RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510021.5

UBE2B-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 415 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-207ENST00000510021 TSPOAP1O95153 1857 aa29.24■■■□□ 2.27
UBE2B-207ENST00000510021 ADAMTS12P58397 1594 aa29.22■■■□□ 2.27
UBE2B-207ENST00000510021 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.21■■■□□ 2.27
UBE2B-207ENST00000510021 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
UBE2B-207ENST00000510021 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.16■■■□□ 2.26
UBE2B-207ENST00000510021 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.1■■■□□ 2.25
UBE2B-207ENST00000510021 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.03■■■□□ 2.24
UBE2B-207ENST00000510021 LMTK3Q96Q04 1460 aa29■■■□□ 2.23
UBE2B-207ENST00000510021 JPH4Q96JJ6 628 aa28.99■■■□□ 2.23
UBE2B-207ENST00000510021 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
UBE2B-207ENST00000510021 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.85■■■□□ 2.21
UBE2B-207ENST00000510021 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
UBE2B-207ENST00000510021 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.81■■■□□ 2.2
UBE2B-207ENST00000510021 GLI2P10070 1586 aa28.77■■■□□ 2.2
UBE2B-207ENST00000510021 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
UBE2B-207ENST00000510021 SOCS7O14512 581 aa28.75■■■□□ 2.19
UBE2B-207ENST00000510021 TOP2BQ02880 1626 aa28.74■■■□□ 2.19
UBE2B-207ENST00000510021 ILDR2Q71H61 639 aa28.68■■■□□ 2.18
UBE2B-207ENST00000510021 ASXL2Q76L83 1435 aa28.64■■■□□ 2.18
UBE2B-207ENST00000510021 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.63■■■□□ 2.17
UBE2B-207ENST00000510021 ABCC2Q92887 1545 aa28.59■■■□□ 2.17
UBE2B-207ENST00000510021 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.57■■■□□ 2.16
UBE2B-207ENST00000510021 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.54■■■□□ 2.16
UBE2B-207ENST00000510021 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.51■■■□□ 2.15
UBE2B-207ENST00000510021 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.5■■■□□ 2.15
UBE2B-207ENST00000510021 PTPRGP23470 1445 aa28.5■■■□□ 2.15
UBE2B-207ENST00000510021 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.49■■■□□ 2.15
UBE2B-207ENST00000510021 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
UBE2B-207ENST00000510021 CUL7Q14999 1698 aa28.48■■■□□ 2.15
UBE2B-207ENST00000510021 KIF21BO75037 1637 aa28.39■■■□□ 2.13
UBE2B-207ENST00000510021 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.37■■■□□ 2.13
UBE2B-207ENST00000510021 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
UBE2B-207ENST00000510021 PTPRMP28827 1452 aa28.34■■■□□ 2.13
UBE2B-207ENST00000510021 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.12
UBE2B-207ENST00000510021 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.32■■■□□ 2.12
UBE2B-207ENST00000510021 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.27■■■□□ 2.12
UBE2B-207ENST00000510021 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.26■■■□□ 2.12
UBE2B-207ENST00000510021 UACAQ9BZF9 1416 aa28.25■■■□□ 2.11
UBE2B-207ENST00000510021 CERKQ8TCT0 537 aa28.24■■■□□ 2.11
UBE2B-207ENST00000510021 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.22■■■□□ 2.11
UBE2B-207ENST00000510021 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.2■■■□□ 2.11
UBE2B-207ENST00000510021 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
UBE2B-207ENST00000510021 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.17■■■□□ 2.1
UBE2B-207ENST00000510021 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.11■■■□□ 2.09
UBE2B-207ENST00000510021 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.1■■■□□ 2.09
UBE2B-207ENST00000510021 CD109Q6YHK3 1445 aa28.09■■■□□ 2.09
UBE2B-207ENST00000510021 IGF1RP08069 1367 aa28.05■■■□□ 2.08
UBE2B-207ENST00000510021 MADDQ8WXG6 1647 aa28.05■■■□□ 2.08
UBE2B-207ENST00000510021 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.02■■■□□ 2.08
UBE2B-207ENST00000510021 HSPA2P54652 639 aa28.02■■■□□ 2.08
