RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.04■■■□□ 2.4
TOP3B-217ENST00000489581 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
TOP3B-217ENST00000489581 IGF1RP08069 1367 aa29.92■■■□□ 2.38
TOP3B-217ENST00000489581 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.92■■■□□ 2.38
TOP3B-217ENST00000489581 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.88■■■□□ 2.37
TOP3B-217ENST00000489581 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.87■■■□□ 2.37
TOP3B-217ENST00000489581 KIF27Q86VH2 1401 aa29.87■■■□□ 2.37
TOP3B-217ENST00000489581 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.86■■■□□ 2.37
TOP3B-217ENST00000489581 CUL7Q14999 1698 aa29.84■■■□□ 2.37
TOP3B-217ENST00000489581 MAPKBP1O60336 1514 aa29.83■■■□□ 2.37
TOP3B-217ENST00000489581 DIP2BQ9P265 1576 aa29.79■■■□□ 2.36
TOP3B-217ENST00000489581 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.72■■■□□ 2.35
TOP3B-217ENST00000489581 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
TOP3B-217ENST00000489581 TSPOAP1O95153 1857 aa29.71■■■□□ 2.35
TOP3B-217ENST00000489581 PTPRGP23470 1445 aa29.68■■■□□ 2.34
TOP3B-217ENST00000489581 KDM6BO15054 1643 aa29.61■■■□□ 2.33
TOP3B-217ENST00000489581 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.6■■■□□ 2.33
TOP3B-217ENST00000489581 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.59■■■□□ 2.33
TOP3B-217ENST00000489581 IQGAP2Q13576 1575 aa29.56■■■□□ 2.32
TOP3B-217ENST00000489581 ABCC2Q92887 1545 aa29.53■■■□□ 2.32
TOP3B-217ENST00000489581 ASXL2Q76L83 1435 aa29.47■■■□□ 2.31
TOP3B-217ENST00000489581 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.47■■■□□ 2.31
TOP3B-217ENST00000489581 DISP1Q96F81 1524 aa29.45■■■□□ 2.3
TOP3B-217ENST00000489581 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.44■■■□□ 2.3
TOP3B-217ENST00000489581 UACAQ9BZF9 1416 aa29.43■■■□□ 2.3
TOP3B-217ENST00000489581 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.42■■■□□ 2.3
TOP3B-217ENST00000489581 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.4■■■□□ 2.3
TOP3B-217ENST00000489581 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
TOP3B-217ENST00000489581 GLI2P10070 1586 aa29.39■■■□□ 2.29
TOP3B-217ENST00000489581 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.35■■■□□ 2.29
TOP3B-217ENST00000489581 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.31■■■□□ 2.28
TOP3B-217ENST00000489581 KIAA0556O60303 1618 aa29.29■■■□□ 2.28
TOP3B-217ENST00000489581 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
TOP3B-217ENST00000489581 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
TOP3B-217ENST00000489581 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.23■■■□□ 2.27
TOP3B-217ENST00000489581 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
TOP3B-217ENST00000489581 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.19■■■□□ 2.26
TOP3B-217ENST00000489581 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.17■■■□□ 2.26
TOP3B-217ENST00000489581 ADGRL1O94910 1474 aa29.14■■■□□ 2.26
TOP3B-217ENST00000489581 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.12■■■□□ 2.25
TOP3B-217ENST00000489581 GOLGA3Q08378 1498 aa29.09■■■□□ 2.25
TOP3B-217ENST00000489581 KCNH8Q96L42 1107 aa29.06■■■□□ 2.24
TOP3B-217ENST00000489581 ABCA8O94911 1581 aa29.05■■■□□ 2.24
TOP3B-217ENST00000489581 PRXQ9BXM0 1461 aa29.01■■■□□ 2.23
TOP3B-217ENST00000489581 CD109Q6YHK3 1445 aa29.01■■■□□ 2.23
TOP3B-217ENST00000489581 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.99■■■□□ 2.23
TOP3B-217ENST00000489581 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.95■■■□□ 2.23
TOP3B-217ENST00000489581 ARID3CA6NKF2 412 aa28.92■■■□□ 2.22
TOP3B-217ENST00000489581 P3H3Q8IVL6 736 aa28.92■■■□□ 2.22
TOP3B-217ENST00000489581 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
TOP3B-217ENST00000489581 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
TOP3B-217ENST00000489581 ATP10BO94823 1461 aa28.83■■■□□ 2.21
TOP3B-217ENST00000489581 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.83■■■□□ 2.21
TOP3B-217ENST00000489581 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.77■■■□□ 2.2
TOP3B-217ENST00000489581 KIF21BO75037 1637 aa28.76■■■□□ 2.2
TOP3B-217ENST00000489581 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.74■■■□□ 2.19
TOP3B-217ENST00000489581 SAMD9Q5K651 1589 aa28.72■■■□□ 2.19
TOP3B-217ENST00000489581 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.71■■■□□ 2.19
TOP3B-217ENST00000489581 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.7■■■□□ 2.19
TOP3B-217ENST00000489581 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
TOP3B-217ENST00000489581 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
TOP3B-217ENST00000489581 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
TOP3B-217ENST00000489581 RAPGEF3O95398 923 aa28.64■■■□□ 2.18
TOP3B-217ENST00000489581 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.63■■■□□ 2.17
TOP3B-217ENST00000489581 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
TOP3B-217ENST00000489581 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.57■■■□□ 2.16
TOP3B-217ENST00000489581 NEO1Q92859 1461 aa28.57■■■□□ 2.16
TOP3B-217ENST00000489581 EEA1Q15075 1411 aa28.53■■■□□ 2.16
TOP3B-217ENST00000489581 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.52■■■□□ 2.16
TOP3B-217ENST00000489581 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.5■■■□□ 2.15
TOP3B-217ENST00000489581 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.5■■■□□ 2.15
TOP3B-217ENST00000489581 PTPRMP28827 1452 aa28.49■■■□□ 2.15
TOP3B-217ENST00000489581 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
TOP3B-217ENST00000489581 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.45■■■□□ 2.14
TOP3B-217ENST00000489581 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
TOP3B-217ENST00000489581 MADDQ8WXG6 1647 aa28.4■■■□□ 2.14
TOP3B-217ENST00000489581 RICTORQ6R327 1708 aa28.39■■■□□ 2.14
TOP3B-217ENST00000489581 AKNAQ7Z591 1439 aa28.39■■■□□ 2.14
TOP3B-217ENST00000489581 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.13
TOP3B-217ENST00000489581 FANCAO15360 1455 aa28.37■■■□□ 2.13
TOP3B-217ENST00000489581 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.36■■■□□ 2.13
TOP3B-217ENST00000489581 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.35■■■□□ 2.13
TOP3B-217ENST00000489581 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.33■■■□□ 2.13
TOP3B-217ENST00000489581 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.33■■■□□ 2.13
TOP3B-217ENST00000489581 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.31■■■□□ 2.12
TOP3B-217ENST00000489581 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
TOP3B-217ENST00000489581 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
TOP3B-217ENST00000489581 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TOP3B-217ENST00000489581 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.25■■■□□ 2.11
TOP3B-217ENST00000489581 FBXO41Q8TF61 875 aa28.25■■■□□ 2.11
TOP3B-217ENST00000489581 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
TOP3B-217ENST00000489581 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.24■■■□□ 2.11
TOP3B-217ENST00000489581 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.24■■■□□ 2.11
TOP3B-217ENST00000489581 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.23■■■□□ 2.11
TOP3B-217ENST00000489581 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
TOP3B-217ENST00000489581 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.23■■■□□ 2.11
TOP3B-217ENST00000489581 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.23■■■□□ 2.11
TOP3B-217ENST00000489581 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.22■■■□□ 2.11
TOP3B-217ENST00000489581 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.21■■■□□ 2.11
TOP3B-217ENST00000489581 PLCH2O75038 1416 aa28.19■■■□□ 2.1
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