RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515737.5

SH3BP2-228, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,579 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-228ENST00000515737 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.24■■□□□ 1.79
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SH3BP2-228ENST00000515737 APLP2Q06481 763 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-228ENST00000515737 ADAMTS12P58397 1594 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-228ENST00000515737 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.14■■□□□ 1.77
SH3BP2-228ENST00000515737 P3H3Q8IVL6 736 aa26.13■■□□□ 1.77
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SH3BP2-228ENST00000515737 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
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SH3BP2-228ENST00000515737 HFM1A2PYH4 1435 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-228ENST00000515737 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
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SH3BP2-228ENST00000515737 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.9■■□□□ 1.58
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