RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534112.1

SSH3-211, Transcript of slingshot protein phosphatase 3, humanhuman

TSL 4

Gene SSH3, Length 544 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3-211ENST00000534112 IGF1RP08069 1367 aa37.58■■■■□ 3.61
SSH3-211ENST00000534112 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.55■■■■□ 3.6
SSH3-211ENST00000534112 KIF27Q86VH2 1401 aa37.51■■■■□ 3.59
SSH3-211ENST00000534112 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.49■■■■□ 3.59
SSH3-211ENST00000534112 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.49■■■■□ 3.59
SSH3-211ENST00000534112 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.48■■■■□ 3.59
SSH3-211ENST00000534112 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.44■■■■□ 3.58
SSH3-211ENST00000534112 MAPKBP1O60336 1514 aa37.37■■■■□ 3.57
SSH3-211ENST00000534112 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.36■■■■□ 3.57
SSH3-211ENST00000534112 CUL7Q14999 1698 aa37.34■■■■□ 3.57
SSH3-211ENST00000534112 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.3■■■■□ 3.56
SSH3-211ENST00000534112 DIP2BQ9P265 1576 aa37.25■■■■□ 3.55
SSH3-211ENST00000534112 PTPRGP23470 1445 aa37.24■■■■□ 3.55
SSH3-211ENST00000534112 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
SSH3-211ENST00000534112 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.14■■■■□ 3.54
SSH3-211ENST00000534112 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.13■■■■□ 3.53
SSH3-211ENST00000534112 ABCC2Q92887 1545 aa37.02■■■■□ 3.52
SSH3-211ENST00000534112 IQGAP2Q13576 1575 aa37.01■■■■□ 3.52
SSH3-211ENST00000534112 KDM6BO15054 1643 aa37■■■■□ 3.51
SSH3-211ENST00000534112 TSPOAP1O95153 1857 aa36.95■■■■□ 3.51
SSH3-211ENST00000534112 ASXL2Q76L83 1435 aa36.94■■■■□ 3.5
SSH3-211ENST00000534112 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.93■■■■□ 3.5
SSH3-211ENST00000534112 DISP1Q96F81 1524 aa36.92■■■■□ 3.5
SSH3-211ENST00000534112 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.92■■■■□ 3.5
SSH3-211ENST00000534112 UACAQ9BZF9 1416 aa36.92■■■■□ 3.5
SSH3-211ENST00000534112 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.91■■■■□ 3.5
SSH3-211ENST00000534112 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.88■■■■□ 3.5
SSH3-211ENST00000534112 GLI2P10070 1586 aa36.82■■■■□ 3.48
SSH3-211ENST00000534112 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.8■■■■□ 3.48
SSH3-211ENST00000534112 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.76■■■■□ 3.48
SSH3-211ENST00000534112 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
SSH3-211ENST00000534112 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
SSH3-211ENST00000534112 KIAA0556O60303 1618 aa36.67■■■■□ 3.46
SSH3-211ENST00000534112 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
SSH3-211ENST00000534112 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
SSH3-211ENST00000534112 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.56■■■■□ 3.44
SSH3-211ENST00000534112 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.55■■■■□ 3.44
SSH3-211ENST00000534112 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.51■■■■□ 3.44
SSH3-211ENST00000534112 GOLGA3Q08378 1498 aa36.5■■■■□ 3.43
SSH3-211ENST00000534112 ADGRL1O94910 1474 aa36.46■■■■□ 3.43
SSH3-211ENST00000534112 PRXQ9BXM0 1461 aa36.45■■■■□ 3.43
SSH3-211ENST00000534112 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.42■■■■□ 3.42
SSH3-211ENST00000534112 KCNH8Q96L42 1107 aa36.42■■■■□ 3.42
SSH3-211ENST00000534112 ABCA8O94911 1581 aa36.39■■■■□ 3.42
SSH3-211ENST00000534112 CD109Q6YHK3 1445 aa36.37■■■■□ 3.41
SSH3-211ENST00000534112 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.32■■■■□ 3.4
SSH3-211ENST00000534112 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
SSH3-211ENST00000534112 P3H3Q8IVL6 736 aa36.25■■■■□ 3.39
SSH3-211ENST00000534112 ARID3CA6NKF2 412 aa36.22■■■■□ 3.39
SSH3-211ENST00000534112 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.22■■■■□ 3.39
SSH3-211ENST00000534112 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.17■■■■□ 3.38
SSH3-211ENST00000534112 ATP10BO94823 1461 aa36.16■■■■□ 3.38
SSH3-211ENST00000534112 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
SSH3-211ENST00000534112 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.04■■■■□ 3.36
SSH3-211ENST00000534112 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.01■■■■□ 3.35
SSH3-211ENST00000534112 SAMD9Q5K651 1589 aa35.98■■■■□ 3.35
SSH3-211ENST00000534112 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.98■■■■□ 3.35
SSH3-211ENST00000534112 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
SSH3-211ENST00000534112 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
SSH3-211ENST00000534112 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.93■■■■□ 3.34
SSH3-211ENST00000534112 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
SSH3-211ENST00000534112 RAPGEF3O95398 923 aa35.91■■■■□ 3.34
SSH3-211ENST00000534112 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.9■■■■□ 3.34
SSH3-211ENST00000534112 KIF21BO75037 1637 aa35.89■■■■□ 3.34
SSH3-211ENST00000534112 EEA1Q15075 1411 aa35.87■■■■□ 3.33
SSH3-211ENST00000534112 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
SSH3-211ENST00000534112 NEO1Q92859 1461 aa35.84■■■■□ 3.33
SSH3-211ENST00000534112 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.83■■■■□ 3.33
SSH3-211ENST00000534112 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.77■■■■□ 3.32
SSH3-211ENST00000534112 PTPRMP28827 1452 aa35.68■■■■□ 3.3
SSH3-211ENST00000534112 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
SSH3-211ENST00000534112 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.65■■■■□ 3.3
SSH3-211ENST00000534112 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.65■■■■□ 3.3
SSH3-211ENST00000534112 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
SSH3-211ENST00000534112 AKNAQ7Z591 1439 aa35.6■■■■□ 3.29
SSH3-211ENST00000534112 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.58■■■■□ 3.29
SSH3-211ENST00000534112 FANCAO15360 1455 aa35.56■■■■□ 3.28
SSH3-211ENST00000534112 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.55■■■■□ 3.28
SSH3-211ENST00000534112 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.52■■■■□ 3.28
SSH3-211ENST00000534112 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.48■■■■□ 3.27
SSH3-211ENST00000534112 MADDQ8WXG6 1647 aa35.47■■■■□ 3.27
SSH3-211ENST00000534112 RICTORQ6R327 1708 aa35.46■■■■□ 3.27
SSH3-211ENST00000534112 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
SSH3-211ENST00000534112 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
SSH3-211ENST00000534112 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.45■■■■□ 3.27
SSH3-211ENST00000534112 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.44■■■■□ 3.26
SSH3-211ENST00000534112 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.44■■■■□ 3.26
SSH3-211ENST00000534112 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
SSH3-211ENST00000534112 PLCH2O75038 1416 aa35.39■■■■□ 3.26
SSH3-211ENST00000534112 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.39■■■■□ 3.26
SSH3-211ENST00000534112 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.38■■■■□ 3.25
SSH3-211ENST00000534112 FBXO41Q8TF61 875 aa35.38■■■■□ 3.25
SSH3-211ENST00000534112 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.37■■■■□ 3.25
SSH3-211ENST00000534112 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
SSH3-211ENST00000534112 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.35■■■■□ 3.25
SSH3-211ENST00000534112 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.35■■■■□ 3.25
SSH3-211ENST00000534112 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.35■■■■□ 3.25
SSH3-211ENST00000534112 FMN1Q68DA7 1419 aa35.34■■■■□ 3.25
SSH3-211ENST00000534112 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.34■■■■□ 3.25
SSH3-211ENST00000534112 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
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