RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533782.5

FRMD8-209, Transcript of FERM domain containing 8, humanhuman

TSL 5

Gene FRMD8, Length 677 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD8-209ENST00000533782 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.81■■■■■ 4.28
FRMD8-209ENST00000533782 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.61■■■■■ 4.25
FRMD8-209ENST00000533782 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.6■■■■■ 4.25
FRMD8-209ENST00000533782 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.6■■■■■ 4.25
FRMD8-209ENST00000533782 MAPKBP1O60336 1514 aa41.58■■■■■ 4.25
FRMD8-209ENST00000533782 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.57■■■■■ 4.25
FRMD8-209ENST00000533782 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.54■■■■■ 4.24
FRMD8-209ENST00000533782 IGF1RP08069 1367 aa41.54■■■■■ 4.24
FRMD8-209ENST00000533782 DIP2BQ9P265 1576 aa41.5■■■■■ 4.23
FRMD8-209ENST00000533782 KIF27Q86VH2 1401 aa41.49■■■■■ 4.23
FRMD8-209ENST00000533782 CUL7Q14999 1698 aa41.48■■■■■ 4.23
FRMD8-209ENST00000533782 TSPOAP1O95153 1857 aa41.28■■■■■ 4.2
FRMD8-209ENST00000533782 PTPRGP23470 1445 aa41.26■■■■■ 4.19
FRMD8-209ENST00000533782 KDM6BO15054 1643 aa41.26■■■■■ 4.19
FRMD8-209ENST00000533782 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.25■■■■■ 4.19
FRMD8-209ENST00000533782 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
FRMD8-209ENST00000533782 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.14■■■■■ 4.18
FRMD8-209ENST00000533782 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.13■■■■■ 4.18
FRMD8-209ENST00000533782 ABCC2Q92887 1545 aa41.09■■■■■ 4.17
FRMD8-209ENST00000533782 IQGAP2Q13576 1575 aa41.08■■■■■ 4.17
FRMD8-209ENST00000533782 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.06■■■■■ 4.16
FRMD8-209ENST00000533782 ASXL2Q76L83 1435 aa41.01■■■■■ 4.15
FRMD8-209ENST00000533782 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.97■■■■■ 4.15
FRMD8-209ENST00000533782 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.97■■■■■ 4.15
FRMD8-209ENST00000533782 GLI2P10070 1586 aa40.95■■■■■ 4.15
FRMD8-209ENST00000533782 DISP1Q96F81 1524 aa40.94■■■■■ 4.14
FRMD8-209ENST00000533782 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
FRMD8-209ENST00000533782 UACAQ9BZF9 1416 aa40.93■■■■■ 4.14
FRMD8-209ENST00000533782 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.82■■■■■ 4.12
FRMD8-209ENST00000533782 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.82■■■■■ 4.12
FRMD8-209ENST00000533782 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.79■■■■■ 4.12
FRMD8-209ENST00000533782 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
FRMD8-209ENST00000533782 KIAA0556O60303 1618 aa40.73■■■■■ 4.11
FRMD8-209ENST00000533782 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
FRMD8-209ENST00000533782 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.72■■■■■ 4.11
FRMD8-209ENST00000533782 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
FRMD8-209ENST00000533782 ADGRL1O94910 1474 aa40.61■■■■■ 4.09
FRMD8-209ENST00000533782 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.6■■■■■ 4.09
FRMD8-209ENST00000533782 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.55■■■■■ 4.08
FRMD8-209ENST00000533782 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.52■■■■■ 4.08
FRMD8-209ENST00000533782 GOLGA3Q08378 1498 aa40.43■■■■■ 4.06
FRMD8-209ENST00000533782 ABCA8O94911 1581 aa40.4■■■■■ 4.06
FRMD8-209ENST00000533782 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.34■■■■■ 4.05
FRMD8-209ENST00000533782 CD109Q6YHK3 1445 aa40.33■■■■■ 4.05
FRMD8-209ENST00000533782 KCNH8Q96L42 1107 aa40.33■■■■■ 4.05
FRMD8-209ENST00000533782 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.32■■■■■ 4.05
FRMD8-209ENST00000533782 PRXQ9BXM0 1461 aa40.29■■■■■ 4.04
FRMD8-209ENST00000533782 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
FRMD8-209ENST00000533782 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.21■■■■■ 4.03
FRMD8-209ENST00000533782 ARID3CA6NKF2 412 aa40.09■■■■■ 4.01
FRMD8-209ENST00000533782 P3H3Q8IVL6 736 aa40.08■■■■■ 4.01
FRMD8-209ENST00000533782 ATP10BO94823 1461 aa40.07■■■■■ 4
FRMD8-209ENST00000533782 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
FRMD8-209ENST00000533782 KIF21BO75037 1637 aa40.04■■■■■ 4
FRMD8-209ENST00000533782 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.03■■■■■ 4
FRMD8-209ENST00000533782 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.94■■■■□ 3.99
FRMD8-209ENST00000533782 SAMD9Q5K651 1589 aa39.93■■■■□ 3.98
FRMD8-209ENST00000533782 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.87■■■■□ 3.97
FRMD8-209ENST00000533782 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.87■■■■□ 3.97
FRMD8-209ENST00000533782 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.86■■■■□ 3.97
FRMD8-209ENST00000533782 RAPGEF3O95398 923 aa39.78■■■■□ 3.96
FRMD8-209ENST00000533782 NEO1Q92859 1461 aa39.77■■■■□ 3.96
FRMD8-209ENST00000533782 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
FRMD8-209ENST00000533782 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
FRMD8-209ENST00000533782 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.75■■■■□ 3.95
FRMD8-209ENST00000533782 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
FRMD8-209ENST00000533782 PTPRMP28827 1452 aa39.68■■■■□ 3.94
FRMD8-209ENST00000533782 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.68■■■■□ 3.94
FRMD8-209ENST00000533782 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
FRMD8-209ENST00000533782 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.64■■■■□ 3.94
FRMD8-209ENST00000533782 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.61■■■■□ 3.93
FRMD8-209ENST00000533782 EEA1Q15075 1411 aa39.58■■■■□ 3.93
FRMD8-209ENST00000533782 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
FRMD8-209ENST00000533782 MADDQ8WXG6 1647 aa39.54■■■■□ 3.92
FRMD8-209ENST00000533782 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.54■■■■□ 3.92
FRMD8-209ENST00000533782 RICTORQ6R327 1708 aa39.5■■■■□ 3.91
FRMD8-209ENST00000533782 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
FRMD8-209ENST00000533782 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.48■■■■□ 3.91
FRMD8-209ENST00000533782 AKNAQ7Z591 1439 aa39.47■■■■□ 3.91
FRMD8-209ENST00000533782 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.45■■■■□ 3.91
FRMD8-209ENST00000533782 FANCAO15360 1455 aa39.44■■■■□ 3.9
FRMD8-209ENST00000533782 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.43■■■■□ 3.9
FRMD8-209ENST00000533782 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.41■■■■□ 3.9
FRMD8-209ENST00000533782 FBXO41Q8TF61 875 aa39.4■■■■□ 3.9
FRMD8-209ENST00000533782 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
FRMD8-209ENST00000533782 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.4■■■■□ 3.9
FRMD8-209ENST00000533782 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
FRMD8-209ENST00000533782 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.36■■■■□ 3.89
FRMD8-209ENST00000533782 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.33■■■■□ 3.89
FRMD8-209ENST00000533782 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
FRMD8-209ENST00000533782 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.28■■■■□ 3.88
FRMD8-209ENST00000533782 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.27■■■■□ 3.88
FRMD8-209ENST00000533782 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.27■■■■□ 3.88
FRMD8-209ENST00000533782 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.25■■■■□ 3.87
FRMD8-209ENST00000533782 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.22■■■■□ 3.87
FRMD8-209ENST00000533782 HECW1Q76N89 1606 aa39.22■■■■□ 3.87
FRMD8-209ENST00000533782 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.19■■■■□ 3.86
FRMD8-209ENST00000533782 PLCH2O75038 1416 aa39.19■■■■□ 3.86
FRMD8-209ENST00000533782 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.16■■■■□ 3.86
FRMD8-209ENST00000533782 HSPA2P54652 639 aa39.15■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms