RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
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UBE2B-208ENST00000511807 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.45■□□□□ 0.7
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UBE2B-208ENST00000511807 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.37■□□□□ 0.69
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UBE2B-208ENST00000511807 KCNH8Q96L42 1107 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-208ENST00000511807 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
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UBE2B-208ENST00000511807 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.61■□□□□ 0.57
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UBE2B-208ENST00000511807 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.55■□□□□ 0.56
UBE2B-208ENST00000511807 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.53■□□□□ 0.56
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UBE2B-208ENST00000511807 RAPGEF3O95398 923 aa18.52■□□□□ 0.56
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UBE2B-208ENST00000511807 NEO1Q92859 1461 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2B-208ENST00000511807 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.49■□□□□ 0.55
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UBE2B-208ENST00000511807 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.47■□□□□ 0.55
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UBE2B-208ENST00000511807 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-208ENST00000511807 PLCH2O75038 1416 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-208ENST00000511807 RICTORQ6R327 1708 aa18.29■□□□□ 0.52
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UBE2B-208ENST00000511807 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.28■□□□□ 0.52
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UBE2B-208ENST00000511807 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.26■□□□□ 0.51
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