RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483973.5

TRAPPC10-210, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC10, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-210ENST00000483973 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC10-210ENST00000483973 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-210ENST00000483973 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-210ENST00000483973 MAPKBP1O60336 1514 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-210ENST00000483973 TSPOAP1O95153 1857 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-210ENST00000483973 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-210ENST00000483973 DIP2BQ9P265 1576 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC10-210ENST00000483973 CUL7Q14999 1698 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC10-210ENST00000483973 KIF27Q86VH2 1401 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC10-210ENST00000483973 IGF1RP08069 1367 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC10-210ENST00000483973 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC10-210ENST00000483973 KDM6BO15054 1643 aa23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC10-210ENST00000483973 PTPRGP23470 1445 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC10-210ENST00000483973 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC10-210ENST00000483973 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC10-210ENST00000483973 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC10-210ENST00000483973 IQGAP2Q13576 1575 aa23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC10-210ENST00000483973 ABCC2Q92887 1545 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC10-210ENST00000483973 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC10-210ENST00000483973 ASXL2Q76L83 1435 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC10-210ENST00000483973 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC10-210ENST00000483973 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC10-210ENST00000483973 UACAQ9BZF9 1416 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC10-210ENST00000483973 GLI2P10070 1586 aa23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC10-210ENST00000483973 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC10-210ENST00000483973 DISP1Q96F81 1524 aa23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC10-210ENST00000483973 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC10-210ENST00000483973 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC10-210ENST00000483973 KIAA0556O60303 1618 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC10-210ENST00000483973 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC10-210ENST00000483973 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC10-210ENST00000483973 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC10-210ENST00000483973 ADGRL1O94910 1474 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC10-210ENST00000483973 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC10-210ENST00000483973 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC10-210ENST00000483973 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC10-210ENST00000483973 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC10-210ENST00000483973 KCNH8Q96L42 1107 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC10-210ENST00000483973 GOLGA3Q08378 1498 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC10-210ENST00000483973 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC10-210ENST00000483973 ABCA8O94911 1581 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC10-210ENST00000483973 CD109Q6YHK3 1445 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC10-210ENST00000483973 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC10-210ENST00000483973 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC10-210ENST00000483973 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC10-210ENST00000483973 ARID3CA6NKF2 412 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC10-210ENST00000483973 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC10-210ENST00000483973 PRXQ9BXM0 1461 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC10-210ENST00000483973 P3H3Q8IVL6 736 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC10-210ENST00000483973 KIF21BO75037 1637 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC10-210ENST00000483973 ATP10BO94823 1461 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC10-210ENST00000483973 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC10-210ENST00000483973 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC10-210ENST00000483973 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC10-210ENST00000483973 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC10-210ENST00000483973 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC10-210ENST00000483973 SAMD9Q5K651 1589 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC10-210ENST00000483973 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC10-210ENST00000483973 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC10-210ENST00000483973 RAPGEF3O95398 923 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC10-210ENST00000483973 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC10-210ENST00000483973 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC10-210ENST00000483973 NEO1Q92859 1461 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC10-210ENST00000483973 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC10-210ENST00000483973 PTPRMP28827 1452 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC10-210ENST00000483973 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC10-210ENST00000483973 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC10-210ENST00000483973 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.33■■□□□ 1.16
TRAPPC10-210ENST00000483973 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC10-210ENST00000483973 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-210ENST00000483973 MADDQ8WXG6 1647 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-210ENST00000483973 RICTORQ6R327 1708 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC10-210ENST00000483973 EEA1Q15075 1411 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-210ENST00000483973 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-210ENST00000483973 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-210ENST00000483973 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC10-210ENST00000483973 AKNAQ7Z591 1439 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC10-210ENST00000483973 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-210ENST00000483973 FBXO41Q8TF61 875 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-210ENST00000483973 FANCAO15360 1455 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-210ENST00000483973 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC10-210ENST00000483973 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-210ENST00000483973 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC10-210ENST00000483973 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC10-210ENST00000483973 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-210ENST00000483973 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-210ENST00000483973 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-210ENST00000483973 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-210ENST00000483973 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-210ENST00000483973 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-210ENST00000483973 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC10-210ENST00000483973 MLECQ14165 292 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC10-210ENST00000483973 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC10-210ENST00000483973 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC10-210ENST00000483973 HSPA2P54652 639 aa22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms