RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493468.6

PRPF40A-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF40A, Length 1,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-211ENST00000493468 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.83■■□□□ 1.73
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PRPF40A-211ENST00000493468 DIP2BQ9P265 1576 aa25.78■■□□□ 1.72
PRPF40A-211ENST00000493468 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.74■■□□□ 1.71
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.72■■□□□ 1.71
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PRPF40A-211ENST00000493468 ABCC2Q92887 1545 aa25.41■■□□□ 1.66
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PRPF40A-211ENST00000493468 ASXL2Q76L83 1435 aa25.33■■□□□ 1.65
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PRPF40A-211ENST00000493468 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.28■■□□□ 1.64
PRPF40A-211ENST00000493468 ADGRL1O94910 1474 aa25.28■■□□□ 1.64
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PRPF40A-211ENST00000493468 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.25■■□□□ 1.63
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PRPF40A-211ENST00000493468 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.21■■□□□ 1.63
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PRPF40A-211ENST00000493468 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.03■■□□□ 1.6
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PRPF40A-211ENST00000493468 SAMD9Q5K651 1589 aa24.54■■□□□ 1.52
PRPF40A-211ENST00000493468 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.53■■□□□ 1.52
PRPF40A-211ENST00000493468 MADDQ8WXG6 1647 aa24.53■■□□□ 1.52
PRPF40A-211ENST00000493468 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.49■■□□□ 1.51
PRPF40A-211ENST00000493468 RAPGEF3O95398 923 aa24.48■■□□□ 1.51
PRPF40A-211ENST00000493468 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.48■■□□□ 1.51
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PRPF40A-211ENST00000493468 RICTORQ6R327 1708 aa24.44■■□□□ 1.5
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PRPF40A-211ENST00000493468 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.41■■□□□ 1.5
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PRPF40A-211ENST00000493468 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.36■■□□□ 1.49
PRPF40A-211ENST00000493468 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.36■■□□□ 1.49
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PRPF40A-211ENST00000493468 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PRPF40A-211ENST00000493468 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.31■■□□□ 1.48
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PRPF40A-211ENST00000493468 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.28■■□□□ 1.48
PRPF40A-211ENST00000493468 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.28■■□□□ 1.48
PRPF40A-211ENST00000493468 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.488e-8■■□□□ 12
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PRPF40A-211ENST00000493468 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.25■■□□□ 1.47
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PRPF40A-211ENST00000493468 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.24■■□□□ 1.47
PRPF40A-211ENST00000493468 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.21■■□□□ 1.47
PRPF40A-211ENST00000493468 HSPA2P54652 639 aa24.2■■□□□ 1.46
PRPF40A-211ENST00000493468 HECW1Q76N89 1606 aa24.2■■□□□ 1.46
PRPF40A-211ENST00000493468 EEA1Q15075 1411 aa24.17■■□□□ 1.46
PRPF40A-211ENST00000493468 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.16■■□□□ 1.46
PRPF40A-211ENST00000493468 CERKQ8TCT0 537 aa24.15■■□□□ 1.46
PRPF40A-211ENST00000493468 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.15■■□□□ 1.46
PRPF40A-211ENST00000493468 PLCH2O75038 1416 aa24.1■■□□□ 1.45
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