RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531092.5

GMDS-AS1-208, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 744 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-208ENST00000531092 JPH4Q96JJ6 628 aa24.21■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-208ENST00000531092 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KDM6BO15054 1643 aa24.2■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.14■■□□□ 1.45
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.11■■□□□ 1.45
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TSPOAP1O95153 1857 aa24.07■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.05■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TOP2BQ02880 1626 aa24.03■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-208ENST00000531092 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.03■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ADGRL1O94910 1474 aa23.95■■□□□ 1.42
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.88■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.85■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-208ENST00000531092 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GLI2P10070 1586 aa23.8■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PTPRGP23470 1445 aa23.78■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ASXL2Q76L83 1435 aa23.77■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ABCC2Q92887 1545 aa23.76■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.75■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-208ENST00000531092 IGF1RP08069 1367 aa23.69■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.66■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CUL7Q14999 1698 aa23.64■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FBXO41Q8TF61 875 aa23.64■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-208ENST00000531092 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.63■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.63■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-208ENST00000531092 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.6■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.59■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-208ENST00000531092 UACAQ9BZF9 1416 aa23.58■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.54■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KIF27Q86VH2 1401 aa23.54■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DISP1Q96F81 1524 aa23.49■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.48■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-208ENST00000531092 IQGAP2Q13576 1575 aa23.48■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-208ENST00000531092 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.39■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.37■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KIF21BO75037 1637 aa23.36■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CD109Q6YHK3 1445 aa23.34■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-208ENST00000531092 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.33■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.31■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KIAA0556O60303 1618 aa23.29■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PTPRMP28827 1452 aa23.28■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KCNH8Q96L42 1107 aa23.26■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.25■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.23■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.22■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.16■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ABCA8O94911 1581 aa23.15■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-208ENST00000531092 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.09■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MADDQ8WXG6 1647 aa23.08■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RAPGEF3O95398 923 aa23.07■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.06■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ILDR2Q71H61 639 aa23.05■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GOLGA3Q08378 1498 aa23.03■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HSPA2P54652 639 aa23.02■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CERKQ8TCT0 537 aa23.02■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SOCS7O14512 581 aa23.01■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.99■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.98■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.98■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ATP10BO94823 1461 aa22.98■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ARID3CA6NKF2 412 aa22.96■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NEO1Q92859 1461 aa22.96■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.95■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.87■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.85■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RICTORQ6R327 1708 aa22.8■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-208ENST00000531092 P3H3Q8IVL6 736 aa22.8■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.79■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.78■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-208ENST00000531092 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.77■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FANCAO15360 1455 aa22.76■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PRXQ9BXM0 1461 aa22.75■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-208ENST00000531092 AKNAQ7Z591 1439 aa22.74■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-208ENST00000531092 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.73■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.72■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.72■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.71■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.71■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MLECQ14165 292 aa22.7■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.69■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.69■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-208ENST00000531092 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.67■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-208ENST00000531092 STRCQ7RTU9 1775 aa22.66■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SAMD9Q5K651 1589 aa22.65■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.65■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.65■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms