RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488620.5

RGS3-223, Transcript of regulator of G protein signaling 3, human

TSL 1 (best)

Gene RGS3, Length 1,725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RGS3-223	ENST00000488620	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.46	■■■□□ 2.31
RGS3-223	ENST00000488620	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	29.42	■■■□□ 2.3
RGS3-223	ENST00000488620	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29.42	■■■□□ 2.3
RGS3-223	ENST00000488620	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	29.4	■■■□□ 2.3
RGS3-223	ENST00000488620	TIAM1	Q13009	1591 aa		29.38	■■■□□ 2.29
RGS3-223	ENST00000488620	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	29.37	■■■□□ 2.29
RGS3-223	ENST00000488620	GRIN2B	Q13224	1484 aa		29.36	■■■□□ 2.29
RGS3-223	ENST00000488620	PBRM1	Q86U86	1689 aa		29.36	■■■□□ 2.29
RGS3-223	ENST00000488620	FMN1	Q68DA7	1419 aa		29.33	■■■□□ 2.29
RGS3-223	ENST00000488620	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		29.33	■■■□□ 2.29
RGS3-223	ENST00000488620	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		29.31	■■■□□ 2.28
RGS3-223	ENST00000488620	SAMD9	Q5K651	1589 aa		29.3	■■■□□ 2.28
RGS3-223	ENST00000488620	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.29	■■■□□ 2.28
RGS3-223	ENST00000488620	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.28	■■■□□ 2.28
RGS3-223	ENST00000488620	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		29.26	■■■□□ 2.28
RGS3-223	ENST00000488620	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		29.26	■■■□□ 2.27
RGS3-223	ENST00000488620	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		29.26	■■■□□ 2.27
RGS3-223	ENST00000488620	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
RGS3-223	ENST00000488620	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
RGS3-223	ENST00000488620	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
RGS3-223	ENST00000488620	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		29.2	■■■□□ 2.26
RGS3-223	ENST00000488620	P3H3	Q8IVL6	736 aa		29.18	■■■□□ 2.26
RGS3-223	ENST00000488620	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
RGS3-223	ENST00000488620	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		29.14	■■■□□ 2.26
RGS3-223	ENST00000488620	IQGAP2	Q13576	1575 aa		29.12	■■■□□ 2.25
RGS3-223	ENST00000488620	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		29.08	■■■□□ 2.25
RGS3-223	ENST00000488620	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
RGS3-223	ENST00000488620	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
RGS3-223	ENST00000488620	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		29.04	■■■□□ 2.24
RGS3-223	ENST00000488620	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		29.03	■■■□□ 2.24
RGS3-223	ENST00000488620	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	29.03	■■■□□ 2.24
RGS3-223	ENST00000488620	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RGS3-223	ENST00000488620	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RGS3-223	ENST00000488620	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
RGS3-223	ENST00000488620	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.95	■■■□□ 2.22
RGS3-223	ENST00000488620	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RGS3-223	ENST00000488620	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.89	■■■□□ 2.22
RGS3-223	ENST00000488620	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RGS3-223	ENST00000488620	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RGS3-223	ENST00000488620	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
RGS3-223	ENST00000488620	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RGS3-223	ENST00000488620	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
RGS3-223	ENST00000488620	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RGS3-223	ENST00000488620	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RGS3-223	ENST00000488620	NUP160	Q12769	1436 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RGS3-223	ENST00000488620	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RGS3-223	ENST00000488620	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
RGS3-223	ENST00000488620	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RGS3-223	ENST00000488620	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
RGS3-223	ENST00000488620	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RGS3-223	ENST00000488620	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RGS3-223	ENST00000488620	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
RGS3-223	ENST00000488620	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		28.73	■■■□□ 2.19
RGS3-223	ENST00000488620	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.72	■■■□□ 2.19
RGS3-223	ENST00000488620	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		28.7	■■■□□ 2.18
RGS3-223	ENST00000488620	ITGAE	P38570	1179 aa		28.68	■■■□□ 2.18
RGS3-223	ENST00000488620	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		28.66	■■■□□ 2.18
RGS3-223	ENST00000488620	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.64	■■■□□ 2.17
RGS3-223	ENST00000488620	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RGS3-223	ENST00000488620	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RGS3-223	ENST00000488620	MIA2	Q96PC5	1412 aa		28.59	■■■□□ 2.17
RGS3-223	ENST00000488620	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
RGS3-223	ENST00000488620	JPH4	Q96JJ6	628 aa		28.58	■■■□□ 2.17
RGS3-223	ENST00000488620	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
RGS3-223	ENST00000488620	FBLN2	P98095	1184 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RGS3-223	ENST00000488620	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
RGS3-223	ENST00000488620	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
RGS3-223	ENST00000488620	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
RGS3-223	ENST00000488620	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		28.53	■■■□□ 2.16
RGS3-223	ENST00000488620	HFM1	A2PYH4	1435 aa		28.51	■■■□□ 2.15
RGS3-223	ENST00000488620	MAPKBP1	O60336	1514 aa		28.45	■■■□□ 2.15
RGS3-223	ENST00000488620	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
RGS3-223	ENST00000488620	AKNA	Q7Z591	1439 aa		28.43	■■■□□ 2.14
RGS3-223	ENST00000488620	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.42	■■■□□ 2.14
RGS3-223	ENST00000488620	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		28.42	■■■□□ 2.14
RGS3-223	ENST00000488620	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	28.4	■■■□□ 2.14
RGS3-223	ENST00000488620	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
RGS3-223	ENST00000488620	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.38	■■■□□ 2.13
RGS3-223	ENST00000488620	NAIP	Q13075	1403 aa		28.37	■■■□□ 2.13
RGS3-223	ENST00000488620	ABCA8	O94911	1581 aa		28.37	■■■□□ 2.13
RGS3-223	ENST00000488620	UACA	Q9BZF9	1416 aa		28.34	■■■□□ 2.13
RGS3-223	ENST00000488620	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		28.32	■■■□□ 2.12
RGS3-223	ENST00000488620	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
RGS3-223	ENST00000488620	CHD1	O14646	1710 aa		28.28	■■■□□ 2.12
RGS3-223	ENST00000488620	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.27	■■■□□ 2.12
RGS3-223	ENST00000488620	ROCK1	Q13464	1354 aa		28.26	■■■□□ 2.12
RGS3-223	ENST00000488620	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.26	■■■□□ 2.11
RGS3-223	ENST00000488620	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		28.25	■■■□□ 2.11
RGS3-223	ENST00000488620	PTPRG	P23470	1445 aa		28.25	■■■□□ 2.11
RGS3-223	ENST00000488620	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.24	■■■□□ 2.11
RGS3-223	ENST00000488620	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
RGS3-223	ENST00000488620	ATP10B	O94823	1461 aa		28.21	■■■□□ 2.11
RGS3-223	ENST00000488620	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		28.21	■■■□□ 2.11
RGS3-223	ENST00000488620	DAPK1	P53355	1430 aa		28.19	■■■□□ 2.1
RGS3-223	ENST00000488620	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
RGS3-223	ENST00000488620	ABCC5	O15440	1437 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RGS3-223	ENST00000488620	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
RGS3-223	ENST00000488620	KIF14	Q15058	1648 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RGS3-223	ENST00000488620	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RGS3-223	ENST00000488620	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		28.09	■■■□□ 2.09

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