RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494057.5

NICN1-206, Transcript of nicolin 1, humanhuman

TSL 2

Gene NICN1, Length 645 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-206ENST00000494057 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.81■■□□□ 1.88
NICN1-206ENST00000494057 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.74■■□□□ 1.87
NICN1-206ENST00000494057 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
NICN1-206ENST00000494057 MAPKBP1O60336 1514 aa26.73■■□□□ 1.87
NICN1-206ENST00000494057 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.71■■□□□ 1.87
NICN1-206ENST00000494057 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.66■■□□□ 1.86
NICN1-206ENST00000494057 DIP2BQ9P265 1576 aa26.66■■□□□ 1.86
NICN1-206ENST00000494057 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.64■■□□□ 1.85
NICN1-206ENST00000494057 IGF1RP08069 1367 aa26.58■■□□□ 1.84
NICN1-206ENST00000494057 KIF27Q86VH2 1401 aa26.57■■□□□ 1.84
NICN1-206ENST00000494057 CUL7Q14999 1698 aa26.57■■□□□ 1.84
NICN1-206ENST00000494057 KDM6BO15054 1643 aa26.52■■□□□ 1.84
NICN1-206ENST00000494057 PTPRGP23470 1445 aa26.46■■□□□ 1.83
NICN1-206ENST00000494057 TSPOAP1O95153 1857 aa26.42■■□□□ 1.82
NICN1-206ENST00000494057 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.4■■□□□ 1.82
NICN1-206ENST00000494057 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.4■■□□□ 1.82
NICN1-206ENST00000494057 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.4■■□□□ 1.82
NICN1-206ENST00000494057 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.38■■□□□ 1.81
NICN1-206ENST00000494057 ABCC2Q92887 1545 aa26.38■■□□□ 1.81
NICN1-206ENST00000494057 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
NICN1-206ENST00000494057 IQGAP2Q13576 1575 aa26.33■■□□□ 1.81
NICN1-206ENST00000494057 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.32■■□□□ 1.8
NICN1-206ENST00000494057 ASXL2Q76L83 1435 aa26.31■■□□□ 1.8
NICN1-206ENST00000494057 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.3■■□□□ 1.8
NICN1-206ENST00000494057 GLI2P10070 1586 aa26.29■■□□□ 1.8
NICN1-206ENST00000494057 UACAQ9BZF9 1416 aa26.25■■□□□ 1.79
NICN1-206ENST00000494057 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
NICN1-206ENST00000494057 DISP1Q96F81 1524 aa26.22■■□□□ 1.79
NICN1-206ENST00000494057 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.17■■□□□ 1.78
NICN1-206ENST00000494057 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
NICN1-206ENST00000494057 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.15■■□□□ 1.78
NICN1-206ENST00000494057 ADGRL1O94910 1474 aa26.13■■□□□ 1.77
NICN1-206ENST00000494057 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.13■■□□□ 1.77
NICN1-206ENST00000494057 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.13■■□□□ 1.77
NICN1-206ENST00000494057 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.12■■□□□ 1.77
NICN1-206ENST00000494057 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
NICN1-206ENST00000494057 KIAA0556O60303 1618 aa26.09■■□□□ 1.77
NICN1-206ENST00000494057 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
NICN1-206ENST00000494057 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.02■■□□□ 1.76
NICN1-206ENST00000494057 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
NICN1-206ENST00000494057 GOLGA3Q08378 1498 aa25.92■■□□□ 1.74
NICN1-206ENST00000494057 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.91■■□□□ 1.74
NICN1-206ENST00000494057 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.89■■□□□ 1.74
NICN1-206ENST00000494057 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.89■■□□□ 1.73
NICN1-206ENST00000494057 CD109Q6YHK3 1445 aa25.88■■□□□ 1.73
NICN1-206ENST00000494057 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.87■■□□□ 1.73
NICN1-206ENST00000494057 ABCA8O94911 1581 aa25.86■■□□□ 1.73
NICN1-206ENST00000494057 KCNH8Q96L42 1107 aa25.82■■□□□ 1.72
NICN1-206ENST00000494057 PRXQ9BXM0 1461 aa25.76■■□□□ 1.71
NICN1-206ENST00000494057 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
NICN1-206ENST00000494057 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.7■■□□□ 1.7
NICN1-206ENST00000494057 KIF21BO75037 1637 aa25.68■■□□□ 1.7
NICN1-206ENST00000494057 ATP10BO94823 1461 aa25.65■■□□□ 1.7
NICN1-206ENST00000494057 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.63■■□□□ 1.69
NICN1-206ENST00000494057 ARID3CA6NKF2 412 aa25.62■■□□□ 1.69
NICN1-206ENST00000494057 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.6■■□□□ 1.69
NICN1-206ENST00000494057 P3H3Q8IVL6 736 aa25.59■■□□□ 1.69
NICN1-206ENST00000494057 SAMD9Q5K651 1589 aa25.54■■□□□ 1.68
NICN1-206ENST00000494057 NEO1Q92859 1461 aa25.53■■□□□ 1.68
NICN1-206ENST00000494057 PTPRMP28827 1452 aa25.52■■□□□ 1.68
NICN1-206ENST00000494057 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.52■■□□□ 1.68
NICN1-206ENST00000494057 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.51■■□□□ 1.67
NICN1-206ENST00000494057 RAPGEF3O95398 923 aa25.5■■□□□ 1.67
NICN1-206ENST00000494057 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
NICN1-206ENST00000494057 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
NICN1-206ENST00000494057 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.44■■□□□ 1.66
NICN1-206ENST00000494057 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.44■■□□□ 1.66
NICN1-206ENST00000494057 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
NICN1-206ENST00000494057 FBXO41Q8TF61 875 aa25.42■■□□□ 1.66
NICN1-206ENST00000494057 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.42■■□□□ 1.66
NICN1-206ENST00000494057 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
NICN1-206ENST00000494057 MADDQ8WXG6 1647 aa25.38■■□□□ 1.65
NICN1-206ENST00000494057 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.37■■□□□ 1.65
NICN1-206ENST00000494057 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
NICN1-206ENST00000494057 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.35■■□□□ 1.65
NICN1-206ENST00000494057 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
NICN1-206ENST00000494057 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.32■■□□□ 1.64
NICN1-206ENST00000494057 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.32■■□□□ 1.64
NICN1-206ENST00000494057 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.32■■□□□ 1.64
NICN1-206ENST00000494057 EEA1Q15075 1411 aa25.31■■□□□ 1.64
NICN1-206ENST00000494057 AKNAQ7Z591 1439 aa25.3■■□□□ 1.64
NICN1-206ENST00000494057 FANCAO15360 1455 aa25.3■■□□□ 1.64
NICN1-206ENST00000494057 RICTORQ6R327 1708 aa25.3■■□□□ 1.64
NICN1-206ENST00000494057 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
NICN1-206ENST00000494057 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
NICN1-206ENST00000494057 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NICN1-206ENST00000494057 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.25■■□□□ 1.63
NICN1-206ENST00000494057 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.25■■□□□ 1.63
NICN1-206ENST00000494057 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.24■■□□□ 1.63
NICN1-206ENST00000494057 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.22■■□□□ 1.63
NICN1-206ENST00000494057 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.21■■□□□ 1.63
NICN1-206ENST00000494057 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.2■■□□□ 1.62
NICN1-206ENST00000494057 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.17■■□□□ 1.62
NICN1-206ENST00000494057 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
NICN1-206ENST00000494057 HECW1Q76N89 1606 aa25.12■■□□□ 1.61
NICN1-206ENST00000494057 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.12■■□□□ 1.61
NICN1-206ENST00000494057 HSPA2P54652 639 aa25.12■■□□□ 1.61
NICN1-206ENST00000494057 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.12■■□□□ 1.61
NICN1-206ENST00000494057 PLCH2O75038 1416 aa25.12■■□□□ 1.61
NICN1-206ENST00000494057 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.1■■□□□ 1.61
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