RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490697.1

HDLBP-244, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-244ENST00000490697 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.56■■■□□ 2.48
HDLBP-244ENST00000490697 CUL7Q14999 1698 aa30.55■■■□□ 2.48
HDLBP-244ENST00000490697 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.52■■■□□ 2.48
HDLBP-244ENST00000490697 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.52■■■□□ 2.48
HDLBP-244ENST00000490697 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.28■■■□□ 2.44
HDLBP-244ENST00000490697 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.27■■■□□ 2.44
HDLBP-244ENST00000490697 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.22■■■□□ 2.43
HDLBP-244ENST00000490697 PTPRGP23470 1445 aa30.22■■■□□ 2.43
HDLBP-244ENST00000490697 IQGAP2Q13576 1575 aa30.19■■■□□ 2.42
HDLBP-244ENST00000490697 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.18■■■□□ 2.42
HDLBP-244ENST00000490697 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.12■■■□□ 2.41
HDLBP-244ENST00000490697 MAPKBP1O60336 1514 aa30.09■■■□□ 2.41
HDLBP-244ENST00000490697 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
HDLBP-244ENST00000490697 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.07■■■□□ 2.4
HDLBP-244ENST00000490697 DISP1Q96F81 1524 aa30.06■■■□□ 2.4
HDLBP-244ENST00000490697 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.06■■■□□ 2.4
HDLBP-244ENST00000490697 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.06■■■□□ 2.4
HDLBP-244ENST00000490697 PRXQ9BXM0 1461 aa30.06■■■□□ 2.4
HDLBP-244ENST00000490697 UACAQ9BZF9 1416 aa29.97■■■□□ 2.39
HDLBP-244ENST00000490697 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.97■■■□□ 2.39
HDLBP-244ENST00000490697 ABCC2Q92887 1545 aa29.96■■■□□ 2.39
HDLBP-244ENST00000490697 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.96■■■□□ 2.39
HDLBP-244ENST00000490697 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.95■■■□□ 2.39
HDLBP-244ENST00000490697 DIP2BQ9P265 1576 aa29.9■■■□□ 2.38
HDLBP-244ENST00000490697 KIAA0556O60303 1618 aa29.89■■■□□ 2.38
HDLBP-244ENST00000490697 GOLGA3Q08378 1498 aa29.87■■■□□ 2.37
HDLBP-244ENST00000490697 EEA1Q15075 1411 aa29.86■■■□□ 2.37
HDLBP-244ENST00000490697 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.85■■■□□ 2.37
HDLBP-244ENST00000490697 ASXL2Q76L83 1435 aa29.84■■■□□ 2.37
HDLBP-244ENST00000490697 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.82■■■□□ 2.36
HDLBP-244ENST00000490697 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.81■■■□□ 2.36
HDLBP-244ENST00000490697 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
HDLBP-244ENST00000490697 GLI2P10070 1586 aa29.7■■■□□ 2.35
HDLBP-244ENST00000490697 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.65■■■□□ 2.34
HDLBP-244ENST00000490697 P3H3Q8IVL6 736 aa29.65■■■□□ 2.34
HDLBP-244ENST00000490697 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
HDLBP-244ENST00000490697 ABCA8O94911 1581 aa29.64■■■□□ 2.34
HDLBP-244ENST00000490697 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
HDLBP-244ENST00000490697 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
HDLBP-244ENST00000490697 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.58■■■□□ 2.33
HDLBP-244ENST00000490697 TSPOAP1O95153 1857 aa29.56■■■□□ 2.32
HDLBP-244ENST00000490697 KDM6BO15054 1643 aa29.56■■■□□ 2.32
HDLBP-244ENST00000490697 SAMD9Q5K651 1589 aa29.52■■■□□ 2.32
HDLBP-244ENST00000490697 KCNH8Q96L42 1107 aa29.49■■■□□ 2.31
HDLBP-244ENST00000490697 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
HDLBP-244ENST00000490697 KIF21BO75037 1637 aa29.48■■■□□ 2.31
HDLBP-244ENST00000490697 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.47■■■□□ 2.31
HDLBP-244ENST00000490697 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.47■■■□□ 2.31
HDLBP-244ENST00000490697 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
HDLBP-244ENST00000490697 ATP10BO94823 1461 aa29.46■■■□□ 2.31
HDLBP-244ENST00000490697 ARID3CA6NKF2 412 aa29.43■■■□□ 2.3
HDLBP-244ENST00000490697 CD109Q6YHK3 1445 aa29.41■■■□□ 2.3
HDLBP-244ENST00000490697 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.38■■■□□ 2.29
HDLBP-244ENST00000490697 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
HDLBP-244ENST00000490697 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
HDLBP-244ENST00000490697 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.36■■■□□ 2.29
HDLBP-244ENST00000490697 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.34■■■□□ 2.29
HDLBP-244ENST00000490697 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.33■■■□□ 2.29
HDLBP-244ENST00000490697 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
HDLBP-244ENST00000490697 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
HDLBP-244ENST00000490697 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
HDLBP-244ENST00000490697 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.3■■■□□ 2.28
HDLBP-244ENST00000490697 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.29■■■□□ 2.28
HDLBP-244ENST00000490697 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.27■■■□□ 2.28
HDLBP-244ENST00000490697 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.22■■■□□ 2.27
HDLBP-244ENST00000490697 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.18■■■□□ 2.26
HDLBP-244ENST00000490697 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.16■■■□□ 2.26
HDLBP-244ENST00000490697 FMN1Q68DA7 1419 aa29.13■■■□□ 2.25
HDLBP-244ENST00000490697 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.13■■■□□ 2.25
HDLBP-244ENST00000490697 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.13■■■□□ 2.25
HDLBP-244ENST00000490697 NEO1Q92859 1461 aa29.06■■■□□ 2.24
HDLBP-244ENST00000490697 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
HDLBP-244ENST00000490697 ADGRL1O94910 1474 aa29.03■■■□□ 2.24
HDLBP-244ENST00000490697 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
HDLBP-244ENST00000490697 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
HDLBP-244ENST00000490697 RAPGEF3O95398 923 aa28.98■■■□□ 2.23
HDLBP-244ENST00000490697 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.95■■■□□ 2.233e-6■■■■■ 29.2
HDLBP-244ENST00000490697 HECW1Q76N89 1606 aa28.94■■■□□ 2.22
HDLBP-244ENST00000490697 AKNAQ7Z591 1439 aa28.91■■■□□ 2.22
HDLBP-244ENST00000490697 FANCAO15360 1455 aa28.89■■■□□ 2.22
HDLBP-244ENST00000490697 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
HDLBP-244ENST00000490697 PLCH2O75038 1416 aa28.86■■■□□ 2.21
HDLBP-244ENST00000490697 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.85■■■□□ 2.21
HDLBP-244ENST00000490697 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.85■■■□□ 2.21
HDLBP-244ENST00000490697 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
HDLBP-244ENST00000490697 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.8■■■□□ 2.2
HDLBP-244ENST00000490697 CLIP1P30622 1438 aa28.8■■■□□ 2.2
HDLBP-244ENST00000490697 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.79■■■□□ 2.2
HDLBP-244ENST00000490697 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.79■■■□□ 2.2
HDLBP-244ENST00000490697 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.75■■■□□ 2.19
HDLBP-244ENST00000490697 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.72■■■□□ 2.19
HDLBP-244ENST00000490697 KIF14Q15058 1648 aa28.7■■■□□ 2.19
HDLBP-244ENST00000490697 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
HDLBP-244ENST00000490697 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.69■■■□□ 2.18
HDLBP-244ENST00000490697 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
HDLBP-244ENST00000490697 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.68■■■□□ 2.18
HDLBP-244ENST00000490697 RICTORQ6R327 1708 aa28.68■■■□□ 2.18
HDLBP-244ENST00000490697 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.66■■■□□ 2.18
HDLBP-244ENST00000490697 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.66■■■□□ 2.18
HDLBP-244ENST00000490697 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.65■■■□□ 2.18
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