RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531706.1

LYVE1-204, Transcript of lymphatic vessel endothelial hyaluronan receptor 1, humanhuman

TSL 5

Gene LYVE1, Length 676 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1-204ENST00000531706 JPH4Q96JJ6 628 aa16.06■□□□□ 0.16
LYVE1-204ENST00000531706 ADAMTS12P58397 1594 aa16.05■□□□□ 0.16
LYVE1-204ENST00000531706 NUP160Q12769 1436 aa16.05■□□□□ 0.16
LYVE1-204ENST00000531706 ADRA2BP18089 450 aa16.01■□□□□ 0.15
LYVE1-204ENST00000531706 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
LYVE1-204ENST00000531706 CEP170Q5SW79 1584 aa16■□□□□ 0.15
LYVE1-204ENST00000531706 KIF27Q86VH2 1401 aa15.99■□□□□ 0.15
LYVE1-204ENST00000531706 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LYVE1-204ENST00000531706 IGF1RP08069 1367 aa15.95■□□□□ 0.14
LYVE1-204ENST00000531706 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.93■□□□□ 0.14
LYVE1-204ENST00000531706 SHROOM2Q13796 1616 aa15.91■□□□□ 0.14
LYVE1-204ENST00000531706 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.88■□□□□ 0.13
LYVE1-204ENST00000531706 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.87■□□□□ 0.13
LYVE1-204ENST00000531706 CUL7Q14999 1698 aa15.85■□□□□ 0.13
LYVE1-204ENST00000531706 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.82■□□□□ 0.12
LYVE1-204ENST00000531706 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
LYVE1-204ENST00000531706 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.8■□□□□ 0.12
LYVE1-204ENST00000531706 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.8■□□□□ 0.12
LYVE1-204ENST00000531706 PTPRGP23470 1445 aa15.78■□□□□ 0.12
LYVE1-204ENST00000531706 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
LYVE1-204ENST00000531706 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.74■□□□□ 0.11
LYVE1-204ENST00000531706 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.71■□□□□ 0.11
LYVE1-204ENST00000531706 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.71■□□□□ 0.1
LYVE1-204ENST00000531706 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.7■□□□□ 0.1
LYVE1-204ENST00000531706 MAPKBP1O60336 1514 aa15.68■□□□□ 0.1
LYVE1-204ENST00000531706 IQGAP2Q13576 1575 aa15.67■□□□□ 0.1
LYVE1-204ENST00000531706 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.66■□□□□ 0.1
LYVE1-204ENST00000531706 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.64■□□□□ 0.09
LYVE1-204ENST00000531706 UACAQ9BZF9 1416 aa15.62■□□□□ 0.09
LYVE1-204ENST00000531706 ABCC2Q92887 1545 aa15.6■□□□□ 0.09
LYVE1-204ENST00000531706 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.59■□□□□ 0.09
LYVE1-204ENST00000531706 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.58■□□□□ 0.08
LYVE1-204ENST00000531706 DIP2BQ9P265 1576 aa15.58■□□□□ 0.08
LYVE1-204ENST00000531706 ASXL2Q76L83 1435 aa15.57■□□□□ 0.08
LYVE1-204ENST00000531706 DISP1Q96F81 1524 aa15.57■□□□□ 0.08
LYVE1-204ENST00000531706 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.57■□□□□ 0.08
LYVE1-204ENST00000531706 GOLGA3Q08378 1498 aa15.56■□□□□ 0.08
LYVE1-204ENST00000531706 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.55■□□□□ 0.08
LYVE1-204ENST00000531706 TSPOAP1O95153 1857 aa15.52■□□□□ 0.08
LYVE1-204ENST00000531706 KDM6BO15054 1643 aa15.5■□□□□ 0.07
LYVE1-204ENST00000531706 PRXQ9BXM0 1461 aa15.49■□□□□ 0.07
LYVE1-204ENST00000531706 KCNH8Q96L42 1107 aa15.49■□□□□ 0.07
LYVE1-204ENST00000531706 KIAA0556O60303 1618 aa15.49■□□□□ 0.07
LYVE1-204ENST00000531706 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.48■□□□□ 0.07
LYVE1-204ENST00000531706 P3H3Q8IVL6 736 aa15.48■□□□□ 0.07
LYVE1-204ENST00000531706 GLI2P10070 1586 aa15.47■□□□□ 0.07
LYVE1-204ENST00000531706 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.46■□□□□ 0.07
LYVE1-204ENST00000531706 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
LYVE1-204ENST00000531706 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.44■□□□□ 0.06
LYVE1-204ENST00000531706 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
LYVE1-204ENST00000531706 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
LYVE1-204ENST00000531706 EEA1Q15075 1411 aa15.43■□□□□ 0.06
LYVE1-204ENST00000531706 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
LYVE1-204ENST00000531706 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
LYVE1-204ENST00000531706 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.4■□□□□ 0.06
LYVE1-204ENST00000531706 ARID3CA6NKF2 412 aa15.39■□□□□ 0.05
LYVE1-204ENST00000531706 CD109Q6YHK3 1445 aa15.38■□□□□ 0.05
LYVE1-204ENST00000531706 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.38■□□□□ 0.05
LYVE1-204ENST00000531706 ABCA8O94911 1581 aa15.35■□□□□ 0.05
LYVE1-204ENST00000531706 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa15.34■□□□□ 0.05
LYVE1-204ENST00000531706 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
LYVE1-204ENST00000531706 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.31■□□□□ 0.04
LYVE1-204ENST00000531706 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
LYVE1-204ENST00000531706 ATP10BO94823 1461 aa15.3■□□□□ 0.04
LYVE1-204ENST00000531706 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.29■□□□□ 0.04
LYVE1-204ENST00000531706 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
LYVE1-204ENST00000531706 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.27■□□□□ 0.04
LYVE1-204ENST00000531706 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.27■□□□□ 0.03
LYVE1-204ENST00000531706 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.26■□□□□ 0.03
LYVE1-204ENST00000531706 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
LYVE1-204ENST00000531706 SAMD9Q5K651 1589 aa15.24■□□□□ 0.03
LYVE1-204ENST00000531706 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.23■□□□□ 0.03
LYVE1-204ENST00000531706 ADGRL1O94910 1474 aa15.21■□□□□ 0.03
LYVE1-204ENST00000531706 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.21■□□□□ 0.03
LYVE1-204ENST00000531706 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
LYVE1-204ENST00000531706 KIF21BO75037 1637 aa15.18■□□□□ 0.02
LYVE1-204ENST00000531706 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.17■□□□□ 0.02
LYVE1-204ENST00000531706 RAPGEF3O95398 923 aa15.17■□□□□ 0.02
LYVE1-204ENST00000531706 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.17■□□□□ 0.02
LYVE1-204ENST00000531706 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
LYVE1-204ENST00000531706 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
LYVE1-204ENST00000531706 NEO1Q92859 1461 aa15.14■□□□□ 0.01
LYVE1-204ENST00000531706 ABCA9Q8IUA7 1624 aa15.14■□□□□ 0.01
LYVE1-204ENST00000531706 FMN1Q68DA7 1419 aa15.12■□□□□ 0.01
LYVE1-204ENST00000531706 AKNAQ7Z591 1439 aa15.08■□□□□ 0
LYVE1-204ENST00000531706 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
LYVE1-204ENST00000531706 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.06■□□□□ 0
LYVE1-204ENST00000531706 FANCAO15360 1455 aa15.05■□□□□ -0
LYVE1-204ENST00000531706 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.03■□□□□ -0
LYVE1-204ENST00000531706 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.02■□□□□ -0
LYVE1-204ENST00000531706 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.02□□□□□ -0.01
LYVE1-204ENST00000531706 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.01□□□□□ -0.01
LYVE1-204ENST00000531706 PLCH2O75038 1416 aa15.01□□□□□ -0.01
LYVE1-204ENST00000531706 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
LYVE1-204ENST00000531706 CLIP1P30622 1438 aa15□□□□□ -0.01
LYVE1-204ENST00000531706 HECW1Q76N89 1606 aa15□□□□□ -0.01
LYVE1-204ENST00000531706 POGZQ7Z3K3 1410 aa15□□□□□ -0.01
LYVE1-204ENST00000531706 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
LYVE1-204ENST00000531706 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
LYVE1-204ENST00000531706 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms