RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534967.1

GOLGA3-204, Transcript of golgin A3, humanhuman

TSL 3

Gene GOLGA3, Length 484 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3-204ENST00000534967 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.84■■■■■ 5.09
GOLGA3-204ENST00000534967 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.61■■■■■ 5.05
GOLGA3-204ENST00000534967 FAM69CQ0P6D2 419 aa46.59■■■■■ 5.05
GOLGA3-204ENST00000534967 ABCC10Q5T3U5 1492 aa46.57■■■■■ 5.05
GOLGA3-204ENST00000534967 IGF1RP08069 1367 aa46.57■■■■■ 5.05
GOLGA3-204ENST00000534967 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.54■■■■■ 5.04
GOLGA3-204ENST00000534967 ADCY10Q96PN6 1610 aa46.54■■■■■ 5.04
GOLGA3-204ENST00000534967 MAPKBP1O60336 1514 aa46.54■■■■■ 5.04
GOLGA3-204ENST00000534967 KIF27Q86VH2 1401 aa46.52■■■■■ 5.04
GOLGA3-204ENST00000534967 CUL7Q14999 1698 aa46.47■■■■■ 5.03
GOLGA3-204ENST00000534967 DIP2BQ9P265 1576 aa46.45■■■■■ 5.03
GOLGA3-204ENST00000534967 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.25■■■■■ 4.99
GOLGA3-204ENST00000534967 PTPRGP23470 1445 aa46.23■■■■■ 4.99
GOLGA3-204ENST00000534967 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.2■■■■■ 4.99
GOLGA3-204ENST00000534967 KDM6BO15054 1643 aa46.17■■■■■ 4.98
GOLGA3-204ENST00000534967 TSPOAP1O95153 1857 aa46.17■■■■■ 4.98
GOLGA3-204ENST00000534967 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.11■■■■■ 4.97
GOLGA3-204ENST00000534967 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.09■■■■■ 4.97
GOLGA3-204ENST00000534967 IQGAP2Q13576 1575 aa46.04■■■■■ 4.96
GOLGA3-204ENST00000534967 ABCC2Q92887 1545 aa46.03■■■■■ 4.96
GOLGA3-204ENST00000534967 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa45.94■■■■■ 4.94
GOLGA3-204ENST00000534967 ASXL2Q76L83 1435 aa45.94■■■■■ 4.94
GOLGA3-204ENST00000534967 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.88■■■■■ 4.94
GOLGA3-204ENST00000534967 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.88■■■■■ 4.94
GOLGA3-204ENST00000534967 DISP1Q96F81 1524 aa45.87■■■■■ 4.93
GOLGA3-204ENST00000534967 UACAQ9BZF9 1416 aa45.86■■■■■ 4.93
GOLGA3-204ENST00000534967 GLI2P10070 1586 aa45.83■■■■■ 4.93
GOLGA3-204ENST00000534967 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP45.79■■■■■ 4.92
GOLGA3-204ENST00000534967 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.77■■■■■ 4.92
GOLGA3-204ENST00000534967 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.73■■■■■ 4.91
GOLGA3-204ENST00000534967 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.68■■■■■ 4.9
GOLGA3-204ENST00000534967 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
GOLGA3-204ENST00000534967 KIAA0556O60303 1618 aa45.65■■■■■ 4.9
GOLGA3-204ENST00000534967 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP45.6■■■■■ 4.89
GOLGA3-204ENST00000534967 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa45.57■■■■■ 4.89
GOLGA3-204ENST00000534967 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.55■■■■■ 4.88
GOLGA3-204ENST00000534967 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.47■■■■■ 4.87
GOLGA3-204ENST00000534967 ADGRL1O94910 1474 aa45.46■■■■■ 4.87
GOLGA3-204ENST00000534967 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.41■■■■■ 4.86
GOLGA3-204ENST00000534967 WDR7Q9Y4E6 1490 aa45.4■■■■■ 4.86
GOLGA3-204ENST00000534967 GOLGA3Q08378 1498 aa45.31■■■■■ 4.84
GOLGA3-204ENST00000534967 ABCA8O94911 1581 aa45.25■■■■■ 4.83
GOLGA3-204ENST00000534967 KCNH8Q96L42 1107 aa45.2■■■■■ 4.83
GOLGA3-204ENST00000534967 CD109Q6YHK3 1445 aa45.18■■■■■ 4.82
GOLGA3-204ENST00000534967 PRXQ9BXM0 1461 aa45.18■■■■■ 4.82
GOLGA3-204ENST00000534967 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa45.15■■■■■ 4.82
GOLGA3-204ENST00000534967 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.15■■■■■ 4.82
GOLGA3-204ENST00000534967 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP45■■■■■ 4.79
GOLGA3-204ENST00000534967 ARID3CA6NKF2 412 aa44.98■■■■■ 4.79
GOLGA3-204ENST00000534967 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.98■■■■■ 4.79
GOLGA3-204ENST00000534967 P3H3Q8IVL6 736 aa44.96■■■■■ 4.79
GOLGA3-204ENST00000534967 ATP10BO94823 1461 aa44.89■■■■■ 4.78
GOLGA3-204ENST00000534967 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.88■■■■■ 4.78
GOLGA3-204ENST00000534967 KIF21BO75037 1637 aa44.82■■■■■ 4.77
GOLGA3-204ENST00000534967 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.8■■■■■ 4.76
GOLGA3-204ENST00000534967 SAMD9Q5K651 1589 aa44.75■■■■■ 4.75
GOLGA3-204ENST00000534967 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.73■■■■■ 4.75
GOLGA3-204ENST00000534967 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.72■■■■■ 4.75
GOLGA3-204ENST00000534967 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.68■■■■■ 4.74
GOLGA3-204ENST00000534967 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.63■■■■■ 4.73
GOLGA3-204ENST00000534967 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
GOLGA3-204ENST00000534967 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.62■■■■■ 4.73
GOLGA3-204ENST00000534967 RAPGEF3O95398 923 aa44.58■■■■■ 4.73
GOLGA3-204ENST00000534967 NEO1Q92859 1461 aa44.54■■■■■ 4.72
GOLGA3-204ENST00000534967 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.54■■■■■ 4.72
GOLGA3-204ENST00000534967 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.53■■■■■ 4.72
GOLGA3-204ENST00000534967 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.48■■■■■ 4.71
GOLGA3-204ENST00000534967 ADAMTSL3P82987 1691 aa44.45■■■■■ 4.71
GOLGA3-204ENST00000534967 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa44.43■■■■■ 4.7
GOLGA3-204ENST00000534967 PTPRMP28827 1452 aa44.42■■■■■ 4.7
GOLGA3-204ENST00000534967 EEA1Q15075 1411 aa44.41■■■■■ 4.7
GOLGA3-204ENST00000534967 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.33■■■■■ 4.69
GOLGA3-204ENST00000534967 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.32■■■■■ 4.69
GOLGA3-204ENST00000534967 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.32■■■■■ 4.69
GOLGA3-204ENST00000534967 MADDQ8WXG6 1647 aa44.26■■■■■ 4.68
GOLGA3-204ENST00000534967 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP44.25■■■■■ 4.67
GOLGA3-204ENST00000534967 AKNAQ7Z591 1439 aa44.23■■■■■ 4.67
GOLGA3-204ENST00000534967 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa44.22■■■■■ 4.67
GOLGA3-204ENST00000534967 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.21■■■■■ 4.678e-8■■■□□ 15
GOLGA3-204ENST00000534967 FANCAO15360 1455 aa44.21■■■■■ 4.67
GOLGA3-204ENST00000534967 RICTORQ6R327 1708 aa44.2■■■■■ 4.67
GOLGA3-204ENST00000534967 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.19■■■■■ 4.67
GOLGA3-204ENST00000534967 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.15■■■■■ 4.66
GOLGA3-204ENST00000534967 CFAP74Q9C0B2 1584 aa44.15■■■■■ 4.66
GOLGA3-204ENST00000534967 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
GOLGA3-204ENST00000534967 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
GOLGA3-204ENST00000534967 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
GOLGA3-204ENST00000534967 FBXO41Q8TF61 875 aa44.06■■■■■ 4.64
GOLGA3-204ENST00000534967 LMTK3Q96Q04 1460 aa44.05■■■■■ 4.64
GOLGA3-204ENST00000534967 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.04■■■■■ 4.64
GOLGA3-204ENST00000534967 YEATS2Q9ULM3 1422 aa44■■■■■ 4.63
GOLGA3-204ENST00000534967 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa44■■■■■ 4.63
GOLGA3-204ENST00000534967 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.96■■■■■ 4.63
GOLGA3-204ENST00000534967 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa43.96■■■■■ 4.63
GOLGA3-204ENST00000534967 PLPPR3Q6T4P5 718 aa43.94■■■■■ 4.62
GOLGA3-204ENST00000534967 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.94■■■■■ 4.62
GOLGA3-204ENST00000534967 HECW1Q76N89 1606 aa43.92■■■■■ 4.62
GOLGA3-204ENST00000534967 PLCH2O75038 1416 aa43.91■■■■■ 4.62
GOLGA3-204ENST00000534967 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.91■■■■■ 4.62
GOLGA3-204ENST00000534967 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.9■■■■■ 4.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms