RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521812.1

MEG3-218, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEG3, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-218ENST00000521812 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.64■■■□□ 2.17
MEG3-218ENST00000521812 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
MEG3-218ENST00000521812 MAPKBP1O60336 1514 aa28.61■■■□□ 2.17
MEG3-218ENST00000521812 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
MEG3-218ENST00000521812 DIP2BQ9P265 1576 aa28.58■■■□□ 2.17
MEG3-218ENST00000521812 TOP2BQ02880 1626 aa28.54■■■□□ 2.16
MEG3-218ENST00000521812 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.54■■■□□ 2.16
MEG3-218ENST00000521812 KDM6BO15054 1643 aa28.53■■■□□ 2.16
MEG3-218ENST00000521812 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.48■■■□□ 2.15
MEG3-218ENST00000521812 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.47■■■□□ 2.15
MEG3-218ENST00000521812 TSPOAP1O95153 1857 aa28.36■■■□□ 2.13
MEG3-218ENST00000521812 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.28■■■□□ 2.12
MEG3-218ENST00000521812 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
MEG3-218ENST00000521812 ADGRL1O94910 1474 aa28.21■■■□□ 2.11
MEG3-218ENST00000521812 PTPRGP23470 1445 aa28.18■■■□□ 2.1
MEG3-218ENST00000521812 ABCC2Q92887 1545 aa28.13■■■□□ 2.09
MEG3-218ENST00000521812 IGF1RP08069 1367 aa28.12■■■□□ 2.09
MEG3-218ENST00000521812 ASXL2Q76L83 1435 aa28.12■■■□□ 2.09
MEG3-218ENST00000521812 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
MEG3-218ENST00000521812 GLI2P10070 1586 aa28.11■■■□□ 2.09
MEG3-218ENST00000521812 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.11■■■□□ 2.09
MEG3-218ENST00000521812 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
MEG3-218ENST00000521812 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.07■■■□□ 2.08
MEG3-218ENST00000521812 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.07■■■□□ 2.08
MEG3-218ENST00000521812 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
MEG3-218ENST00000521812 CUL7Q14999 1698 aa28.03■■■□□ 2.08
MEG3-218ENST00000521812 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.02■■■□□ 2.08
MEG3-218ENST00000521812 KIF27Q86VH2 1401 aa28.01■■■□□ 2.07
MEG3-218ENST00000521812 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28■■■□□ 2.07
MEG3-218ENST00000521812 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
MEG3-218ENST00000521812 UACAQ9BZF9 1416 aa27.93■■■□□ 2.06
MEG3-218ENST00000521812 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.92■■■□□ 2.06
MEG3-218ENST00000521812 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.92■■■□□ 2.06
MEG3-218ENST00000521812 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.91■■■□□ 2.06
MEG3-218ENST00000521812 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.87■■■□□ 2.05
MEG3-218ENST00000521812 IQGAP2Q13576 1575 aa27.86■■■□□ 2.05
MEG3-218ENST00000521812 DISP1Q96F81 1524 aa27.82■■■□□ 2.04
MEG3-218ENST00000521812 FBXO41Q8TF61 875 aa27.77■■■□□ 2.04
MEG3-218ENST00000521812 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
MEG3-218ENST00000521812 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.71■■■□□ 2.03
MEG3-218ENST00000521812 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.68■■■□□ 2.02
MEG3-218ENST00000521812 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.65■■■□□ 2.02
MEG3-218ENST00000521812 CD109Q6YHK3 1445 aa27.64■■■□□ 2.02
MEG3-218ENST00000521812 KIAA0556O60303 1618 aa27.62■■■□□ 2.01
MEG3-218ENST00000521812 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.56■■■□□ 2
MEG3-218ENST00000521812 KCNH8Q96L42 1107 aa27.55■■■□□ 2
MEG3-218ENST00000521812 KIF21BO75037 1637 aa27.55■■■□□ 2
MEG3-218ENST00000521812 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.54■■■□□ 2
MEG3-218ENST00000521812 PTPRMP28827 1452 aa27.46■■□□□ 1.99
MEG3-218ENST00000521812 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.46■■□□□ 1.99
MEG3-218ENST00000521812 ABCA8O94911 1581 aa27.43■■□□□ 1.98
MEG3-218ENST00000521812 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.4■■□□□ 1.98
MEG3-218ENST00000521812 GOLGA3Q08378 1498 aa27.38■■□□□ 1.97
MEG3-218ENST00000521812 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.33■■□□□ 1.97
MEG3-218ENST00000521812 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
MEG3-218ENST00000521812 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.3■■□□□ 1.96
MEG3-218ENST00000521812 RAPGEF3O95398 923 aa27.28■■□□□ 1.96
MEG3-218ENST00000521812 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.27■■□□□ 1.96
MEG3-218ENST00000521812 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.24■■□□□ 1.95
MEG3-218ENST00000521812 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
MEG3-218ENST00000521812 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
MEG3-218ENST00000521812 ARID3CA6NKF2 412 aa27.23■■□□□ 1.95
MEG3-218ENST00000521812 ATP10BO94823 1461 aa27.23■■□□□ 1.95
MEG3-218ENST00000521812 MADDQ8WXG6 1647 aa27.23■■□□□ 1.95
MEG3-218ENST00000521812 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.22■■□□□ 1.95
MEG3-218ENST00000521812 NEO1Q92859 1461 aa27.19■■□□□ 1.94
MEG3-218ENST00000521812 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.15■■□□□ 1.94
MEG3-218ENST00000521812 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
MEG3-218ENST00000521812 HSPA2P54652 639 aa27.13■■□□□ 1.93
MEG3-218ENST00000521812 CERKQ8TCT0 537 aa27.11■■□□□ 1.93
MEG3-218ENST00000521812 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
MEG3-218ENST00000521812 P3H3Q8IVL6 736 aa27.08■■□□□ 1.93
MEG3-218ENST00000521812 PRXQ9BXM0 1461 aa27.06■■□□□ 1.92
MEG3-218ENST00000521812 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.06■■□□□ 1.92
MEG3-218ENST00000521812 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
MEG3-218ENST00000521812 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27■■□□□ 1.91
MEG3-218ENST00000521812 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
MEG3-218ENST00000521812 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
MEG3-218ENST00000521812 ILDR2Q71H61 639 aa26.99■■□□□ 1.91
MEG3-218ENST00000521812 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.98■■□□□ 1.91
MEG3-218ENST00000521812 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.97■■□□□ 1.91
MEG3-218ENST00000521812 FANCAO15360 1455 aa26.96■■□□□ 1.91
MEG3-218ENST00000521812 SOCS7O14512 581 aa26.96■■□□□ 1.91
MEG3-218ENST00000521812 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.96■■□□□ 1.91
MEG3-218ENST00000521812 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.95■■□□□ 1.91
MEG3-218ENST00000521812 AKNAQ7Z591 1439 aa26.95■■□□□ 1.9
MEG3-218ENST00000521812 RICTORQ6R327 1708 aa26.94■■□□□ 1.9
MEG3-218ENST00000521812 SAMD9Q5K651 1589 aa26.9■■□□□ 1.9
MEG3-218ENST00000521812 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
MEG3-218ENST00000521812 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.89■■□□□ 1.89
MEG3-218ENST00000521812 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.88■■□□□ 1.89
MEG3-218ENST00000521812 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.87■■□□□ 1.89
MEG3-218ENST00000521812 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.86■■□□□ 1.89
MEG3-218ENST00000521812 MLECQ14165 292 aa26.86■■□□□ 1.89
MEG3-218ENST00000521812 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.85■■□□□ 1.89
MEG3-218ENST00000521812 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
MEG3-218ENST00000521812 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.84■■□□□ 1.89
MEG3-218ENST00000521812 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.84■■□□□ 1.89
MEG3-218ENST00000521812 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.83■■□□□ 1.89
MEG3-218ENST00000521812 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms