RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528247.1

ARHGEF4-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF4, Length 662 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4-215ENST00000528247 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.7■■■□□ 2.67
ARHGEF4-215ENST00000528247 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF4-215ENST00000528247 IGF1RP08069 1367 aa31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF4-215ENST00000528247 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.5■■■□□ 2.63
ARHGEF4-215ENST00000528247 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.49■■■□□ 2.63
ARHGEF4-215ENST00000528247 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.49■■■□□ 2.63
ARHGEF4-215ENST00000528247 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.48■■■□□ 2.63
ARHGEF4-215ENST00000528247 KIF27Q86VH2 1401 aa31.48■■■□□ 2.63
ARHGEF4-215ENST00000528247 CUL7Q14999 1698 aa31.47■■■□□ 2.63
ARHGEF4-215ENST00000528247 MAPKBP1O60336 1514 aa31.45■■■□□ 2.63
ARHGEF4-215ENST00000528247 DIP2BQ9P265 1576 aa31.39■■■□□ 2.62
ARHGEF4-215ENST00000528247 KDM6BO15054 1643 aa31.31■■■□□ 2.6
ARHGEF4-215ENST00000528247 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.3■■■□□ 2.6
ARHGEF4-215ENST00000528247 PTPRGP23470 1445 aa31.24■■■□□ 2.59
ARHGEF4-215ENST00000528247 TSPOAP1O95153 1857 aa31.23■■■□□ 2.59
ARHGEF4-215ENST00000528247 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.23■■■□□ 2.59
ARHGEF4-215ENST00000528247 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
ARHGEF4-215ENST00000528247 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.17■■■□□ 2.58
ARHGEF4-215ENST00000528247 IQGAP2Q13576 1575 aa31.16■■■□□ 2.58
ARHGEF4-215ENST00000528247 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.15■■■□□ 2.58
ARHGEF4-215ENST00000528247 ABCC2Q92887 1545 aa31.11■■■□□ 2.57
ARHGEF4-215ENST00000528247 DISP1Q96F81 1524 aa31.06■■■□□ 2.56
ARHGEF4-215ENST00000528247 ASXL2Q76L83 1435 aa31.04■■■□□ 2.56
ARHGEF4-215ENST00000528247 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.03■■■□□ 2.56
ARHGEF4-215ENST00000528247 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF4-215ENST00000528247 UACAQ9BZF9 1416 aa31■■■□□ 2.55
ARHGEF4-215ENST00000528247 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.99■■■□□ 2.55
ARHGEF4-215ENST00000528247 GLI2P10070 1586 aa30.98■■■□□ 2.55
ARHGEF4-215ENST00000528247 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF4-215ENST00000528247 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF4-215ENST00000528247 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF4-215ENST00000528247 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.9■■■□□ 2.54
ARHGEF4-215ENST00000528247 KIAA0556O60303 1618 aa30.9■■■□□ 2.54
ARHGEF4-215ENST00000528247 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
ARHGEF4-215ENST00000528247 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
ARHGEF4-215ENST00000528247 ADGRL1O94910 1474 aa30.84■■■□□ 2.53
ARHGEF4-215ENST00000528247 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.82■■■□□ 2.52
ARHGEF4-215ENST00000528247 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
ARHGEF4-215ENST00000528247 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.77■■■□□ 2.52
ARHGEF4-215ENST00000528247 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.75■■■□□ 2.51
ARHGEF4-215ENST00000528247 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.69■■■□□ 2.5
ARHGEF4-215ENST00000528247 GOLGA3Q08378 1498 aa30.65■■■□□ 2.5
ARHGEF4-215ENST00000528247 ABCA8O94911 1581 aa30.63■■■□□ 2.49
ARHGEF4-215ENST00000528247 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.63■■■□□ 2.49
ARHGEF4-215ENST00000528247 PRXQ9BXM0 1461 aa30.63■■■□□ 2.49
ARHGEF4-215ENST00000528247 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF4-215ENST00000528247 KCNH8Q96L42 1107 aa30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF4-215ENST00000528247 CD109Q6YHK3 1445 aa30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF4-215ENST00000528247 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF4-215ENST00000528247 P3H3Q8IVL6 736 aa30.41■■■□□ 2.46
ARHGEF4-215ENST00000528247 ARID3CA6NKF2 412 aa30.4■■■□□ 2.46
ARHGEF4-215ENST00000528247 ATP10BO94823 1461 aa30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF4-215ENST00000528247 SAMD9Q5K651 1589 aa30.32■■■□□ 2.44
ARHGEF4-215ENST00000528247 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
ARHGEF4-215ENST00000528247 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.3■■■□□ 2.44
ARHGEF4-215ENST00000528247 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.29■■■□□ 2.44
ARHGEF4-215ENST00000528247 KIF21BO75037 1637 aa30.29■■■□□ 2.44
ARHGEF4-215ENST00000528247 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.26■■■□□ 2.44
ARHGEF4-215ENST00000528247 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF4-215ENST00000528247 FBXO41Q8TF61 875 aa30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF4-215ENST00000528247 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF4-215ENST00000528247 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF4-215ENST00000528247 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF4-215ENST00000528247 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF4-215ENST00000528247 RAPGEF3O95398 923 aa30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF4-215ENST00000528247 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF4-215ENST00000528247 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.11■■■□□ 2.41
ARHGEF4-215ENST00000528247 NEO1Q92859 1461 aa30.11■■■□□ 2.41
ARHGEF4-215ENST00000528247 EEA1Q15075 1411 aa30.1■■■□□ 2.41
ARHGEF4-215ENST00000528247 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.07■■■□□ 2.41
ARHGEF4-215ENST00000528247 PTPRMP28827 1452 aa30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF4-215ENST00000528247 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF4-215ENST00000528247 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF4-215ENST00000528247 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF4-215ENST00000528247 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
ARHGEF4-215ENST00000528247 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.93■■■□□ 2.38
ARHGEF4-215ENST00000528247 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.92■■■□□ 2.38
ARHGEF4-215ENST00000528247 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
ARHGEF4-215ENST00000528247 RICTORQ6R327 1708 aa29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF4-215ENST00000528247 AKNAQ7Z591 1439 aa29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF4-215ENST00000528247 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF4-215ENST00000528247 MADDQ8WXG6 1647 aa29.89■■■□□ 2.38
ARHGEF4-215ENST00000528247 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.89■■■□□ 2.38
ARHGEF4-215ENST00000528247 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.89■■■□□ 2.38
ARHGEF4-215ENST00000528247 FANCAO15360 1455 aa29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF4-215ENST00000528247 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF4-215ENST00000528247 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF4-215ENST00000528247 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF4-215ENST00000528247 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF4-215ENST00000528247 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF4-215ENST00000528247 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.76■■■□□ 2.35
ARHGEF4-215ENST00000528247 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.75■■■□□ 2.35
ARHGEF4-215ENST00000528247 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.74■■■□□ 2.35
ARHGEF4-215ENST00000528247 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.74■■■□□ 2.35
ARHGEF4-215ENST00000528247 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.74■■■□□ 2.35
ARHGEF4-215ENST00000528247 HECW1Q76N89 1606 aa29.71■■■□□ 2.35
ARHGEF4-215ENST00000528247 PLCH2O75038 1416 aa29.71■■■□□ 2.35
ARHGEF4-215ENST00000528247 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
ARHGEF4-215ENST00000528247 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF4-215ENST00000528247 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.68■■■□□ 2.34
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