RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496892.5

POLR1A-210, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-210ENST00000496892 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.11■■□□□ 1.45
POLR1A-210ENST00000496892 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.11■■□□□ 1.45
POLR1A-210ENST00000496892 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.1■■□□□ 1.45
POLR1A-210ENST00000496892 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
POLR1A-210ENST00000496892 MAPKBP1O60336 1514 aa24.05■■□□□ 1.44
POLR1A-210ENST00000496892 DIP2BQ9P265 1576 aa24.03■■□□□ 1.44
POLR1A-210ENST00000496892 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.02■■□□□ 1.44
POLR1A-210ENST00000496892 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.94■■□□□ 1.42
POLR1A-210ENST00000496892 KDM6BO15054 1643 aa23.92■■□□□ 1.42
POLR1A-210ENST00000496892 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.89■■□□□ 1.41
POLR1A-210ENST00000496892 IGF1RP08069 1367 aa23.89■■□□□ 1.41
POLR1A-210ENST00000496892 TSPOAP1O95153 1857 aa23.88■■□□□ 1.41
POLR1A-210ENST00000496892 KIF27Q86VH2 1401 aa23.84■■□□□ 1.41
POLR1A-210ENST00000496892 CUL7Q14999 1698 aa23.83■■□□□ 1.41
POLR1A-210ENST00000496892 PTPRGP23470 1445 aa23.81■■□□□ 1.4
POLR1A-210ENST00000496892 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
POLR1A-210ENST00000496892 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.74■■□□□ 1.39
POLR1A-210ENST00000496892 ABCC2Q92887 1545 aa23.74■■□□□ 1.39
POLR1A-210ENST00000496892 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.72■■□□□ 1.39
POLR1A-210ENST00000496892 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.71■■□□□ 1.39
POLR1A-210ENST00000496892 ASXL2Q76L83 1435 aa23.7■■□□□ 1.38
POLR1A-210ENST00000496892 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.68■■□□□ 1.38
POLR1A-210ENST00000496892 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
POLR1A-210ENST00000496892 GLI2P10070 1586 aa23.67■■□□□ 1.38
POLR1A-210ENST00000496892 IQGAP2Q13576 1575 aa23.65■■□□□ 1.38
POLR1A-210ENST00000496892 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.63■■□□□ 1.37
POLR1A-210ENST00000496892 UACAQ9BZF9 1416 aa23.61■■□□□ 1.37
POLR1A-210ENST00000496892 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
POLR1A-210ENST00000496892 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.59■■□□□ 1.37
POLR1A-210ENST00000496892 ADGRL1O94910 1474 aa23.59■■□□□ 1.37
POLR1A-210ENST00000496892 DISP1Q96F81 1524 aa23.59■■□□□ 1.37
POLR1A-210ENST00000496892 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
POLR1A-210ENST00000496892 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
POLR1A-210ENST00000496892 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.54■■□□□ 1.36
POLR1A-210ENST00000496892 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.52■■□□□ 1.36
POLR1A-210ENST00000496892 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.49■■□□□ 1.35
POLR1A-210ENST00000496892 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.49■■□□□ 1.35
POLR1A-210ENST00000496892 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
POLR1A-210ENST00000496892 KIAA0556O60303 1618 aa23.44■■□□□ 1.34
POLR1A-210ENST00000496892 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.44■■□□□ 1.34
POLR1A-210ENST00000496892 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.4■■□□□ 1.34
POLR1A-210ENST00000496892 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.4■■□□□ 1.34
POLR1A-210ENST00000496892 CD109Q6YHK3 1445 aa23.3■■□□□ 1.32
POLR1A-210ENST00000496892 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.29■■□□□ 1.32
POLR1A-210ENST00000496892 KCNH8Q96L42 1107 aa23.28■■□□□ 1.32
POLR1A-210ENST00000496892 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.28■■□□□ 1.32
POLR1A-210ENST00000496892 ABCA8O94911 1581 aa23.27■■□□□ 1.32
POLR1A-210ENST00000496892 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.26■■□□□ 1.31
POLR1A-210ENST00000496892 GOLGA3Q08378 1498 aa23.25■■□□□ 1.31
POLR1A-210ENST00000496892 KIF21BO75037 1637 aa23.18■■□□□ 1.3
