RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.23■■■□□ 2.91
SMIM20-201ENST00000506197 CUL7Q14999 1698 aa33.21■■■□□ 2.91
SMIM20-201ENST00000506197 IGF1RP08069 1367 aa33.2■■■□□ 2.9
SMIM20-201ENST00000506197 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.14■■■□□ 2.9
SMIM20-201ENST00000506197 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
SMIM20-201ENST00000506197 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.06■■■□□ 2.88
SMIM20-201ENST00000506197 JPH4Q96JJ6 628 aa33.05■■■□□ 2.88
SMIM20-201ENST00000506197 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.99■■■□□ 2.87
SMIM20-201ENST00000506197 PRXQ9BXM0 1461 aa32.98■■■□□ 2.87
SMIM20-201ENST00000506197 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.97■■■□□ 2.87
SMIM20-201ENST00000506197 KIF21BO75037 1637 aa32.96■■■□□ 2.87
SMIM20-201ENST00000506197 GOLGA3Q08378 1498 aa32.81■■■□□ 2.84
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SMIM20-201ENST00000506197 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.74■■■□□ 2.83
SMIM20-201ENST00000506197 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.73■■■□□ 2.83
SMIM20-201ENST00000506197 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.7■■■□□ 2.83
SMIM20-201ENST00000506197 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.66■■■□□ 2.82
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SMIM20-201ENST00000506197 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.58■■■□□ 2.81
SMIM20-201ENST00000506197 DISP1Q96F81 1524 aa32.55■■■□□ 2.8
SMIM20-201ENST00000506197 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.55■■■□□ 2.8
SMIM20-201ENST00000506197 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.54■■■□□ 2.8
SMIM20-201ENST00000506197 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.53■■■□□ 2.8
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SMIM20-201ENST00000506197 KIAA0556O60303 1618 aa32.48■■■□□ 2.79
SMIM20-201ENST00000506197 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.44■■■□□ 2.78
SMIM20-201ENST00000506197 ABCC2Q92887 1545 aa32.44■■■□□ 2.78
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SMIM20-201ENST00000506197 TSPOAP1O95153 1857 aa32.31■■■□□ 2.76
SMIM20-201ENST00000506197 ASXL2Q76L83 1435 aa32.28■■■□□ 2.76
SMIM20-201ENST00000506197 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.27■■■□□ 2.76
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SMIM20-201ENST00000506197 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.26■■■□□ 2.75
SMIM20-201ENST00000506197 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
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SMIM20-201ENST00000506197 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.16■■■□□ 2.74
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SMIM20-201ENST00000506197 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
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SMIM20-201ENST00000506197 HECW1Q76N89 1606 aa31.76■■■□□ 2.67
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SMIM20-201ENST00000506197 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.74■■■□□ 2.67
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SMIM20-201ENST00000506197 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.34■■■□□ 2.61
SMIM20-201ENST00000506197 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.31■■■□□ 2.6
SMIM20-201ENST00000506197 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.31■■■□□ 2.6
SMIM20-201ENST00000506197 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.31■■■□□ 2.6
SMIM20-201ENST00000506197 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
SMIM20-201ENST00000506197 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.28■■■□□ 2.6
SMIM20-201ENST00000506197 FANCAO15360 1455 aa31.27■■■□□ 2.6
SMIM20-201ENST00000506197 RAPGEF3O95398 923 aa31.27■■■□□ 2.6
SMIM20-201ENST00000506197 KIF14Q15058 1648 aa31.24■■■□□ 2.59
SMIM20-201ENST00000506197 RICTORQ6R327 1708 aa31.24■■■□□ 2.59
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