RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 CCER2I3L3R5 266 aa25.75■■□□□ 1.71
PACS1-205ENST00000527224 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.74■■□□□ 1.71
PACS1-205ENST00000527224 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
PACS1-205ENST00000527224 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.7■■□□□ 1.71
PACS1-205ENST00000527224 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
PACS1-205ENST00000527224 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.64■■□□□ 1.7
PACS1-205ENST00000527224 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PACS1-205ENST00000527224 WDR97A6NE52 1622 aa25.63■■□□□ 1.69
PACS1-205ENST00000527224 EEA1Q15075 1411 aa25.61■■□□□ 1.69
PACS1-205ENST00000527224 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PACS1-205ENST00000527224 SMARCA2P51531 1590 aa25.6■■□□□ 1.69
PACS1-205ENST00000527224 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
PACS1-205ENST00000527224 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PACS1-205ENST00000527224 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.58■■□□□ 1.68
PACS1-205ENST00000527224 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PACS1-205ENST00000527224 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.53■■□□□ 1.68
PACS1-205ENST00000527224 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.52■■□□□ 1.68
PACS1-205ENST00000527224 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PACS1-205ENST00000527224 NEFMP07197 916 aa25.5■■□□□ 1.67
PACS1-205ENST00000527224 MAPKBP1O60336 1514 aa25.48■■□□□ 1.67
PACS1-205ENST00000527224 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.47■■□□□ 1.67
PACS1-205ENST00000527224 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.47■■□□□ 1.67
PACS1-205ENST00000527224 KIF21BO75037 1637 aa25.43■■□□□ 1.66
PACS1-205ENST00000527224 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.43■■□□□ 1.66
PACS1-205ENST00000527224 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.38■■□□□ 1.65
PACS1-205ENST00000527224 CCDC184Q52MB2 194 aa25.37■■□□□ 1.65
PACS1-205ENST00000527224 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.36■■□□□ 1.65
PACS1-205ENST00000527224 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.34■■□□□ 1.65
PACS1-205ENST00000527224 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PACS1-205ENST00000527224 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PACS1-205ENST00000527224 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.28■■□□□ 1.64
PACS1-205ENST00000527224 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.28■■□□□ 1.64
PACS1-205ENST00000527224 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.27■■□□□ 1.64
PACS1-205ENST00000527224 CUX2O14529 1486 aa25.27■■□□□ 1.64
PACS1-205ENST00000527224 AKNAQ7Z591 1439 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS1-205ENST00000527224 GSE1Q14687 1217 aa25.15■■□□□ 1.62
PACS1-205ENST00000527224 USP35Q9P2H5 1018 aa25.14■■□□□ 1.62
PACS1-205ENST00000527224 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.14■■□□□ 1.62
PACS1-205ENST00000527224 PLEKHG5O94827 1062 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS1-205ENST00000527224 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS1-205ENST00000527224 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PACS1-205ENST00000527224 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PACS1-205ENST00000527224 ARAP1Q96P48 1450 aa25.11■■□□□ 1.61
PACS1-205ENST00000527224 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PACS1-205ENST00000527224 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.1■■□□□ 1.61
PACS1-205ENST00000527224 MRS2Q9HD23 443 aa25.1■■□□□ 1.61
PACS1-205ENST00000527224 ZMYND15Q9H091 742 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS1-205ENST00000527224 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS1-205ENST00000527224 SYNJ1O43426 1573 aa25.05■■□□□ 1.6
PACS1-205ENST00000527224 TONSLQ96HA7 1378 aa25.05■■□□□ 1.6
PACS1-205ENST00000527224 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.04■■□□□ 1.6
PACS1-205ENST00000527224 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PACS1-205ENST00000527224 SLC4A3P48751 1232 aa25.02■■□□□ 1.6
PACS1-205ENST00000527224 NFKBIBQ15653 356 aa24.98■■□□□ 1.59
PACS1-205ENST00000527224 PDE4AP27815 886 aa24.96■■□□□ 1.59
PACS1-205ENST00000527224 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.94■■□□□ 1.58
PACS1-205ENST00000527224 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.91■■□□□ 1.58
PACS1-205ENST00000527224 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.91■■□□□ 1.58
PACS1-205ENST00000527224 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PACS1-205ENST00000527224 SKAP1Q86WV1 359 aa24.91■■□□□ 1.58
PACS1-205ENST00000527224 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PACS1-205ENST00000527224 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.86■■□□□ 1.57
PACS1-205ENST00000527224 BACH2Q9BYV9 841 aa24.84■■□□□ 1.57
PACS1-205ENST00000527224 NUDCQ9Y266 331 aa24.84■■□□□ 1.57
PACS1-205ENST00000527224 NCAPD3P42695 1498 aa24.82■■□□□ 1.56
PACS1-205ENST00000527224 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.8■■□□□ 1.56
PACS1-205ENST00000527224 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.79■■□□□ 1.56
PACS1-205ENST00000527224 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PACS1-205ENST00000527224 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PACS1-205ENST00000527224 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PACS1-205ENST00000527224 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PACS1-205ENST00000527224 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.75■■□□□ 1.55
PACS1-205ENST00000527224 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PACS1-205ENST00000527224 ARXQ96QS3 562 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS1-205ENST00000527224 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS1-205ENST00000527224 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PACS1-205ENST00000527224 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PACS1-205ENST00000527224 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.7■■□□□ 1.54
PACS1-205ENST00000527224 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
PACS1-205ENST00000527224 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PACS1-205ENST00000527224 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.67■■□□□ 1.54
PACS1-205ENST00000527224 TOP2BQ02880 1626 aa24.65■■□□□ 1.54
PACS1-205ENST00000527224 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.64■■□□□ 1.54
PACS1-205ENST00000527224 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.63■■□□□ 1.53
PACS1-205ENST00000527224 HMGXB3Q12766 1538 aa24.62■■□□□ 1.53
PACS1-205ENST00000527224 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PACS1-205ENST00000527224 PRXQ9BXM0 1461 aa24.58■■□□□ 1.53
PACS1-205ENST00000527224 CUX1P39880 1505 aa24.58■■□□□ 1.52
PACS1-205ENST00000527224 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PACS1-205ENST00000527224 POGKQ9P215 609 aa24.57■■□□□ 1.52
PACS1-205ENST00000527224 CCDC7Q96M83 1385 aa24.57■■□□□ 1.52
PACS1-205ENST00000527224 NCOA2Q15596 1464 aa24.57■■□□□ 1.52
PACS1-205ENST00000527224 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PACS1-205ENST00000527224 MS4A1P11836 297 aa24.56■■□□□ 1.52
PACS1-205ENST00000527224 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PACS1-205ENST00000527224 P3H3Q8IVL6 736 aa24.52■■□□□ 1.52
PACS1-205ENST00000527224 CFTRP13569 1480 aa24.51■■□□□ 1.51
PACS1-205ENST00000527224 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.51■■□□□ 1.51
PACS1-205ENST00000527224 TIAM1Q13009 1591 aa24.51■■□□□ 1.51
PACS1-205ENST00000527224 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.51■■□□□ 1.51
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