RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514296.5

POLK-216, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 5

Gene POLK, Length 1,536 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-216ENST00000514296 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.99■■□□□ 1.27
POLK-216ENST00000514296 JPH4Q96JJ6 628 aa22.95■■□□□ 1.26
POLK-216ENST00000514296 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.84■■□□□ 1.25
POLK-216ENST00000514296 CUL7Q14999 1698 aa22.8■■□□□ 1.24
POLK-216ENST00000514296 IGF1RP08069 1367 aa22.8■■□□□ 1.24
POLK-216ENST00000514296 KIF27Q86VH2 1401 aa22.79■■□□□ 1.24
POLK-216ENST00000514296 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.78■■□□□ 1.24
POLK-216ENST00000514296 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.77■■□□□ 1.24
POLK-216ENST00000514296 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.77■■□□□ 1.23
POLK-216ENST00000514296 DIP2BQ9P265 1576 aa22.76■■□□□ 1.23
POLK-216ENST00000514296 MAPKBP1O60336 1514 aa22.75■■□□□ 1.23
POLK-216ENST00000514296 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
POLK-216ENST00000514296 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
POLK-216ENST00000514296 TSPOAP1O95153 1857 aa22.7■■□□□ 1.22
POLK-216ENST00000514296 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.66■■□□□ 1.22
POLK-216ENST00000514296 PTPRGP23470 1445 aa22.61■■□□□ 1.21
POLK-216ENST00000514296 KDM6BO15054 1643 aa22.61■■□□□ 1.21
POLK-216ENST00000514296 IQGAP2Q13576 1575 aa22.59■■□□□ 1.21
POLK-216ENST00000514296 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.55■■□□□ 1.2
POLK-216ENST00000514296 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.55■■□□□ 1.2
POLK-216ENST00000514296 ABCC2Q92887 1545 aa22.52■■□□□ 1.2
POLK-216ENST00000514296 DISP1Q96F81 1524 aa22.49■■□□□ 1.19
POLK-216ENST00000514296 ASXL2Q76L83 1435 aa22.49■■□□□ 1.19
POLK-216ENST00000514296 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
POLK-216ENST00000514296 UACAQ9BZF9 1416 aa22.44■■□□□ 1.18
POLK-216ENST00000514296 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.43■■□□□ 1.18
POLK-216ENST00000514296 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.43■■□□□ 1.18
POLK-216ENST00000514296 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.43■■□□□ 1.18
POLK-216ENST00000514296 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.43■■□□□ 1.18
POLK-216ENST00000514296 GLI2P10070 1586 aa22.41■■□□□ 1.18
POLK-216ENST00000514296 KIAA0556O60303 1618 aa22.41■■□□□ 1.18
POLK-216ENST00000514296 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.4■■□□□ 1.18
POLK-216ENST00000514296 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
POLK-216ENST00000514296 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.35■■□□□ 1.17
POLK-216ENST00000514296 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.35■■□□□ 1.17
POLK-216ENST00000514296 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
POLK-216ENST00000514296 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.34■■□□□ 1.17
POLK-216ENST00000514296 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
POLK-216ENST00000514296 ADGRL1O94910 1474 aa22.24■■□□□ 1.15
POLK-216ENST00000514296 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.23■■□□□ 1.15
POLK-216ENST00000514296 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.22■■□□□ 1.15
POLK-216ENST00000514296 ABCA8O94911 1581 aa22.19■■□□□ 1.14
POLK-216ENST00000514296 GOLGA3Q08378 1498 aa22.18■■□□□ 1.14
POLK-216ENST00000514296 PRXQ9BXM0 1461 aa22.16■■□□□ 1.14
POLK-216ENST00000514296 KCNH8Q96L42 1107 aa22.15■■□□□ 1.14
POLK-216ENST00000514296 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.13■■□□□ 1.13
POLK-216ENST00000514296 ARID3CA6NKF2 412 aa22.12■■□□□ 1.13
POLK-216ENST00000514296 CD109Q6YHK3 1445 aa22.11■■□□□ 1.13
POLK-216ENST00000514296 P3H3Q8IVL6 736 aa22.09■■□□□ 1.13
POLK-216ENST00000514296 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.07■■□□□ 1.12
POLK-216ENST00000514296 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.02■■□□□ 1.12
POLK-216ENST00000514296 KIF21BO75037 1637 aa22.01■■□□□ 1.11
POLK-216ENST00000514296 ATP10BO94823 1461 aa21.99■■□□□ 1.11
POLK-216ENST00000514296 SAMD9Q5K651 1589 aa21.98■■□□□ 1.11
POLK-216ENST00000514296 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.94■■□□□ 1.1
POLK-216ENST00000514296 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
POLK-216ENST00000514296 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
POLK-216ENST00000514296 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.93■■□□□ 1.1
POLK-216ENST00000514296 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.92■■□□□ 1.1
POLK-216ENST00000514296 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.9■■□□□ 1.1
POLK-216ENST00000514296 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
POLK-216ENST00000514296 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
POLK-216ENST00000514296 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
POLK-216ENST00000514296 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.86■■□□□ 1.09
POLK-216ENST00000514296 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
POLK-216ENST00000514296 RAPGEF3O95398 923 aa21.83■■□□□ 1.09
POLK-216ENST00000514296 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.81■■□□□ 1.08
POLK-216ENST00000514296 NEO1Q92859 1461 aa21.78■■□□□ 1.08
POLK-216ENST00000514296 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.77■■□□□ 1.08
POLK-216ENST00000514296 EEA1Q15075 1411 aa21.76■■□□□ 1.07
POLK-216ENST00000514296 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.75■■□□□ 1.07
POLK-216ENST00000514296 PTPRMP28827 1452 aa21.72■■□□□ 1.07
POLK-216ENST00000514296 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.72■■□□□ 1.07
POLK-216ENST00000514296 MADDQ8WXG6 1647 aa21.72■■□□□ 1.07
POLK-216ENST00000514296 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.71■■□□□ 1.07
POLK-216ENST00000514296 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.7■■□□□ 1.07
POLK-216ENST00000514296 RICTORQ6R327 1708 aa21.7■■□□□ 1.06
POLK-216ENST00000514296 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
POLK-216ENST00000514296 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
POLK-216ENST00000514296 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.68■■□□□ 1.06
POLK-216ENST00000514296 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.68■■□□□ 1.06
POLK-216ENST00000514296 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
POLK-216ENST00000514296 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.68■■□□□ 1.06
POLK-216ENST00000514296 FANCAO15360 1455 aa21.65■■□□□ 1.06
POLK-216ENST00000514296 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
POLK-216ENST00000514296 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
POLK-216ENST00000514296 AKNAQ7Z591 1439 aa21.65■■□□□ 1.06
POLK-216ENST00000514296 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.64■■□□□ 1.05
POLK-216ENST00000514296 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.63■■□□□ 1.05
POLK-216ENST00000514296 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.58■■□□□ 1.04
POLK-216ENST00000514296 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.57■■□□□ 1.04
POLK-216ENST00000514296 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
POLK-216ENST00000514296 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.56■■□□□ 1.04
POLK-216ENST00000514296 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.56■■□□□ 1.04
POLK-216ENST00000514296 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
POLK-216ENST00000514296 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.55■■□□□ 1.04
POLK-216ENST00000514296 HECW1Q76N89 1606 aa21.54■■□□□ 1.04
POLK-216ENST00000514296 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
POLK-216ENST00000514296 KIF14Q15058 1648 aa21.51■■□□□ 1.03
POLK-216ENST00000514296 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 143.9 ms