RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533683.6

SAMD1-202, Transcript of sterile alpha motif domain containing 1, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAMD1, Length 2,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1-202ENST00000533683 P3H3Q8IVL6 736 aa43.15■■■■■ 4.5
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SAMD1-202ENST00000533683 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.14■■■■■ 4.5
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SAMD1-202ENST00000533683 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.09■■■■■ 4.49
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SAMD1-202ENST00000533683 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
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SAMD1-202ENST00000533683 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.42■■■■■ 4.22
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SAMD1-202ENST00000533683 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.32■■■■■ 4.21
SAMD1-202ENST00000533683 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.31■■■■■ 4.2
SAMD1-202ENST00000533683 ABCC5O15440 1437 aa41.29■■■■■ 4.2
SAMD1-202ENST00000533683 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
SAMD1-202ENST00000533683 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.26■■■■■ 4.2
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