RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486660.1

STX4-209, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-209ENST00000486660 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.79■■□□□ 1.72
STX4-209ENST00000486660 JPH4Q96JJ6 628 aa25.77■■□□□ 1.72
STX4-209ENST00000486660 TOP2BQ02880 1626 aa25.77■■□□□ 1.72
STX4-209ENST00000486660 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
STX4-209ENST00000486660 MAPKBP1O60336 1514 aa25.76■■□□□ 1.71
STX4-209ENST00000486660 KDM6BO15054 1643 aa25.76■■□□□ 1.71
STX4-209ENST00000486660 TSPOAP1O95153 1857 aa25.74■■□□□ 1.71
STX4-209ENST00000486660 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.74■■□□□ 1.71
STX4-209ENST00000486660 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.72■■□□□ 1.71
STX4-209ENST00000486660 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
STX4-209ENST00000486660 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
STX4-209ENST00000486660 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.45■■□□□ 1.66
STX4-209ENST00000486660 ADGRL1O94910 1474 aa25.45■■□□□ 1.66
STX4-209ENST00000486660 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
STX4-209ENST00000486660 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
STX4-209ENST00000486660 PTPRGP23470 1445 aa25.36■■□□□ 1.65
STX4-209ENST00000486660 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.35■■□□□ 1.65
STX4-209ENST00000486660 ABCC2Q92887 1545 aa25.33■■□□□ 1.65
STX4-209ENST00000486660 ASXL2Q76L83 1435 aa25.33■■□□□ 1.65
STX4-209ENST00000486660 GLI2P10070 1586 aa25.32■■□□□ 1.64
STX4-209ENST00000486660 CUL7Q14999 1698 aa25.32■■□□□ 1.64
STX4-209ENST00000486660 IGF1RP08069 1367 aa25.31■■□□□ 1.64
STX4-209ENST00000486660 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
STX4-209ENST00000486660 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.28■■□□□ 1.64
STX4-209ENST00000486660 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.24■■□□□ 1.63
STX4-209ENST00000486660 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.21■■□□□ 1.63
STX4-209ENST00000486660 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.2■■□□□ 1.62
STX4-209ENST00000486660 KIF27Q86VH2 1401 aa25.19■■□□□ 1.62
STX4-209ENST00000486660 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.18■■□□□ 1.62
STX4-209ENST00000486660 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
STX4-209ENST00000486660 UACAQ9BZF9 1416 aa25.14■■□□□ 1.62
STX4-209ENST00000486660 IQGAP2Q13576 1575 aa25.14■■□□□ 1.61
STX4-209ENST00000486660 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.11■■□□□ 1.61
STX4-209ENST00000486660 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
STX4-209ENST00000486660 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.1■■□□□ 1.61
STX4-209ENST00000486660 DISP1Q96F81 1524 aa25.09■■□□□ 1.61
STX4-209ENST00000486660 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.09■■□□□ 1.61
STX4-209ENST00000486660 FBXO41Q8TF61 875 aa24.95■■□□□ 1.58
STX4-209ENST00000486660 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.95■■□□□ 1.58
STX4-209ENST00000486660 KIAA0556O60303 1618 aa24.94■■□□□ 1.58
STX4-209ENST00000486660 KIF21BO75037 1637 aa24.94■■□□□ 1.58
STX4-209ENST00000486660 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.93■■□□□ 1.58
STX4-209ENST00000486660 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.89■■□□□ 1.58
STX4-209ENST00000486660 CD109Q6YHK3 1445 aa24.87■■□□□ 1.57
STX4-209ENST00000486660 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.86■■□□□ 1.57
STX4-209ENST00000486660 KCNH8Q96L42 1107 aa24.83■■□□□ 1.57
STX4-209ENST00000486660 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.8■■□□□ 1.56
STX4-209ENST00000486660 ABCA8O94911 1581 aa24.75■■□□□ 1.55
STX4-209ENST00000486660 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.74■■□□□ 1.55
STX4-209ENST00000486660 PTPRMP28827 1452 aa24.73■■□□□ 1.55
STX4-209ENST00000486660 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.72■■□□□ 1.55
STX4-209ENST00000486660 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.71■■□□□ 1.55
STX4-209ENST00000486660 GOLGA3Q08378 1498 aa24.63■■□□□ 1.53
STX4-209ENST00000486660 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
STX4-209ENST00000486660 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.62■■□□□ 1.53
STX4-209ENST00000486660 MADDQ8WXG6 1647 aa24.61■■□□□ 1.53
STX4-209ENST00000486660 ARID3CA6NKF2 412 aa24.61■■□□□ 1.53
STX4-209ENST00000486660 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.6■■□□□ 1.53
STX4-209ENST00000486660 RAPGEF3O95398 923 aa24.58■■□□□ 1.53
STX4-209ENST00000486660 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.57■■□□□ 1.52
STX4-209ENST00000486660 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.54■■□□□ 1.52
STX4-209ENST00000486660 ATP10BO94823 1461 aa24.53■■□□□ 1.52
STX4-209ENST00000486660 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
STX4-209ENST00000486660 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
STX4-209ENST00000486660 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.5■■□□□ 1.51
STX4-209ENST00000486660 HSPA2P54652 639 aa24.47■■□□□ 1.51
STX4-209ENST00000486660 NEO1Q92859 1461 aa24.46■■□□□ 1.51
STX4-209ENST00000486660 P3H3Q8IVL6 736 aa24.45■■□□□ 1.5
STX4-209ENST00000486660 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.42■■□□□ 1.5
STX4-209ENST00000486660 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.4■■□□□ 1.5
STX4-209ENST00000486660 CERKQ8TCT0 537 aa24.37■■□□□ 1.49
STX4-209ENST00000486660 RICTORQ6R327 1708 aa24.37■■□□□ 1.49
STX4-209ENST00000486660 PRXQ9BXM0 1461 aa24.37■■□□□ 1.49
STX4-209ENST00000486660 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.36■■□□□ 1.49
STX4-209ENST00000486660 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.36■■□□□ 1.49
STX4-209ENST00000486660 ILDR2Q71H61 639 aa24.33■■□□□ 1.49
STX4-209ENST00000486660 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
STX4-209ENST00000486660 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
STX4-209ENST00000486660 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
STX4-209ENST00000486660 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
STX4-209ENST00000486660 SAMD9Q5K651 1589 aa24.29■■□□□ 1.48
STX4-209ENST00000486660 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.28■■□□□ 1.48
STX4-209ENST00000486660 FANCAO15360 1455 aa24.26■■□□□ 1.47
STX4-209ENST00000486660 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.26■■□□□ 1.47
STX4-209ENST00000486660 AKNAQ7Z591 1439 aa24.26■■□□□ 1.47
STX4-209ENST00000486660 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
STX4-209ENST00000486660 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.25■■□□□ 1.47
STX4-209ENST00000486660 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.24■■□□□ 1.47
STX4-209ENST00000486660 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.24■■□□□ 1.47
STX4-209ENST00000486660 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.23■■□□□ 1.47
STX4-209ENST00000486660 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.22■■□□□ 1.47
STX4-209ENST00000486660 SOCS7O14512 581 aa24.22■■□□□ 1.47
STX4-209ENST00000486660 MLECQ14165 292 aa24.22■■□□□ 1.47
STX4-209ENST00000486660 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.21■■□□□ 1.47
STX4-209ENST00000486660 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.2■■□□□ 1.47
STX4-209ENST00000486660 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.19■■□□□ 1.46
STX4-209ENST00000486660 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
STX4-209ENST00000486660 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.17■■□□□ 1.46
STX4-209ENST00000486660 HECW1Q76N89 1606 aa24.16■■□□□ 1.46
STX4-209ENST00000486660 STRCQ7RTU9 1775 aa24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms