENST00000537529 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
MKS1-204ENST00000537529 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.59■■□□□ 1.37
MKS1-204ENST00000537529 TIAM1Q13009 1591 aa23.58■■□□□ 1.36
MKS1-204ENST00000537529 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
MKS1-204ENST00000537529 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
MKS1-204ENST00000537529 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.49■■□□□ 1.35
MKS1-204ENST00000537529 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.49■■□□□ 1.35
MKS1-204ENST00000537529 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.352e-8■■■■■ 48
MKS1-204ENST00000537529 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.47■■□□□ 1.35
MKS1-204ENST00000537529 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.46■■□□□ 1.35
MKS1-204ENST00000537529 P3H3Q8IVL6 736 aa23.45■■□□□ 1.35
MKS1-204ENST00000537529 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.45■■□□□ 1.34
MKS1-204ENST00000537529 PBRM1Q86U86 1689 aa23.45■■□□□ 1.34
MKS1-204ENST00000537529 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.44■■□□□ 1.34
MKS1-204ENST00000537529 WDR62O43379 1518 aa23.43■■□□□ 1.34
MKS1-204ENST00000537529 SAMD9Q5K651 1589 aa23.42■■□□□ 1.34
MKS1-204ENST00000537529 FMN1Q68DA7 1419 aa23.42■■□□□ 1.34
MKS1-204ENST00000537529 IFT140Q96RY7 1462 aa23.4■■□□□ 1.34
MKS1-204ENST00000537529 ADAMTS12P58397 1594 aa23.37■■□□□ 1.33
MKS1-204ENST00000537529 GRIN2BQ13224 1484 aa23.36■■□□□ 1.33
MKS1-204ENST00000537529 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.33■■□□□ 1.32
MKS1-204ENST00000537529 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
MKS1-204ENST00000537529 ERCC6Q03468 1493 aa23.29■■□□□ 1.32
MKS1-204ENST00000537529 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.29■■□□□ 1.32
MKS1-204ENST00000537529 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.29■■□□□ 1.32
MKS1-204ENST00000537529 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
MKS1-204ENST00000537529 IQGAP2Q13576 1575 aa23.25■■□□□ 1.31
MKS1-204ENST00000537529 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
MKS1-204ENST00000537529 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
MKS1-204ENST00000537529 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
MKS1-204ENST00000537529 ITGAEP38570 1179 aa23.18■■□□□ 1.3
MKS1-204ENST00000537529 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.16■■□□□ 1.3
MKS1-204ENST00000537529 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
MKS1-204ENST00000537529 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.14■■□□□ 1.29
MKS1-204ENST00000537529 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.14■■□□□ 1.29
MKS1-204ENST00000537529 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
MKS1-204ENST00000537529 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
MKS1-204ENST00000537529 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.13■■□□□ 1.29
MKS1-204ENST00000537529 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.11■■□□□ 1.29
MKS1-204ENST00000537529 HECW1Q76N89 1606 aa23.11■■□□□ 1.29
MKS1-204ENST00000537529 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.1■■□□□ 1.29
MKS1-204ENST00000537529 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.1■■□□□ 1.29
MKS1-204ENST00000537529 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.1■■□□□ 1.29
MKS1-204ENST00000537529 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
MKS1-204ENST00000537529 GRIN2AQ12879 1464 aa23.09■■□□□ 1.29
MKS1-204ENST00000537529 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.09■■□□□ 1.29
MKS1-204ENST00000537529 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
MKS1-204ENST00000537529 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
