RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536072.6

EDC4-202, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, humanhuman

TSL 2

Gene EDC4, Length 2,375 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4-202ENST00000536072 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.97■■□□□ 1.59
EDC4-202ENST00000536072 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.95■■□□□ 1.59
EDC4-202ENST00000536072 TIAM1Q13009 1591 aa24.94■■□□□ 1.58
EDC4-202ENST00000536072 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.93■■□□□ 1.58
EDC4-202ENST00000536072 MAP3K1Q13233 1512 aa24.91■■□□□ 1.58
EDC4-202ENST00000536072 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
EDC4-202ENST00000536072 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.581e-6■■■□□ 18.2
EDC4-202ENST00000536072 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
EDC4-202ENST00000536072 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
EDC4-202ENST00000536072 PBRM1Q86U86 1689 aa24.86■■□□□ 1.57
EDC4-202ENST00000536072 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.85■■□□□ 1.57
EDC4-202ENST00000536072 WDR62O43379 1518 aa24.84■■□□□ 1.57
EDC4-202ENST00000536072 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.84■■□□□ 1.57
EDC4-202ENST00000536072 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.8■■□□□ 1.56
EDC4-202ENST00000536072 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.8■■□□□ 1.56
EDC4-202ENST00000536072 IFT140Q96RY7 1462 aa24.8■■□□□ 1.56
EDC4-202ENST00000536072 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.8■■□□□ 1.56
EDC4-202ENST00000536072 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
EDC4-202ENST00000536072 ERCC6Q03468 1493 aa24.79■■□□□ 1.56
EDC4-202ENST00000536072 SAMD9Q5K651 1589 aa24.78■■□□□ 1.56
EDC4-202ENST00000536072 GRIN2BQ13224 1484 aa24.78■■□□□ 1.56
EDC4-202ENST00000536072 FMN1Q68DA7 1419 aa24.77■■□□□ 1.56
EDC4-202ENST00000536072 ADAMTS12P58397 1594 aa24.76■■□□□ 1.55
EDC4-202ENST00000536072 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.73■■□□□ 1.55
EDC4-202ENST00000536072 ITGAEP38570 1179 aa24.73■■□□□ 1.55
EDC4-202ENST00000536072 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.72■■□□□ 1.55
EDC4-202ENST00000536072 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
EDC4-202ENST00000536072 IQGAP2Q13576 1575 aa24.64■■□□□ 1.53
EDC4-202ENST00000536072 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
EDC4-202ENST00000536072 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
EDC4-202ENST00000536072 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
EDC4-202ENST00000536072 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.58■■□□□ 1.53
EDC4-202ENST00000536072 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.56■■□□□ 1.52
EDC4-202ENST00000536072 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.52■■□□□ 1.52
EDC4-202ENST00000536072 GRIN2AQ12879 1464 aa24.51■■□□□ 1.51
EDC4-202ENST00000536072 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.5■■□□□ 1.51
EDC4-202ENST00000536072 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.5■■□□□ 1.51
EDC4-202ENST00000536072 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.48■■□□□ 1.51
EDC4-202ENST00000536072 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
EDC4-202ENST00000536072 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
EDC4-202ENST00000536072 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.45■■□□□ 1.5
EDC4-202ENST00000536072 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.45■■□□□ 1.5
EDC4-202ENST00000536072 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
EDC4-202ENST00000536072 NCOA2Q15596 1464 aa24.43■■□□□ 1.5
EDC4-202ENST00000536072 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
EDC4-202ENST00000536072 HECW1Q76N89 1606 aa24.43■■□□□ 1.5
EDC4-202ENST00000536072 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.42■■□□□ 1.5
EDC4-202ENST00000536072 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.54e-8■■□□□ 14.3
EDC4-202ENST00000536072 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.41■■□□□ 1.5
EDC4-202ENST00000536072 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.41■■□□□ 1.5
EDC4-202ENST00000536072 DISP1Q96F81 1524 aa24.4■■□□□ 1.5
EDC4-202ENST00000536072 SYNJ2O15056 1496 aa24.4■■□□□ 1.5
EDC4-202ENST00000536072 FBLN2P98095 1184 aa24.4■■□□□ 1.5
EDC4-202ENST00000536072 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
EDC4-202ENST00000536072 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
EDC4-202ENST00000536072 KIAA0556O60303 1618 aa24.38■■□□□ 1.49
EDC4-202ENST00000536072 ARID3CA6NKF2 412 aa24.38■■□□□ 1.49
EDC4-202ENST00000536072 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.36■■□□□ 1.49
EDC4-202ENST00000536072 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
EDC4-202ENST00000536072 CEP170Q5SW79 1584 aa24.35■■□□□ 1.49
EDC4-202ENST00000536072 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
EDC4-202ENST00000536072 ARHGEF11O15085 1522 aa24.31■■□□□ 1.48
EDC4-202ENST00000536072 MAPKBP1O60336 1514 aa24.3■■□□□ 1.48
EDC4-202ENST00000536072 PTPRKQ15262 1439 aa24.28■■□□□ 1.48
EDC4-202ENST00000536072 NUP160Q12769 1436 aa24.26■■□□□ 1.47
EDC4-202ENST00000536072 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.24■■□□□ 1.47
EDC4-202ENST00000536072 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
EDC4-202ENST00000536072 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.22■■□□□ 1.47
EDC4-202ENST00000536072 JPH4Q96JJ6 628 aa24.22■■□□□ 1.47
EDC4-202ENST00000536072 HFM1A2PYH4 1435 aa24.17■■□□□ 1.46
EDC4-202ENST00000536072 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
EDC4-202ENST00000536072 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.16■■□□□ 1.46
EDC4-202ENST00000536072 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.15■■□□□ 1.46
EDC4-202ENST00000536072 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.14■■□□□ 1.45
EDC4-202ENST00000536072 NAIPQ13075 1403 aa24.12■■□□□ 1.45
EDC4-202ENST00000536072 MIA2Q96PC5 1412 aa24.11■■□□□ 1.45
EDC4-202ENST00000536072 NEUROD1Q13562 356 aa24.1■■□□□ 1.45
EDC4-202ENST00000536072 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.1■■□□□ 1.45
EDC4-202ENST00000536072 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
EDC4-202ENST00000536072 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.07■■□□□ 1.44
EDC4-202ENST00000536072 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
EDC4-202ENST00000536072 UACAQ9BZF9 1416 aa24.04■■□□□ 1.44
EDC4-202ENST00000536072 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
EDC4-202ENST00000536072 MIER1Q8N108 512 aa24■■□□□ 1.43
EDC4-202ENST00000536072 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
EDC4-202ENST00000536072 CHD1O14646 1710 aa23.97■■□□□ 1.43
EDC4-202ENST00000536072 ABCA8O94911 1581 aa23.97■■□□□ 1.43
EDC4-202ENST00000536072 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.95■■□□□ 1.43
EDC4-202ENST00000536072 AKNAQ7Z591 1439 aa23.95■■□□□ 1.42
EDC4-202ENST00000536072 DAPK1P53355 1430 aa23.94■■□□□ 1.42
EDC4-202ENST00000536072 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.94■■□□□ 1.42
EDC4-202ENST00000536072 KIF14Q15058 1648 aa23.94■■□□□ 1.42
EDC4-202ENST00000536072 KDM6BO15054 1643 aa23.93■■□□□ 1.42
EDC4-202ENST00000536072 ABCC5O15440 1437 aa23.92■■□□□ 1.42
EDC4-202ENST00000536072 ATP10BO94823 1461 aa23.91■■□□□ 1.42
EDC4-202ENST00000536072 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
EDC4-202ENST00000536072 PTPRGP23470 1445 aa23.9■■□□□ 1.42
EDC4-202ENST00000536072 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
EDC4-202ENST00000536072 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
EDC4-202ENST00000536072 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.9■■□□□ 1.42
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