UBE2B-207ENST00000510021 DISP1Q96F81 1524 aa28.01■■■□□ 2.07
UBE2B-207ENST00000510021 IQGAP2Q13576 1575 aa28■■■□□ 2.07
UBE2B-207ENST00000510021 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28■■■□□ 2.07
UBE2B-207ENST00000510021 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
UBE2B-207ENST00000510021 KCNH8Q96L42 1107 aa27.84■■■□□ 2.05
UBE2B-207ENST00000510021 KIF27Q86VH2 1401 aa27.84■■■□□ 2.05
UBE2B-207ENST00000510021 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.81■■■□□ 2.04
UBE2B-207ENST00000510021 KIAA0556O60303 1618 aa27.79■■■□□ 2.04
UBE2B-207ENST00000510021 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.79■■■□□ 2.04
UBE2B-207ENST00000510021 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
UBE2B-207ENST00000510021 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.73■■■□□ 2.03
UBE2B-207ENST00000510021 RAPGEF3O95398 923 aa27.72■■■□□ 2.03
UBE2B-207ENST00000510021 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.7■■■□□ 2.03
UBE2B-207ENST00000510021 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.66■■■□□ 2.02
UBE2B-207ENST00000510021 ABCA8O94911 1581 aa27.65■■■□□ 2.02
UBE2B-207ENST00000510021 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.64■■■□□ 2.02
UBE2B-207ENST00000510021 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.6■■■□□ 2.01
UBE2B-207ENST00000510021 STRCQ7RTU9 1775 aa27.6■■■□□ 2.01
UBE2B-207ENST00000510021 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.59■■■□□ 2.01
UBE2B-207ENST00000510021 NEO1Q92859 1461 aa27.59■■■□□ 2.01
UBE2B-207ENST00000510021 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.55■■■□□ 2
UBE2B-207ENST00000510021 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.54■■■□□ 2
UBE2B-207ENST00000510021 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.53■■■□□ 2
UBE2B-207ENST00000510021 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.51■■□□□ 1.99
UBE2B-207ENST00000510021 FANCAO15360 1455 aa27.51■■□□□ 1.99
UBE2B-207ENST00000510021 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.5■■□□□ 1.99
UBE2B-207ENST00000510021 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.49■■□□□ 1.99
UBE2B-207ENST00000510021 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.49■■□□□ 1.99
UBE2B-207ENST00000510021 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.47■■□□□ 1.99
UBE2B-207ENST00000510021 RICTORQ6R327 1708 aa27.44■■□□□ 1.98
UBE2B-207ENST00000510021 PTPRTO14522 1441 aa27.41■■□□□ 1.98
UBE2B-207ENST00000510021 AKNAQ7Z591 1439 aa27.41■■□□□ 1.98
UBE2B-207ENST00000510021 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.38■■□□□ 1.97
UBE2B-207ENST00000510021 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
UBE2B-207ENST00000510021 ATP10BO94823 1461 aa27.38■■□□□ 1.97
UBE2B-207ENST00000510021 GOLGA3Q08378 1498 aa27.38■■□□□ 1.97
UBE2B-207ENST00000510021 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
UBE2B-207ENST00000510021 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.36■■□□□ 1.97
UBE2B-207ENST00000510021 MLECQ14165 292 aa27.34■■□□□ 1.97
UBE2B-207ENST00000510021 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.34■■□□□ 1.97
UBE2B-207ENST00000510021 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.32■■□□□ 1.96
UBE2B-207ENST00000510021 ARID3CA6NKF2 412 aa27.32■■□□□ 1.96
UBE2B-207ENST00000510021 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.31■■□□□ 1.96
UBE2B-207ENST00000510021 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.3■■□□□ 1.96
UBE2B-207ENST00000510021 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.29■■□□□ 1.96
UBE2B-207ENST00000510021 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.29■■□□□ 1.96
UBE2B-207ENST00000510021 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
UBE2B-207ENST00000510021 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
UBE2B-207ENST00000510021 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
UBE2B-207ENST00000510021 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.22■■□□□ 1.95
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