RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503393.6

SH3BP2-207, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-207ENST00000503393 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.87
SH3BP2-207ENST00000503393 SCRIBQ14160 1630 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-207ENST00000503393 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-207ENST00000503393 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-207ENST00000503393 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-207ENST00000503393 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-207ENST00000503393 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-207ENST00000503393 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-207ENST00000503393 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-207ENST00000503393 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-207ENST00000503393 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-207ENST00000503393 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-207ENST00000503393 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-207ENST00000503393 CLIP1P30622 1438 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-207ENST00000503393 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-207ENST00000503393 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.857e-8■■□□□ 12
SH3BP2-207ENST00000503393 CASC1Q6TDU7 716 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-207ENST00000503393 TSPY4P0CV99 314 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-207ENST00000503393 TSPY10P0CW01 314 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-207ENST00000503393 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-207ENST00000503393 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-207ENST00000503393 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-207ENST00000503393 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-207ENST00000503393 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-207ENST00000503393 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-207ENST00000503393 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-207ENST00000503393 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-207ENST00000503393 CEP162Q5TB80 1403 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-207ENST00000503393 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-207ENST00000503393 GOLGA3Q08378 1498 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-207ENST00000503393 RGS3P49796 1198 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-207ENST00000503393 EEA1Q15075 1411 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-207ENST00000503393 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-207ENST00000503393 NRDCO43847 1150 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-207ENST00000503393 PLCB2Q00722 1185 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-207ENST00000503393 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-207ENST00000503393 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-207ENST00000503393 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-207ENST00000503393 CDCA8Q53HL2 280 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-207ENST00000503393 CFAP53Q96M91 514 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-207ENST00000503393 HSCBQ8IWL3 235 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-207ENST00000503393 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-207ENST00000503393 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-207ENST00000503393 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-207ENST00000503393 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-207ENST00000503393 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-207ENST00000503393 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.08■□□□□ 0.8
SH3BP2-207ENST00000503393 MS4A1P11836 297 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-207ENST00000503393 CCER2I3L3R5 266 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-207ENST00000503393 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-207ENST00000503393 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-207ENST00000503393 PTMSP20962 102 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-207ENST00000503393 RGL3Q3MIN7 710 aa20.02■□□□□ 0.79
SH3BP2-207ENST00000503393 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-207ENST00000503393 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SH3BP2-207ENST00000503393 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-207ENST00000503393 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-207ENST00000503393 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-207ENST00000503393 KIAA2012Q0VF49 1180 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-207ENST00000503393 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-207ENST00000503393 NEUROD2Q15784 382 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-207ENST00000503393 GBP4Q96PP9 640 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-207ENST00000503393 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-207ENST00000503393 CFAP44Q96MT7 982 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP2-207ENST00000503393 DRC7Q8IY82 874 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP2-207ENST00000503393 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP2-207ENST00000503393 NUDCQ9Y266 331 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP2-207ENST00000503393 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
SH3BP2-207ENST00000503393 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
SH3BP2-207ENST00000503393 FGD1P98174 961 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP2-207ENST00000503393 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP2-207ENST00000503393 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP2-207ENST00000503393 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP2-207ENST00000503393 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.78
SH3BP2-207ENST00000503393 MCCP23508 829 aa19.89■□□□□ 0.78
SH3BP2-207ENST00000503393 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.78
SH3BP2-207ENST00000503393 C14orf37Q86TY3 774 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 KCNJ4P48050 445 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 USP35Q9P2H5 1018 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 A0A0G2JS52 829 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 ARID3AQ99856 593 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 ZBTB7CA1YPR0 619 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 KIF27Q86VH2 1401 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP2-207ENST00000503393 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
SH3BP2-207ENST00000503393 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP2-207ENST00000503393 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP2-207ENST00000503393 RCAN3Q9UKA8 241 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP2-207ENST00000503393 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP2-207ENST00000503393 TMF1P82094 1093 aa19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms