RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-211ENST00000486441 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.48■■□□□ 1.67
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SDCCAG3-211ENST00000486441 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.38■■□□□ 1.65
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SDCCAG3-211ENST00000486441 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.37■■□□□ 1.65
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SDCCAG3-211ENST00000486441 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-211ENST00000486441 ASXL2Q76L83 1435 aa25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-211ENST00000486441 DISP1Q96F81 1524 aa25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-211ENST00000486441 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.03■■□□□ 1.6
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SDCCAG3-211ENST00000486441 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.01■■□□□ 1.59
SDCCAG3-211ENST00000486441 GLI2P10070 1586 aa25.01■■□□□ 1.59
SDCCAG3-211ENST00000486441 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
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SDCCAG3-211ENST00000486441 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SDCCAG3-211ENST00000486441 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.94■■□□□ 1.58
SDCCAG3-211ENST00000486441 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.92■■□□□ 1.58
SDCCAG3-211ENST00000486441 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SDCCAG3-211ENST00000486441 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.9■■□□□ 1.58
SDCCAG3-211ENST00000486441 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.83■■□□□ 1.56
SDCCAG3-211ENST00000486441 KIAA0556O60303 1618 aa24.82■■□□□ 1.56
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SDCCAG3-211ENST00000486441 ADGRL1O94910 1474 aa24.79■■□□□ 1.56
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SDCCAG3-211ENST00000486441 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.71■■□□□ 1.55
SDCCAG3-211ENST00000486441 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SDCCAG3-211ENST00000486441 ABCA8O94911 1581 aa24.67■■□□□ 1.54
SDCCAG3-211ENST00000486441 PRXQ9BXM0 1461 aa24.65■■□□□ 1.54
SDCCAG3-211ENST00000486441 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.63■■□□□ 1.53
SDCCAG3-211ENST00000486441 KCNH8Q96L42 1107 aa24.63■■□□□ 1.53
SDCCAG3-211ENST00000486441 CD109Q6YHK3 1445 aa24.62■■□□□ 1.53
SDCCAG3-211ENST00000486441 GOLGA3Q08378 1498 aa24.6■■□□□ 1.53
SDCCAG3-211ENST00000486441 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.59■■□□□ 1.53
SDCCAG3-211ENST00000486441 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.54■■□□□ 1.52
SDCCAG3-211ENST00000486441 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.52■■□□□ 1.52
SDCCAG3-211ENST00000486441 ATP10BO94823 1461 aa24.51■■□□□ 1.51
SDCCAG3-211ENST00000486441 P3H3Q8IVL6 736 aa24.48■■□□□ 1.51
SDCCAG3-211ENST00000486441 ARID3CA6NKF2 412 aa24.47■■□□□ 1.51
SDCCAG3-211ENST00000486441 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.46■■□□□ 1.51
SDCCAG3-211ENST00000486441 KIF21BO75037 1637 aa24.37■■□□□ 1.49
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SDCCAG3-211ENST00000486441 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.35■■□□□ 1.49
SDCCAG3-211ENST00000486441 RAPGEF3O95398 923 aa24.35■■□□□ 1.49
SDCCAG3-211ENST00000486441 SAMD9Q5K651 1589 aa24.34■■□□□ 1.49
SDCCAG3-211ENST00000486441 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.34■■□□□ 1.49
SDCCAG3-211ENST00000486441 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SDCCAG3-211ENST00000486441 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.27■■□□□ 1.48
SDCCAG3-211ENST00000486441 NEO1Q92859 1461 aa24.26■■□□□ 1.47
SDCCAG3-211ENST00000486441 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.26■■□□□ 1.47
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SDCCAG3-211ENST00000486441 PTPRMP28827 1452 aa24.25■■□□□ 1.47
SDCCAG3-211ENST00000486441 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.24■■□□□ 1.47
SDCCAG3-211ENST00000486441 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.19■■□□□ 1.46
SDCCAG3-211ENST00000486441 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SDCCAG3-211ENST00000486441 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SDCCAG3-211ENST00000486441 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SDCCAG3-211ENST00000486441 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.14■■□□□ 1.45
SDCCAG3-211ENST00000486441 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.13■■□□□ 1.45
SDCCAG3-211ENST00000486441 AKNAQ7Z591 1439 aa24.11■■□□□ 1.45
SDCCAG3-211ENST00000486441 FBXO41Q8TF61 875 aa24.1■■□□□ 1.45
SDCCAG3-211ENST00000486441 MADDQ8WXG6 1647 aa24.1■■□□□ 1.45
SDCCAG3-211ENST00000486441 EEA1Q15075 1411 aa24.1■■□□□ 1.45
SDCCAG3-211ENST00000486441 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SDCCAG3-211ENST00000486441 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SDCCAG3-211ENST00000486441 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
SDCCAG3-211ENST00000486441 RICTORQ6R327 1708 aa24.07■■□□□ 1.44
SDCCAG3-211ENST00000486441 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.07■■□□□ 1.44
SDCCAG3-211ENST00000486441 FANCAO15360 1455 aa24.05■■□□□ 1.44
SDCCAG3-211ENST00000486441 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.05■■□□□ 1.44
SDCCAG3-211ENST00000486441 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SDCCAG3-211ENST00000486441 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.02■■□□□ 1.44
SDCCAG3-211ENST00000486441 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.02■■□□□ 1.44
SDCCAG3-211ENST00000486441 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.01■■□□□ 1.43
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.99■■□□□ 1.43
SDCCAG3-211ENST00000486441 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.98■■□□□ 1.43
SDCCAG3-211ENST00000486441 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
SDCCAG3-211ENST00000486441 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
SDCCAG3-211ENST00000486441 PLCH2O75038 1416 aa23.95■■□□□ 1.42
SDCCAG3-211ENST00000486441 HSPA2P54652 639 aa23.95■■□□□ 1.42
SDCCAG3-211ENST00000486441 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.93■■□□□ 1.42
SDCCAG3-211ENST00000486441 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.93■■□□□ 1.42
SDCCAG3-211ENST00000486441 HECW1Q76N89 1606 aa23.92■■□□□ 1.42
SDCCAG3-211ENST00000486441 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.91■■□□□ 1.42
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.91■■□□□ 1.42
SDCCAG3-211ENST00000486441 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.89■■□□□ 1.41
SDCCAG3-211ENST00000486441 MLECQ14165 292 aa23.87■■□□□ 1.41
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