MKS1-204ENST00000537529 NCOA2Q15596 1464 aa23.05■■□□□ 1.28
MKS1-204ENST00000537529 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.01■■□□□ 1.27
MKS1-204ENST00000537529 KIAA0556O60303 1618 aa23.01■■□□□ 1.27
MKS1-204ENST00000537529 SYNJ2O15056 1496 aa23■■□□□ 1.27
MKS1-204ENST00000537529 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
MKS1-204ENST00000537529 ARHGEF11O15085 1522 aa22.98■■□□□ 1.27
MKS1-204ENST00000537529 DISP1Q96F81 1524 aa22.97■■□□□ 1.27
MKS1-204ENST00000537529 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.97■■□□□ 1.27
MKS1-204ENST00000537529 MAPKBP1O60336 1514 aa22.94■■□□□ 1.26
MKS1-204ENST00000537529 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
MKS1-204ENST00000537529 CEP170Q5SW79 1584 aa22.92■■□□□ 1.26
MKS1-204ENST00000537529 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
MKS1-204ENST00000537529 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.9■■□□□ 1.26
MKS1-204ENST00000537529 NUP160Q12769 1436 aa22.87■■□□□ 1.25
MKS1-204ENST00000537529 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.87■■□□□ 1.25
MKS1-204ENST00000537529 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
MKS1-204ENST00000537529 HFM1A2PYH4 1435 aa22.85■■□□□ 1.25
MKS1-204ENST00000537529 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
MKS1-204ENST00000537529 PTPRKQ15262 1439 aa22.83■■□□□ 1.24
MKS1-204ENST00000537529 MIA2Q96PC5 1412 aa22.82■■□□□ 1.24
MKS1-204ENST00000537529 FBLN2P98095 1184 aa22.81■■□□□ 1.24
MKS1-204ENST00000537529 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.8■■□□□ 1.24
MKS1-204ENST00000537529 NAIPQ13075 1403 aa22.76■■□□□ 1.23
MKS1-204ENST00000537529 ARID3CA6NKF2 412 aa22.76■■□□□ 1.23
MKS1-204ENST00000537529 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
MKS1-204ENST00000537529 UACAQ9BZF9 1416 aa22.73■■□□□ 1.23
MKS1-204ENST00000537529 JPH4Q96JJ6 628 aa22.73■■□□□ 1.23
MKS1-204ENST00000537529 AKNAQ7Z591 1439 aa22.72■■□□□ 1.23
MKS1-204ENST00000537529 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.7■■□□□ 1.23
MKS1-204ENST00000537529 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.7■■□□□ 1.22
MKS1-204ENST00000537529 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.69■■□□□ 1.22
MKS1-204ENST00000537529 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
MKS1-204ENST00000537529 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.66■■□□□ 1.22
MKS1-204ENST00000537529 NEUROD1Q13562 356 aa22.64■■□□□ 1.22
MKS1-204ENST00000537529 ABCA8O94911 1581 aa22.62■■□□□ 1.21
MKS1-204ENST00000537529 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.62■■□□□ 1.21
MKS1-204ENST00000537529 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
MKS1-204ENST00000537529 MIER1Q8N108 512 aa22.61■■□□□ 1.21
MKS1-204ENST00000537529 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
MKS1-204ENST00000537529 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
MKS1-204ENST00000537529 DAPK1P53355 1430 aa22.6■■□□□ 1.21
MKS1-204ENST00000537529 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.6■■□□□ 1.21
MKS1-204ENST00000537529 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.59■■□□□ 1.21
MKS1-204ENST00000537529 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.59■■□□□ 1.21
MKS1-204ENST00000537529 ROCK1Q13464 1354 aa22.57■■□□□ 1.2
MKS1-204ENST00000537529 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
MKS1-204ENST00000537529 CHD1O14646 1710 aa22.55■■□□□ 1.2
MKS1-204ENST00000537529 ABCC5O15440 1437 aa22.54■■□□□ 1.2
MKS1-204ENST00000537529 KIF14Q15058 1648 aa22.53■■□□□ 1.2
MKS1-204ENST00000537529 TONSLQ96HA7 1378 aa22.53■■□□□ 1.2
MKS1-204ENST00000537529 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
MKS1-204ENST00000537529 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.6 ms