POLR1A-210ENST00000496892 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.13■■□□□ 1.29
POLR1A-210ENST00000496892 ARID3CA6NKF2 412 aa23.11■■□□□ 1.29
POLR1A-210ENST00000496892 PRXQ9BXM0 1461 aa23.11■■□□□ 1.29
POLR1A-210ENST00000496892 ATP10BO94823 1461 aa23.07■■□□□ 1.28
POLR1A-210ENST00000496892 P3H3Q8IVL6 736 aa23.05■■□□□ 1.28
POLR1A-210ENST00000496892 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
POLR1A-210ENST00000496892 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.03■■□□□ 1.28
POLR1A-210ENST00000496892 PTPRMP28827 1452 aa23.02■■□□□ 1.28
POLR1A-210ENST00000496892 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.01■■□□□ 1.27
POLR1A-210ENST00000496892 FBXO41Q8TF61 875 aa23.01■■□□□ 1.27
POLR1A-210ENST00000496892 ADAMTSL3P82987 1691 aa23■■□□□ 1.27
POLR1A-210ENST00000496892 RAPGEF3O95398 923 aa23■■□□□ 1.27
POLR1A-210ENST00000496892 NEO1Q92859 1461 aa22.95■■□□□ 1.26
POLR1A-210ENST00000496892 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.93■■□□□ 1.26
POLR1A-210ENST00000496892 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.92■■□□□ 1.26
POLR1A-210ENST00000496892 SAMD9Q5K651 1589 aa22.92■■□□□ 1.26
POLR1A-210ENST00000496892 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.91■■□□□ 1.26
POLR1A-210ENST00000496892 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
POLR1A-210ENST00000496892 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
POLR1A-210ENST00000496892 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
POLR1A-210ENST00000496892 MADDQ8WXG6 1647 aa22.9■■□□□ 1.26
POLR1A-210ENST00000496892 EEA1Q15075 1411 aa22.89■■□□□ 1.25
POLR1A-210ENST00000496892 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
POLR1A-210ENST00000496892 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
POLR1A-210ENST00000496892 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.85■■□□□ 1.25
POLR1A-210ENST00000496892 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.82■■□□□ 1.24
POLR1A-210ENST00000496892 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.82■■□□□ 1.24
POLR1A-210ENST00000496892 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
POLR1A-210ENST00000496892 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
POLR1A-210ENST00000496892 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
POLR1A-210ENST00000496892 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.78■■□□□ 1.24
POLR1A-210ENST00000496892 RICTORQ6R327 1708 aa22.78■■□□□ 1.24
POLR1A-210ENST00000496892 AKNAQ7Z591 1439 aa22.77■■□□□ 1.24
POLR1A-210ENST00000496892 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.76■■□□□ 1.23
POLR1A-210ENST00000496892 FANCAO15360 1455 aa22.74■■□□□ 1.23
POLR1A-210ENST00000496892 HSPA2P54652 639 aa22.73■■□□□ 1.23
POLR1A-210ENST00000496892 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.72■■□□□ 1.23
POLR1A-210ENST00000496892 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.72■■□□□ 1.23
POLR1A-210ENST00000496892 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
POLR1A-210ENST00000496892 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.7■■□□□ 1.22
POLR1A-210ENST00000496892 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.7■■□□□ 1.22
POLR1A-210ENST00000496892 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.69■■□□□ 1.22
POLR1A-210ENST00000496892 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.69■■□□□ 1.22
POLR1A-210ENST00000496892 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.68■■□□□ 1.22
POLR1A-210ENST00000496892 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.68■■□□□ 1.22
POLR1A-210ENST00000496892 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.66■■□□□ 1.22
POLR1A-210ENST00000496892 MLECQ14165 292 aa22.64■■□□□ 1.21
POLR1A-210ENST00000496892 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.64■■□□□ 1.21
POLR1A-210ENST00000496892 HECW1Q76N89 1606 aa22.62■■□□□ 1.21
POLR1A-210ENST00000496892 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.61■■□□□ 1.21
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